RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 TC2NQ8N9U0 490 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 REEP2Q9BRK0 252 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 SOX5P35711 763 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 MTMR2Q13614 643 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 PSMD6Q15008 389 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 BBS9Q3SYG4 887 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ACSL3O95573 720 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 OATP04181 439 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 CDO1Q16878 200 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 RFX1P22670 979 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ABI1Q8IZP0 508 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 NUP85Q9BW27 656 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 CLTAP09496 248 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ARHGAP42A6NI28 874 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 TJP3O95049 919 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 PHKA2P46019 1235 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 NXNQ6DKJ4 435 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 SH3BP5O60239 455 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 EFCC1Q9HA90 598 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ESYT3A0FGR9 886 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 C6orf118Q5T5N4 469 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 HSPH1Q92598 858 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 MST1RQ04912 1400 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 VCX3BQ9H321 246 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 GRID2IPA4D2P6 1211 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 GPD1LQ8N335 351 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 OTUD5Q96G74 571 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 NBPF3Q9H094 633 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ESYT2A0FGR8 921 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 TNFAIP2Q03169 654 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ADCY2Q08462 1091 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ARMCX2Q7L311 632 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.157e-7■■■□□ 18
NISCH-201ENST00000345716 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 DCCP43146 1447 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ZNF18P17022 549 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 DNAAF3Q8N9W5 541 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 FAM151AQ8WW52 585 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 VCPKMTQ9H867 229 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ADAM21Q9UKJ8 722 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 TADA3O75528 432 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 MT-ND3P03897 115 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 PDIK1LQ8N165 341 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ZBED1O96006 694 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ECE1P42892 770 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 GPC3P51654 580 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 CENPUQ71F23 418 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 RFFLQ8WZ73 363 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 LPAR1Q92633 364 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NISCH-201ENST00000345716 CALB1P05937 261 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 TERF2Q15554 542 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 GGCXP38435 758 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.145e-6■□□□□ 8.9
NISCH-201ENST00000345716 TTLL4Q14679 1199 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 RPS6KA2Q15349 733 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 MICALL2Q8IY33 904 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 GSDMBQ8TAX9 411 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 NWD1Q149M9 1564 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 SART1O43290 800 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 PYROXD1Q8WU10 500 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 GNA15P30679 374 aa22.19■■□□□ 1.14
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