RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295645.8

PDCL2-201, Transcript of phosducin like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL2, Length 861 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2-201ENST00000295645 MFSD5Q6N075 450 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 OXSMQ9NWU1 459 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 SUV39H1O43463 412 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 FSBPO95073 299 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF202O95125 648 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 CD40P25942 277 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 MYBPC3Q14896 1274 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 AHI1Q8N157 1196 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 EFHBQ8N7U6 833 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 APPBP2Q92624 585 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 GPHA2Q96T91 129 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 TCF25Q9BQ70 676 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 TOMM22Q9NS69 142 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCL2-201ENST00000295645 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 NEK4P51957 841 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 TUBA3CQ13748 450 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 GAREM2Q75VX8 874 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 NINJ1Q92982 152 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 IL23AQ9NPF7 189 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 MTSS1O43312 755 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 C1SP09871 688 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 KIR2DL3P43628 341 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 ADAM8P78325 824 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 OCRLQ01968 901 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 CRHR2Q13324 411 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 FHL2Q14192 279 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 GPR158Q5T848 1215 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 KRT40Q6A162 431 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 MTG2Q9H4K7 406 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 UBE2QL1A1L167 161 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 OPHN1O60890 802 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 MFAP3LO75121 409 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 TOX4O94842 621 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 MAKP20794 623 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 KLF10Q13118 480 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 MYL10Q9BUA6 226 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 CEP72Q9P209 647 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 DNAI1Q9UI46 699 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 PLAAQ9Y263 795 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 APOL3O95236 402 aa6.61□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 STAT3P40763 770 aa6.61□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 MAN2A2P49641 1150 aa6.61□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 NPEPPSP55786 919 aa6.61□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 DSG1Q02413 1049 aa6.61□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 DPTQ07507 201 aa6.61□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.61□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 MTFR1LQ9H019 292 aa6.61□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 ZMAT4Q9H898 229 aa6.61□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.61□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 NRP1O14786 923 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 SCNN1BP51168 640 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 PHC1P78364 1004 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 DGCR2P98153 550 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 UIMC1Q96RL1 719 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 WNT8AQ9H1J5 351 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 POFUT1Q9H488 388 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 PIF1Q9H611 641 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCL2-201ENST00000295645 FANCLQ9NW38 375 aa6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms