RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 KCNG1Q9UIX4 513 aa17.07■□□□□ 0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa17.05■□□□□ 0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa17.03■□□□□ 0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 AXLP30530 894 aa17.02■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 SARSP49591 514 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC12A3P55017 1021 aa17.02■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM117BQ6P1L5 589 aa17.02■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 USP49Q70CQ1 688 aa17.02■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 MYLIPQ8WY64 445 aa17.02■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 YME1L1Q96TA2 773 aa17.02■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 RUSC1Q9BVN2 902 aa17.02■□□□□ 0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa17.02■□□□□ 0.32
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