RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 SLC7A5Q01650 507 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 GRAPQ13588 217 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 MBLAC2Q68D91 279 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 WWC2Q6AWC2 1192 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
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PTPRK-211ENST00000429595 SYT3Q9BQG1 590 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.08□□□□□ -1.12
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PTPRK-211ENST00000429595 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 UBR2Q8IWV8 1755 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 C7orf72A4D263 438 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 PPM1BO75688 479 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 SGPL1O95470 568 aa8.07□□□□□ -1.12
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PTPRK-211ENST00000429595 AMPD2Q01433 879 aa8.07□□□□□ -1.12
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PTPRK-211ENST00000429595 SLC9A5Q14940 896 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 PARP10Q53GL7 1025 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
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PTPRK-211ENST00000429595 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 UNCXA6NJT0 531 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 KCNQ3O43525 872 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 C8BP07358 591 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 PAMP19021 973 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 IL13P35225 146 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 SARSP49591 514 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 GJA9P57773 515 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 SLC10A5Q5PT55 438 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 NECAB2Q7Z6G3 386 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 MORC1Q86VD1 984 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 IL17REQ8NFR9 667 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 ZBTB8AQ96BR9 441 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 DDX11Q96FC9 970 aa8.06□□□□□ -1.12
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PTPRK-211ENST00000429595 APEX2Q9UBZ4 518 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 RTL9Q8NET4 1388 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 COL6A3P12111 3177 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 NTSR2O95665 410 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 NTRK1P04629 796 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF654Q8IZM8 581 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 LINC00482Q8N8I6 264 aa8.05□□□□□ -1.12
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PTPRK-211ENST00000429595 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 PTPN18Q99952 460 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 GORASP1Q9BQQ3 440 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 POLR3GLQ9BT43 218 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 NTMQ9P121 344 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 KDM3BQ7LBC6 1761 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 FUCA1P04066 466 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 ITGB3P05106 788 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 GPSM2P81274 684 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF34Q8IZ26 560 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 PLEKHO2Q8TD55 490 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 RASGRP4Q8TDF6 673 aa8.04□□□□□ -1.12
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PTPRK-211ENST00000429595 POLLQ9UGP5 575 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 SRRDQ9UH36 339 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 FZD1Q9UP38 647 aa8.04□□□□□ -1.12
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PTPRK-211ENST00000429595 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 LAMB4A4D0S4 1761 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 WNT10BO00744 389 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 NPHS1O60500 1241 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 FOSL2P15408 326 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 GTF2A2P52657 109 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 CCL15Q16663 113 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 OR6P1Q8NGX9 317 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D16Q8TBP0 767 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 USP33Q8TEY7 942 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 COPS5Q92905 334 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 GPRASP2Q96D09 838 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 SHDQ96IW2 340 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.03□□□□□ -1.12
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