RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 A0A1B0GTH6 734 aa17.88■□□□□ 0.45
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CHTF18-202ENST00000317063 CCDC155Q8N6L0 562 aa17.86■□□□□ 0.45
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CHTF18-202ENST00000317063 SEL1LQ9UBV2 794 aa17.85■□□□□ 0.45
CHTF18-202ENST00000317063 ZBTB42B2RXF5 422 aa17.85■□□□□ 0.45
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CHTF18-202ENST00000317063 LGALS2P05162 132 aa17.85■□□□□ 0.45
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
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CHTF18-202ENST00000317063 PCIF1Q9H4Z3 704 aa17.85■□□□□ 0.45
CHTF18-202ENST00000317063 HOXC6P09630 235 aa17.84■□□□□ 0.45
CHTF18-202ENST00000317063 MAP2K2P36507 400 aa17.84■□□□□ 0.45
CHTF18-202ENST00000317063 SSR1P43307 286 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
CHTF18-202ENST00000317063 KLK7P49862 253 aa17.84■□□□□ 0.45
CHTF18-202ENST00000317063 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
CHTF18-202ENST00000317063 FILIP1LQ4L180 1135 aa17.84■□□□□ 0.45
CHTF18-202ENST00000317063 ARMCX5Q6P1M9 558 aa17.84■□□□□ 0.45
CHTF18-202ENST00000317063 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa17.84■□□□□ 0.45
CHTF18-202ENST00000317063 CTAGE1Q96RT6 745 aa17.84■□□□□ 0.45
CHTF18-202ENST00000317063 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
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