RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461466.5

NVL-205, Transcript of nuclear VCP-like, human

TSL 5

Gene NVL, Length 693 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NVL-205	ENST00000461466	LGI4	Q8N135	537 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	DNAI1	Q9UI46	699 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	USP18	Q9UMW8	372 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	GABRD	O14764	452 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	NRP2	O60462	931 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	B4GALT3	O60512	393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	LPL	P06858	475 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	GPR3	P46089	330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	LGALS4	P56470	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	SPIDR	Q14159	915 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	INAVA	Q3KP66	663 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	GAB3	Q8WWW8	586 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	WDR92	Q96MX6	357 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	TRIM75P	A6NK02	468 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	MT-CO1	P00395	513 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	MTHFD2	P13995	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	NRG3	P56975	720 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	SOX7	Q9BT81	388 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NVL-205	ENST00000461466	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	ARHGAP6	O43182	974 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	FSBP	O95073	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	CFB	P00751	764 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	MYBL2	P10244	700 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	CNR2	P34972	360 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	ADAM15	Q13444	863 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	NFYC	Q13952	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	SURF1	Q15526	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	USP30	Q70CQ3	517 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	GAREM2	Q75VX8	874 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	KCNK18	Q7Z418	384 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	LPP	Q93052	612 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	INVS	Q9Y283	1065 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	B4GALT4	O60513	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	INHBB	P09529	407 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	RBP3	P10745	1247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	MTNR1B	P49286	362 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	SLC5A3	P53794	718 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	EPHB4	P54760	987 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	KRT85	P78386	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NVL-205	ENST00000461466	TBR1	Q16650	682 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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