RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 TRERF1Q96PN7 1200 aa30.08■■■□□ 2.41
CERS1-201ENST00000429504 RMDN3Q96TC7 470 aa30.08■■■□□ 2.41
CERS1-201ENST00000429504 GPR88Q9GZN0 384 aa30.08■■■□□ 2.41
CERS1-201ENST00000429504 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
CERS1-201ENST00000429504 FAN1Q9Y2M0 1017 aa30.08■■■□□ 2.41
CERS1-201ENST00000429504 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa30.07■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 ZBTB7AO95365 584 aa30.07■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 SFNP31947 248 aa30.07■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 NOP2P46087 812 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 MAEAQ7L5Y9 396 aa30.07■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 TPCN2Q8NHX9 752 aa30.07■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 KIF4AO95239 1232 aa30.07■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 NPEPPSP55786 919 aa30.07■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 SLC7A5Q01650 507 aa30.07■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 PLS1Q14651 629 aa30.07■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 SYT11Q9BT88 431 aa30.07■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 VWA5AO00534 786 aa30.06■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 EPHB4P54760 987 aa30.06■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 PSMC5P62195 406 aa30.06■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 GTF2BQ00403 316 aa30.06■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 KRT76Q01546 638 aa30.06■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 XRRA1Q6P2D8 792 aa30.06■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 LMBR1Q8WVP7 490 aa30.06■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP30.06■■■□□ 2.41e-7■■■■■ 34.7
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CERS1-201ENST00000429504 DNA2P51530 1060 aa30.05■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 EMBQ6PCB8 327 aa30.05■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 SLFN11Q7Z7L1 901 aa30.05■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 MICALL2Q8IY33 904 aa30.05■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 SLC17A8Q8NDX2 589 aa30.05■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
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CERS1-201ENST00000429504 MAPK13O15264 365 aa30.05■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 P4HA2O15460 535 aa30.05■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 SYF2O95926 243 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 UGCGQ16739 394 aa30.05■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 LMO3Q8TAP4 145 aa30.05■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa30.05■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 HACL1Q9UJ83 578 aa30.05■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 CCDC66A2RUB6 948 aa30.04■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 DCAF15Q66K64 600 aa30.04■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 USP38Q8NB14 1042 aa30.04■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 RDM1Q8NG50 284 aa30.04■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 IWS1Q96ST2 819 aa30.04■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 ANKEF1Q9NU02 776 aa30.04■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 ARHGEF16Q5VV41 709 aa30.03■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 HAUS6Q7Z4H7 955 aa30.03■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 SYCE1Q8N0S2 351 aa30.03■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 RDH13Q8NBN7 331 aa30.03■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa30.03■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 TMEM59LQ9UK28 342 aa30.03■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 NCANO14594 1321 aa30.03■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 ERICH4A6NGS2 130 aa30.03■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 BACH1O14867 736 aa30.03■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 ATP9AO75110 1047 aa30.03■■■□□ 2.4
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CERS1-201ENST00000429504 NCKAP1LP55160 1127 aa30.03■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 BACE1P56817 501 aa30.03■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 CETN1Q12798 172 aa30.03■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 SAMD7Q7Z3H4 446 aa30.03■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 VTI1AQ96AJ9 217 aa30.03■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 KCNK3O14649 394 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 CCNE2O96020 404 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 GALCP54803 685 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 NSMFQ6X4W1 530 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 DNAAF5Q86Y56 855 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 GLYCTKQ8IVS8 523 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 IFT20Q8IY31 132 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 SCYL3Q8IZE3 742 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 XXYLT1Q8NBI6 393 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 CAVIN3Q969G5 261 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 ATG4CQ96DT6 458 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 CBWD1Q9BRT8 395 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 GDF3Q9NR23 364 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 ARID2Q68CP9 1835 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 EMSYQ7Z589 1322 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 KIF22Q14807 665 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 ACTRT1Q8TDG2 376 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 HINFPQ9BQA5 517 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 PCIF1Q9H4Z3 704 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 AS3MTQ9HBK9 375 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 RNF146Q9NTX7 359 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 HSPBP1Q9NZL4 362 aa30.02■■■□□ 2.4
CERS1-201ENST00000429504 TISP43B9A030 160 aa30.01■■■□□ 2.39
CERS1-201ENST00000429504 RNF40O75150 1001 aa30.01■■■□□ 2.39
CERS1-201ENST00000429504 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
CERS1-201ENST00000429504 ZNF112Q9UJU3 913 aa30.01■■■□□ 2.39
CERS1-201ENST00000429504 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
CERS1-201ENST00000429504 TMEM253P0C7T8 217 aa30■■■□□ 2.39
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