RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 C16orf59Q7L2K0 433 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 USP38Q8NB14 1042 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 STAMQ92783 540 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 REEP2Q9BRK0 252 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 SQORQ9Y6N5 450 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 LRRIQ4A6NIV6 560 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 SFI1A8K8P3 1242 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 RPS6KA5O75582 802 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 CD52P31358 61 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 PAK2Q13177 524 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 CHRDL2Q6WN34 429 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF365Q70YC5 407 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 DYMQ7RTS9 669 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 CEP57L1Q8IYX8 460 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 DAW1Q8N136 415 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 DBF4BQ8NFT6 615 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 BSNDQ8WZ55 320 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 SEPT8Q92599 483 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 IFT74Q96LB3 600 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 IFT122Q9HBG6 1241 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 FGBP02675 491 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 DARSP14868 501 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 MAPK7Q13164 816 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM87AQ8NBN3 555 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 TNMDQ9H2S6 317 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 SERTAD1Q9UHV2 236 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 MYMKA6NI61 221 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 PHKA2P46019 1235 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 GIT2Q14161 759 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 PPP2R5AQ15172 486 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM240Q5SV17 173 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 CNKSR3Q6P9H4 555 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 OTOP2Q7RTS6 562 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 DDX12PQ92771 950 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 GBP4Q96PP9 640 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 ZHX3Q9H4I2 956 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 ODF2LQ9ULJ1 636 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 PADI3Q9ULW8 664 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 ACTN1P12814 892 aa24.7■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 FGFR4P22455 802 aa24.7■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 PEX3P56589 373 aa24.7■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 LONRF3Q496Y0 759 aa24.7■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 CLEC17AQ6ZS10 378 aa24.7■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 FAM228AQ86W67 206 aa24.7■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.7■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.7■■□□□ 1.55
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC169A6NNP5 214 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 GPR182O15218 404 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 TBCAO75347 108 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 FAM13AO94988 1023 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 SLFN14P0C7P3 912 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 NAMPTP43490 491 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 PTENP60484 403 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 AMPD3Q01432 767 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 TCTN1Q2MV58 587 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 ODR4Q5SWX8 454 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 C9orf50Q5SZB4 431 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 DEPTORQ8TB45 409 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 AFMP43652 599 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 POU5F1BQ06416 359 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 IKBKEQ14164 716 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 APBB2Q92870 758 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 KIFC3Q9BVG8 833 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 MINDY3Q9H8M7 445 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 C17orf75Q9HAS0 396 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 USP25Q9UHP3 1055 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 ZBBXA8MT70 800 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF202O95125 648 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 PLS3P13797 630 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 BMP8BP34820 402 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 SHHQ15465 462 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 MYCT1Q8N699 235 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 PARVGQ9HBI0 331 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
HOXD4-201ENST00000306324 IDEP14735 1019 aa24.67■■□□□ 1.54
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