RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-208	ENST00000420964	PPP2R5A	Q15172	486 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	KCNA10	Q16322	511 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	IER5	Q5VY09	327 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	LHX8	Q68G74	356 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	METTL13	Q8N6R0	699 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	SETD4	Q9NVD3	440 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	NRCAM	Q92823	1304 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		13.58	□□□□□ -0.23
FAAP20-208	ENST00000420964		H0YCG3	227 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	HOXD13	P35453	343 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	NAMPT	P43490	491 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	DNM2	P50570	870 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	TPM4	P67936	248 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	CAPS	Q13938	189 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	UVSSA	Q2YD98	709 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	SPATA1	Q5VX52	437 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	CENPP	Q6IPU0	288 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	TTI2	Q6NXR4	508 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	C7orf31	Q8N865	590 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ARMC5	Q96C12	935 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	TSG101	Q99816	390 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	STRA6	Q9BX79	667 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	CCL5	P13501	91 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	TMOD1	P28289	359 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	HOXC8	P31273	242 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	GTF2B	Q00403	316 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	LRRC63	Q05C16	580 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	MTFR1	Q15390	333 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	KSR1	Q8IVT5	923 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	HVCN1	Q96D96	273 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	MAP7D2	Q96T17	732 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		13.57	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	DENND3	A2RUS2	1198 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	CABYR	O75952	493 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	GJB1	P08034	283 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	GNAT1	P11488	350 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	SCP2	P22307	547 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ABCD1	P33897	745 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ACLY	P53396	1101 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	KCNA1	Q09470	495 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	TFDP1	Q14186	410 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	HIC1	Q14526	733 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF333	Q96JL9	665 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ACCS	Q96QU6	501 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	RNF208	Q9H0X6	261 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	FANCL	Q9NW38	375 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	AKT3	Q9Y243	479 aa		13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		13.56	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms