RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-204ENST00000461653 ACRV1P26436 265 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-204ENST00000461653 RIN1Q13671 783 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-204ENST00000461653 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-204ENST00000461653 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-204ENST00000461653 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-204ENST00000461653 MAML3Q96JK9 1138 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-204ENST00000461653 MRIQ9BWK5 157 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-204ENST00000461653 CSRNP2Q9H175 543 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-204ENST00000461653 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-204ENST00000461653 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.16□□□□□ -1.42
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RABGGTB-204ENST00000461653 PLSCR1O15162 318 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-204ENST00000461653 PDGFRBP09619 1106 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-204ENST00000461653 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-204ENST00000461653 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-204ENST00000461653 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-204ENST00000461653 D2HGDHQ8N465 521 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-204ENST00000461653 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-204ENST00000461653 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-204ENST00000461653 CYP27B1O15528 508 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 SDSP20132 328 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 FLT3P36888 993 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 STAT3P40763 770 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 RHBDL3P58872 404 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 PTH1RQ03431 593 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 KLF10Q13118 480 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF174Q15697 407 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 TTC38Q5R3I4 469 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 ODR4Q5SWX8 454 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 IL17DQ8TAD2 202 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 RABGGTAQ92696 567 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 SUV39H1O43463 412 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 CYP17A1P05093 508 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 JMJD7P0C870 316 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 ANTXR2P58335 489 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 DGCR2P98153 550 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 DGKDQ16760 1214 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 C16orf92Q96LL3 132 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 FANCLQ9NW38 375 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM260Q9NX78 707 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A1W2PRX2 142 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 CAPN14A8MX76 684 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 CBX4O00257 560 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 PRC1O43663 620 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 PPFIA4O75335 1185 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 CDC45O75419 566 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF202O95125 648 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 ASMTLO95671 621 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 C1SP09871 688 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 PAX3P23760 479 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 ADCY7P51828 1080 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 BIRC2Q13490 618 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 ACAP1Q15027 740 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC136Q96JN2 1154 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
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RABGGTB-204ENST00000461653 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 ABHD18Q0P651 414 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 EPHA7Q15375 998 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 NME9Q86XW9 330 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 TERF2IPQ9NYB0 399 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 C2orf78A6NCI8 922 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 SH3BP5O60239 455 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 RFPL3O75679 317 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC9A1P19634 815 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 MCM7P33993 719 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 CFAP100Q494V2 611 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-204ENST00000461653 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.11□□□□□ -1.43
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