RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM206Q9H813 350 aa20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 SIX2Q9NPC8 291 aa20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 CYP26B1Q9NR63 512 aa20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 AKR1B10O60218 316 aa20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 UCHL3P15374 230 aa20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 TERF2Q15554 542 aa20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 MTERF2Q49AM1 385 aa20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 CBWD6Q4V339 395 aa20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 WDR78Q5VTH9 848 aa20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 GJB7Q6PEY0 223 aa20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.35■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 ALCAMQ13740 583 aa20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 GBP6Q6ZN66 633 aa20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 MCM3APO60318 1980 aa20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 ATP8B1O43520 1251 aa20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 SLC25A27O95847 323 aa20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 OSBPP22059 807 aa20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 FAM193AP78312 1265 aa20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 SPA17Q15506 151 aa20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 LY6KQ17RY6 165 aa20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF302Q9NR11 478 aa20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.34■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 SOCS7O14512 581 aa20.33■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 ATG7O95352 703 aa20.33■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 FMO5P49326 533 aa20.33■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 VAV2P52735 878 aa20.33■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 DLG4P78352 724 aa20.33■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 SNAPC2Q13487 334 aa20.33■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.33■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 TBX20Q9UMR3 447 aa20.33■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.33■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SIKE1-201ENST00000060969 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 DENND3A2RUS2 1198 aa20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 ARIH2O95376 493 aa20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 LCA5LO95447 670 aa20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 BFSP1Q12934 665 aa20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 XKR3Q5GH77 459 aa20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 PCYT2Q99447 389 aa20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 MMP19Q99542 508 aa20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 PORCNQ9H237 461 aa20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 CTAGE9A4FU28 777 aa20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 DGAT1O75907 488 aa20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 SERPING1P05155 500 aa20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 RABGGTAQ92696 567 aa20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 KIFAP3Q92845 792 aa20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.32■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 GOLGA8IPA6NC78 632 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 GGPS1O95749 300 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 OATP04181 439 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 ADSSP30520 456 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 SMTNP53814 917 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 ERVK-9P63128 1117 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 GOLGA1Q92805 767 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 ENC1O14682 589 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 KRT86O43790 486 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 TUBB2AQ13885 445 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 KCTD2Q14681 263 aa20.31■□□□□ 0.84
SIKE1-201ENST00000060969 PPP2R5AQ15172 486 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms