RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 TTC27Q6P3X3 843 aa22.97■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.97■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.97■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 CUL5Q93034 780 aa22.97■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 KDM4CQ9H3R0 1056 aa22.97■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 PNMA3Q9UL41 463 aa22.97■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLS1Q14651 629 aa22.97■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 TNIP1Q15025 636 aa22.97■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 TLDC1Q6P9B6 456 aa22.97■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANKRD42Q8N9B4 389 aa22.97■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.97■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 AGAP11Q8TF27 550 aa22.97■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC20A1Q8WUM9 679 aa22.97■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 BTBD6Q96KE9 485 aa22.97■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.97■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 RGL1Q9NZL6 768 aa22.97■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.97■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.96■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 JAM2P57087 298 aa22.96■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPSM2P81274 684 aa22.96■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 LONRF1Q17RB8 773 aa22.96■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 GDAP1Q8TB36 358 aa22.96■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.96■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 ACP6Q9NPH0 428 aa22.96■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 USP40Q9NVE5 1235 aa22.96■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa22.96■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLSTN1O94985 981 aa22.96■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 PTENP60484 403 aa22.96■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.275e-7■■■■■ 84.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 NENFQ9UMX5 172 aa22.96■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 UFL1O94874 794 aa22.95■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 GRAPQ13588 217 aa22.95■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.95■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 SEC14L1Q92503 715 aa22.95■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.95■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.95■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.95■■□□□ 1.27
CSNK1G2-201ENST00000255641 CYP2J2P51589 502 aa22.95■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 RHBDL3P58872 404 aa22.95■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 CBWD6Q4V339 395 aa22.95■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.95■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.95■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa22.95■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 VPS36Q86VN1 386 aa22.95■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.95■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.95■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.95■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 SWAP70Q9UH65 585 aa22.95■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.95■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 RIMBP2O15034 1052 aa22.95■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 MMP13P45452 471 aa22.95■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 PPP4CP60510 307 aa22.95■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.95■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.95■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.95■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 SAMD15Q9P1V8 674 aa22.95■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 ACSL3O95573 720 aa22.94■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANP32DO95626 131 aa22.94■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRKCIP41743 596 aa22.94■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 STAT1P42224 750 aa22.94■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.94■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 HOOK3Q86VS8 718 aa22.94■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANKS4BQ8N8V4 417 aa22.94■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 MXD3Q9BW11 206 aa22.94■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.94■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.94■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCNV2Q8TDN2 545 aa22.94■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 PWWP2AQ96N64 755 aa22.94■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC12A4Q9UP95 1085 aa22.94■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 GH1P01241 217 aa22.93■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 GSTO1P78417 241 aa22.93■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF543Q08ER8 600 aa22.93■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 PIGWQ7Z7B1 504 aa22.93■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 DYDC1Q8WWB3 177 aa22.93■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAB17Q9H0T7 212 aa22.93■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 TCP11X1B4DZS4 312 aa22.93■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 USH1GQ495M9 461 aa22.93■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.93■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 C3orf20Q8ND61 904 aa22.93■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 NHSQ6T4R5 1651 aa22.93■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.92■■□□□ 1.26
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRELID2Q8N945 189 aa22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms