RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 ADAM9Q13443 819 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 ARID5BQ14865 1188 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 UGCGQ16739 394 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 ZCWPW2Q504Y3 356 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 FAM160B1Q5W0V3 765 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 CST9Q5W186 159 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 ARMCX5Q6P1M9 558 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 METTL7BQ6UX53 244 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF720Q7Z2F6 126 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 CNGA4Q8IV77 575 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 GLIS3Q8NEA6 775 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 SEPT1Q8WYJ6 367 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 KIFAP3Q92845 792 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 HPS1Q92902 700 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 IQCDQ96DY2 449 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC51Q96ER9 411 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 CEP170P1Q96L14 293 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 PORCNQ9H237 461 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 KCTD10Q9H3F6 313 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 AZI2Q9H6S1 392 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 EFCC1Q9HA90 598 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF302Q9NR11 478 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 NRBP2Q9NSY0 501 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 SLC5A4Q9NY91 659 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 KCNG1Q9UIX4 513 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 PYCARDQ9ULZ3 195 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 K7ENM7 598 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 CCP110O43303 1012 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 SORBS3O60504 671 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 ATG7O95352 703 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 GGPS1O95749 300 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 EPB41P11171 864 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 NR2F2P24468 414 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 ADORA2AP29274 412 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 NMT1P30419 496 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 KCNJ6P48051 423 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 CASP5P51878 434 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 SMTNP53814 917 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 INHBEP58166 350 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 SP2Q02086 613 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 PRKCEQ02156 737 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 MAPK7Q13164 816 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 TTLL4Q14679 1199 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 MAN2A1Q16706 1144 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 FAM110CQ1W6H9 321 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 VWA3BQ502W6 1294 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 PLA2G4FQ68DD2 849 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 LRRC55Q6ZSA7 311 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 MAEAQ7L5Y9 396 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 EEPD1Q7L9B9 569 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 PLEKHH3Q7Z736 793 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 SYCP3Q8IZU3 236 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 RETREG2Q8NC44 543 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 MCPH1Q8NEM0 835 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 MORC4Q8TE76 937 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 FAM167AQ96KS9 214 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 ACCSQ96QU6 501 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 PANX2Q96RD6 677 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 NUP58Q9BVL2 599 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM206Q9H813 350 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 C17orf75Q9HAS0 396 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 POLD4Q9HCU8 107 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 FAM184BQ9ULE4 1060 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 PPME1Q9Y570 386 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 H0YCG3 227 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF862O60290 1169 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 STX10O60499 249 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 MFAP3LO75121 409 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 NR3C1P04150 777 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDAC8-211ENST00000415409 TXNP10599 105 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms