RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYH15Q9Y2K3 1946 aa18.21■□□□□ 0.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 A0A0U1RQF3 1178 aa18.21■□□□□ 0.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 DENND3A2RUS2 1198 aa18.21■□□□□ 0.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 RB1P06400 928 aa18.21■□□□□ 0.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRPHP41219 470 aa18.21■□□□□ 0.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa18.21■□□□□ 0.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 COL19A1Q14993 1142 aa18.21■□□□□ 0.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 POTEGQ6S5H5 508 aa18.21■□□□□ 0.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 ECHDC2Q86YB7 292 aa18.21■□□□□ 0.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 ASAP3Q8TDY4 903 aa18.21■□□□□ 0.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 PIGOQ8TEQ8 1089 aa18.21■□□□□ 0.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPM1EQ8WY54 764 aa18.21■□□□□ 0.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 CHST12Q9NRB3 414 aa18.21■□□□□ 0.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 HCSTQ9UBK5 93 aa18.21■□□□□ 0.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
NME1-NME2-202ENST00000393193 DGAT1O75907 488 aa18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 MUTP22033 750 aa18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 POU5F1BQ06416 359 aa18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 GPM6BQ13491 265 aa18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 CLLU1OSQ5K130 101 aa18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 P2RX5Q93086 422 aa18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 NLRP4Q96MN2 994 aa18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 CASD1Q96PB1 797 aa18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 MTRQ99707 1265 aa18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLVAPQ9BX97 442 aa18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 CWH43Q9H720 699 aa18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 SMC3Q9UQE7 1217 aa18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 RWDD3Q9Y3V2 267 aa18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 LAD1O00515 517 aa18.19■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 GRM6O15303 877 aa18.19■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 FGFR1P11362 822 aa18.19■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 GLRA2P23416 452 aa18.19■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 CTNNB1P35222 781 aa18.19■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 PTENP60484 403 aa18.19■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 CAPSQ13938 189 aa18.19■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 PDIA5Q14554 519 aa18.19■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 AMHR2Q16671 573 aa18.19■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 RILPL1Q5EBL4 403 aa18.19■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 LRRC55Q6ZSA7 311 aa18.19■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa18.19■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 TCP11Q8WWU5 503 aa18.19■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa18.19■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 THEGQ9P2T0 379 aa18.19■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 ASAP2O43150 1006 aa18.18■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 PHKA2P46019 1235 aa18.18■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 UBXN11Q5T124 520 aa18.18■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 SCLT1Q96NL6 688 aa18.18■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 NFKBIZQ9BYH8 718 aa18.18■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMEM117Q9H0C3 514 aa18.18■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 LRFN2Q9ULH4 789 aa18.18■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLAGL2Q9UPG8 496 aa18.18■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYH11P35749 1972 aa18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 BDP1A6H8Y1 2624 aa18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 TBKBP1A7MCY6 615 aa18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF623O75123 536 aa18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 EOMESO95936 686 aa18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 ITGB1P05556 798 aa18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 DNAJB1P25685 340 aa18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 MICALL1Q8N3F8 863 aa18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 RNF149Q8NC42 400 aa18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 NACC1Q96RE7 527 aa18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 LMAN2LQ9H0V9 348 aa18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 GPRC5CQ9NQ84 441 aa18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 MEIS3P2A8K0S8 358 aa18.16■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 PP2D1A8MPX8 630 aa18.16■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 USO1O60763 962 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 MBTD1Q05BQ5 628 aa18.16■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 NAALADL2Q58DX5 795 aa18.16■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 MCTP1Q6DN14 999 aa18.16■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 SPPL3Q8TCT6 385 aa18.16■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 DACT1Q9NYF0 836 aa18.16■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 LRWD1Q9UFC0 647 aa18.16■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
NME1-NME2-202ENST00000393193 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms