RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Akr1b10G5E895 316 aa14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Folh1O35409 752 aa14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Calb1P12658 261 aa14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q3TTJ4 293 aa14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trip13Q3UA06 432 aa14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccdc148Q6P5U8 527 aa14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc7a6osQ7TPE5 306 aa14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nsun6Q7TS68 476 aa14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 NrcamQ810U4 1256 aa14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Erlin1Q91X78 346 aa14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dnajc18Q9CZJ9 357 aa14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Arl2bpQ9D385 163 aa14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sdr42e1Q9D665 394 aa14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zcchc17Q9ESX4 241 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AunipE9Q6Z5 340 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CraddO88843 199 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PtpraP18052 829 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pik3r1P26450 724 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gdpd4Q3TT99 632 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gprin1Q3UNH4 932 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kdm7aQ3UWM4 940 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fhod1Q6P9Q4 1197 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cfap100Q80VN0 613 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ublcp1Q8BGR9 318 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 EtnpplQ8BWU8 499 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pop1Q8K205 1045 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nup58Q8R332 587 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ascc2Q91WR3 749 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Med15Q924H2 789 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ranbp17Q99NF8 1088 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rexo2Q9D8S4 237 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nup50Q9JIH2 466 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 NinQ61043 2035 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TyrobpO54885 114 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Neurl1bQ0MW30 546 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Edem3Q2HXL6 931 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AlcamQ61490 583 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tgoln2Q62314 363 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem117Q8BH18 514 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc9a9Q8BZ00 644 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nmrk1Q91W63 195 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sucla2Q9Z2I9 463 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm11983V9GXS8 105 aa14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pgap3A2A559 320 aa14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc3a2P10852 526 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tarbp2P97473 365 aa14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Map3k9Q3U1V8 1077 aa14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Klra5Q60652 266 aa14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trim65Q8BFW4 522 aa14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ipo5Q8BKC5 1097 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AsphQ8BSY0 741 aa14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Znf445Q8R2V3 986 aa14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nxf1Q99JX7 618 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Acsl3Q9CZW4 720 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 IvdQ9JHI5 424 aa14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pdlim7Q3TJD7 457 aa14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 E2f5Q61502 335 aa14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krt42Q6IFX2 452 aa14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Atp2a1Q8R429 994 aa14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mucl2P02815 138 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Map2k1P31938 393 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PklrP53657 574 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rhox12Q4TU81 186 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ift20Q61025 132 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ints2Q80UK8 1198 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc51bQ80WK2 128 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TbckQ8BM85 762 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Senp7Q8BUH8 1037 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem161bQ8C2L6 487 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 DnerQ8JZM4 737 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Serpina9Q9D7D2 418 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rbp7Q9EPC5 134 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rnf103Q9R1W3 683 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fut8Q9WTS2 575 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Skor2A7M7C7 1008 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 DgkiD3YWQ0 1071 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Per1O35973 1291 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prkg1P0C605 671 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fgl2P12804 432 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Irf8P23611 424 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wnt7bP28047 349 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 NyxP83503 476 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 rp9P97762 213 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ice2Q3UZ18 988 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cyp3a11Q64459 504 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sestd1Q80UK0 696 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Depdc1bQ8BH88 529 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Bco2Q99NF1 532 aa14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prpf4Q9DAW6 521 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mms22lB1AUR6 1238 aa14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn2r63E9Q0K5 859 aa14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm9268E9Q0M3 861 aa14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn2r62K7N712 859 aa14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ProcP33587 460 aa14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pik3caP42337 1068 aa14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Irf6P97431 467 aa14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rnf113a2Q14B01 337 aa14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Arglu1Q3UL36 271 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cnot7Q60809 285 aa14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sv2cQ69ZS6 727 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.8 ms