RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 DLG4P78352 724 aa25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 KLHL30Q0D2K2 578 aa25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 BFSP1Q12934 665 aa25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 WDR78Q5VTH9 848 aa25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 HSPBP1Q9NZL4 362 aa25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 AIPL1Q9NZN9 384 aa25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 MAGEA1P43355 309 aa25.33■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 SMTNP53814 917 aa25.33■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 EPC1Q9H2F5 836 aa25.33■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 MLXIPQ9HAP2 919 aa25.33■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 KMT5AQ9NQR1 393 aa25.33■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa25.33■■□□□ 1.65
FAAP20-209ENST00000428120 ATP4AP20648 1035 aa25.32■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa25.32■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 TBX20Q9UMR3 447 aa25.32■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.32■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa25.32■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 ARID2Q68CP9 1835 aa25.32■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 DENND3A2RUS2 1198 aa25.32■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA8IPA6NC78 632 aa25.32■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA8JA6NMD2 632 aa25.32■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 EFCAB8A8MWE9 144 aa25.32■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 EDNRBP24530 442 aa25.32■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF302Q9NR11 478 aa25.32■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa25.32■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa25.32■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 PCNTO95613 3336 aa25.32■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 IQCEQ6IPM2 695 aa25.31■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 EHBP1Q8NDI1 1231 aa25.31■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 KIFAP3Q92845 792 aa25.31■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 TSGA10Q9BZW7 698 aa25.31■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa25.31■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD63C9JTQ0 380 aa25.31■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 DGAT1O75907 488 aa25.31■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 PPP2R5AQ15172 486 aa25.31■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 TEX35Q5T0J7 233 aa25.31■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.31■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 KRT13P13646 458 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 PTK2Q05397 1052 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 XKR3Q5GH77 459 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 XXYLT1Q8NBI6 393 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 A0A087X0T9 212 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 FAM228BP0C875 321 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 CYP2C8P10632 490 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 ADSSP30520 456 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 AMPD2Q01433 879 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 MYL7Q01449 175 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 MYBPC2Q14324 1141 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 LY6KQ17RY6 165 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 PDLIM7Q9NR12 457 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 MOCS3O95396 460 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 SAAL1Q96ER3 474 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 SALL4Q9UJQ4 1053 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 MYO6Q9UM54 1294 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 ATG7O95352 703 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 MAP4K3Q8IVH8 894 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 MCPH1Q8NEM0 835 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 EMSYQ7Z589 1322 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 MYH10P35580 1976 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 RRP9O43818 475 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 SLC25A27O95847 323 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 OSBPP22059 807 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 VAMP7P51809 220 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 SLC18A3Q16572 532 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 C12orf56Q8IXR9 622 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 SLC17A8Q8NDX2 589 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM143Q96AN5 459 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 FGD4Q96M96 766 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 MAP7D2Q96T17 732 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-209ENST00000428120 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms