RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263202.14

UFD1-201, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UFD1, Length 1,814 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-201ENST00000263202 KIFC3Q9BVG8 833 aa24.97■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa24.97■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 KCNG1Q9UIX4 513 aa24.97■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa24.97■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 FRMPD3Q5JV73 1810 aa24.97■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 TGFB1I1O43294 461 aa24.96■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 KPNA6O60684 536 aa24.96■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 NAMPTP43490 491 aa24.96■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 ZNF75DP51815 510 aa24.96■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 PPP2R5AQ15172 486 aa24.96■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 GRIK4Q16099 956 aa24.96■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 EDRF1Q3B7T1 1238 aa24.96■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 EFCAB12Q6NXP0 572 aa24.96■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 EEF2KMTQ96G04 330 aa24.96■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 MAGEB2O15479 319 aa24.96■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 MARCH8Q5T0T0 291 aa24.96■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 LRRC55Q6ZSA7 311 aa24.96■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 KATNAL1Q9BW62 490 aa24.96■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 IKZF4Q9H2S9 585 aa24.96■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
UFD1-201ENST00000263202 SERPINC1P01008 464 aa24.95■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.95■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 LINC01465Q8N7H1 131 aa24.95■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 RETREG2Q8NC44 543 aa24.95■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 HVCN1Q96D96 273 aa24.95■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 ACCSQ96QU6 501 aa24.95■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 IFNKQ9P0W0 207 aa24.95■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa24.95■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 DENND3A2RUS2 1198 aa24.94■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.94■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 KCNJ18B7U540 433 aa24.94■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 CALUO43852 315 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.94■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.94■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 CHMP4BP1P59074 171 aa24.94■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 CAPSQ13938 189 aa24.94■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 KCNJ12Q14500 433 aa24.94■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 TCP11X2Q5H9J9 407 aa24.94■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 METTL13Q8N6R0 699 aa24.94■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 PDLIM2Q96JY6 352 aa24.94■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 TMEM206Q9H813 350 aa24.94■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 SETD4Q9NVD3 440 aa24.94■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 TBX20Q9UMR3 447 aa24.94■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 HTTP42858 3142 aa24.94■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa24.94■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 H0YCG3 227 aa24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 CLCN3P51790 818 aa24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 SPAG1Q07617 926 aa24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 KLHDC9Q8NEP7 349 aa24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 KCNN1Q92952 543 aa24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 GBP3Q9H0R5 595 aa24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 CENPFP49454 3210 aa24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 NRCAMQ92823 1304 aa24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 LRRIQ4A6NIV6 560 aa24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 DNM2P50570 870 aa24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 SYCP3Q8IZU3 236 aa24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.93■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 ZEB2O60315 1214 aa24.92■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 CST5P28325 142 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 UBASH3AP57075 661 aa24.92■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 MAP4K3Q8IVH8 894 aa24.92■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 FAM114A1Q8IWE2 563 aa24.92■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 DEPTORQ8TB45 409 aa24.92■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa24.92■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 CEP63Q96MT8 703 aa24.92■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.92■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 SCP2P22307 547 aa24.91■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 ABCD1P33897 745 aa24.91■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 ADAM9Q13443 819 aa24.91■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 KRT31Q15323 416 aa24.91■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 NFIL3Q16649 462 aa24.91■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 TAS1R3Q7RTX0 852 aa24.91■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 LRRC10BA6NIK2 292 aa24.91■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 CLIC2O15247 247 aa24.91■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 GJB1P08034 283 aa24.91■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 NR2F2P24468 414 aa24.91■■□□□ 1.58
UFD1-201ENST00000263202 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms