RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416605.6

HACE1-204, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HACE1, Length 4,729 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-204ENST00000416605 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
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HACE1-204ENST00000416605 THEGQ9P2T0 379 aa18.26■□□□□ 0.51
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HACE1-204ENST00000416605 C12orf60Q5U649 245 aa18.26■□□□□ 0.51
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HACE1-204ENST00000416605 TRIM49CP0CI26 452 aa18.25■□□□□ 0.51
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HACE1-204ENST00000416605 EDRF1Q3B7T1 1238 aa18.24■□□□□ 0.51
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HACE1-204ENST00000416605 USP17L10C9JJH3 530 aa18.23■□□□□ 0.51
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HACE1-204ENST00000416605 ARL4CP56559 192 aa18.23■□□□□ 0.51
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HACE1-204ENST00000416605 MIS12Q9H081 205 aa18.23■□□□□ 0.51
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HACE1-204ENST00000416605 ABCB11O95342 1321 aa18.23■□□□□ 0.51
HACE1-204ENST00000416605 CRCPO75575 148 aa18.23■□□□□ 0.51
HACE1-204ENST00000416605 GDF11O95390 407 aa18.23■□□□□ 0.51
HACE1-204ENST00000416605 ARFIP2P53365 341 aa18.23■□□□□ 0.51
HACE1-204ENST00000416605 SLC12A2P55011 1212 aa18.23■□□□□ 0.51
HACE1-204ENST00000416605 TMPRSS15P98073 1019 aa18.23■□□□□ 0.51
HACE1-204ENST00000416605 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
HACE1-204ENST00000416605 SBK1Q52WX2 424 aa18.23■□□□□ 0.51
HACE1-204ENST00000416605 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
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