RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458666.1

LMCD1-AS1-207, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 581 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 A0A0U1RQF3 1178 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 GAS2O43903 313 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 STBD1O95210 358 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 EOMESO95936 686 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 IL9P15248 144 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 DNAJB1P25685 340 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CA8P35219 290 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PPM1AP35813 382 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TXKP42681 527 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NRIP1P48552 1158 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 GUCY1B3Q02153 619 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 KSR1Q8IVT5 923 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 C4orf19Q8IY42 314 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 GJD3Q8N144 294 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TMEM87AQ8NBN3 555 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TCP11Q8WWU5 503 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TMEM143Q96AN5 459 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 C8orf76Q96K31 380 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CASD1Q96PB1 797 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 BDP1A6H8Y1 2624 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 GBF1Q92538 1859 aa11.66□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 FSD2A1L4K1 749 aa11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SRGAP2BP0DMP2 458 aa11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 MCM7P33993 719 aa11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 IRS1P35568 1242 aa11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 RAB27AP51159 221 aa11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 EMC2Q15006 297 aa11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 LONRF3Q496Y0 759 aa11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 KCNT2Q6UVM3 1135 aa11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 GLB1LQ6UWU2 654 aa11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 FAM178BQ8IXR5 827 aa11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 HELQQ8TDG4 1101 aa11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TNFRSF25Q93038 417 aa11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CEP89Q96ST8 783 aa11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SPG21Q9NZD8 308 aa11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 HCSTQ9UBK5 93 aa11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CD207Q9UJ71 328 aa11.65□□□□□ -0.54
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PER2O15055 1255 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 LINC01565O15544 149 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ASAP2O43150 1006 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ERLIN2O94905 339 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PBX3P40426 434 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PHKA2P46019 1235 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 RBM25P49756 843 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ADAM15Q13444 863 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CAMK1Q14012 370 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TFDP1Q14186 410 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 COL19A1Q14993 1142 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CTC1Q2NKJ3 1217 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PLPP4Q5VZY2 271 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TMC7Q7Z402 723 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 EFHBQ8N7U6 833 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 RNF149Q8NC42 400 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PGBD4Q96DM1 585 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 MTRQ99707 1265 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TCF25Q9BQ70 676 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CWH43Q9H720 699 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 LZTS1Q9Y250 596 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa11.64□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CARNS1A5YM72 827 aa11.63□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ZBTB39O15060 712 aa11.63□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SLITRK3O94933 977 aa11.63□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 COL9A1P20849 921 aa11.63□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 PLCB3Q01970 1234 aa11.63□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SPIRE1Q08AE8 756 aa11.63□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 TMEM31Q5JXX7 168 aa11.63□□□□□ -0.55
LMCD1-AS1-207ENST00000458666 CLLU1OSQ5K130 101 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms