RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.35■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 PADI3Q9ULW8 664 aa22.35■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 LAMA3Q16787 3333 aa22.35■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 FGFR4P22455 802 aa22.35■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.35■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.35■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.34■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF410Q86VK4 478 aa22.34■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 TDHQ8IZJ6 230 aa22.34■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 RNF149Q8NC42 400 aa22.34■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 TMX1Q9H3N1 280 aa22.34■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.34■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 STK17AQ9UEE5 414 aa22.34■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 SFI1A8K8P3 1242 aa22.33■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 ASAP2O43150 1006 aa22.33■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 HIP1RO75146 1068 aa22.33■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 RPS6KA5O75582 802 aa22.33■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 CMA1P23946 247 aa22.33■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 GUCY2CP25092 1073 aa22.33■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 CDC42EP1Q00587 391 aa22.33■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.33■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 GPBP1Q86WP2 473 aa22.33■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.33■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 USP38Q8NB14 1042 aa22.33■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 SEPT8Q92599 483 aa22.33■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 SCLT1Q96NL6 688 aa22.33■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.33■■□□□ 1.17
RAB11B-201ENST00000328024 A0A1B0GVL5 298 aa22.33■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 STAT6P42226 847 aa22.33■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 DHX58Q96C10 678 aa22.33■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 MBD3O95983 291 aa22.32■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 PAK2Q13177 524 aa22.32■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.32■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.32■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 HPSEQ9Y251 543 aa22.32■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 MGEA5O60502 916 aa22.31■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 PFKFB1P16118 471 aa22.31■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 PTENP60484 403 aa22.31■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 IKBKEQ14164 716 aa22.31■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 STAMQ92783 540 aa22.31■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.31■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.31■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 GIT2Q14161 759 aa22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 KIFAP3Q92845 792 aa22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 APBB2Q92870 758 aa22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 REEP2Q9BRK0 252 aa22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 KCND2Q9NZV8 630 aa22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 A0A1W2PQ27 194 aa22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 A0A1W2PQ64 194 aa22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 A0A1W2PQD8 194 aa22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 MYMKA6NI61 221 aa22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 ZBBXA8MT70 800 aa22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 ACTN1P12814 892 aa22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 DEFB103AP81534 67 aa22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 POU5F1BQ06416 359 aa22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 ENPP3O14638 875 aa22.29■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 GPR182O15218 404 aa22.29■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 BAIAP3O94812 1187 aa22.29■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 NDUFA8P51970 172 aa22.29■■□□□ 1.16
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RAB11B-201ENST00000328024 SV2BQ7L1I2 683 aa22.29■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.29■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 IQUBQ8NA54 791 aa22.29■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.29■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.29■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.28■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.28■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 NAMPTP43490 491 aa22.28■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 PEX3P56589 373 aa22.28■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF445P59923 1031 aa22.28■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.28■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 DSC3Q14574 896 aa22.28■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 DYMQ7RTS9 669 aa22.28■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.28■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 TIPINQ9BVW5 301 aa22.28■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 PTPRSQ13332 1948 aa22.28■■□□□ 1.16
RAB11B-201ENST00000328024 A0A1W2PPC1 479 aa22.27■■□□□ 1.16
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