RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463615.1

PDLIM4-205, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

TSL 2

Gene PDLIM4, Length 582 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-205ENST00000463615 NPEPPSP55786 919 aa23■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 LRRC55Q6ZSA7 311 aa23■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 RHPN2Q8IUC4 686 aa23■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 GJD3Q8N144 294 aa23■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 IFT122Q9HBG6 1241 aa23■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 HCSTQ9UBK5 93 aa23■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 FSD2A1L4K1 749 aa22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 FSCN2O14926 492 aa22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 MARCH6O60337 910 aa22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 TBX10O75333 385 aa22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 LYPLA2O95372 231 aa22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 FGFR4P22455 802 aa22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 CEP170P1Q96L14 293 aa22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 TLR9Q9NR96 1032 aa22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.99■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 ZNF623O75123 536 aa22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 SLITRK3O94933 977 aa22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 EYA4O95677 639 aa22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 SKIP12755 728 aa22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 PPM1AP35813 382 aa22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 PHKA2P46019 1235 aa22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 ABI1Q8IZP0 508 aa22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 RGL1Q9NZL6 768 aa22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.98■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 LINC01565O15544 149 aa22.97■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 MBTPS2O43462 519 aa22.97■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 ZP2Q05996 745 aa22.97■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 TRIM29Q14134 588 aa22.97■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.97■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.97■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.97■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 DYDC2Q96IM9 177 aa22.97■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 ZNF558Q96NG5 402 aa22.97■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 MTMR9Q96QG7 549 aa22.97■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 ASAP2O43150 1006 aa22.96■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 RAB27AP51159 221 aa22.96■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 COASYQ13057 564 aa22.96■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 CALCRLQ16602 461 aa22.96■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.96■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 KSR1Q8IVT5 923 aa22.96■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.96■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 TCP11Q8WWU5 503 aa22.96■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 IGFLR1Q9H665 355 aa22.96■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 CLEC1BQ9P126 229 aa22.96■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 CD207Q9UJ71 328 aa22.96■■□□□ 1.27
PDLIM4-205ENST00000463615 CARNS1A5YM72 827 aa22.95■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 NEMFO60524 1076 aa22.95■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 NRIP1P48552 1158 aa22.95■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 ERVFC1P60507 584 aa22.95■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.95■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 NLRP4Q96MN2 994 aa22.95■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.95■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.95■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.95■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 WNT7AO00755 349 aa22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 GPR37L1O60883 481 aa22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 GLP2RO95838 553 aa22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 COL9A1P20849 921 aa22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 POU5F1BQ06416 359 aa22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 EMC2Q15006 297 aa22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 DUSP6Q16828 381 aa22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PDLIM4-205ENST00000463615 FERMT3Q86UX7 667 aa22.94■■□□□ 1.26
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