RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636481.1

CHRNA4-215, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, human

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 126 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHRNA4-215	ENST00000636481	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CHRNA4-215	ENST00000636481	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CHRNA4-215	ENST00000636481	RERE	Q9P2R6	1566 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CHRNA4-215	ENST00000636481	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CHRNA4-215	ENST00000636481	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CHRNA4-215	ENST00000636481	ABCA6	Q8N139	1617 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CHRNA4-215	ENST00000636481	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CHRNA4-215	ENST00000636481	C14orf37	Q86TY3	774 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CHRNA4-215	ENST00000636481	EID1	Q9Y6B2	187 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CHRNA4-215	ENST00000636481	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CHRNA4-215	ENST00000636481	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CHRNA4-215	ENST00000636481	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
CHRNA4-215	ENST00000636481	MIA2	Q96PC5	1412 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CHRNA4-215	ENST00000636481	KIF3B	O15066	747 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	LTK	P29376	864 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	KDM5C	P41229	1560 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	LRP6	O75581	1613 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	RGS12	O14924	1447 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	MED14	O60244	1454 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	ADAMTS2	O95450	1211 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	KCNA6	P17658	529 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	CCDC125	Q86Z20	511 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	MSH6	P52701	1360 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	CLIP1	P30622	1438 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	A2M	P01023	1474 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	PRX	Q9BXM0	1461 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	MROH2A	A6NES4	1674 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	USP21	Q9UK80	565 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	ATF3	P18847	181 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	HRC	P23327	699 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	NLRP1	Q9C000	1473 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	SYNM	O15061	1565 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	SAMD9	Q5K651	1589 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	PZP	P20742	1482 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	IQGAP1	P46940	1657 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	KIF14	Q15058	1648 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHRNA4-215	ENST00000636481	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	PHLPP1	O60346	1717 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	DEPDC5	O75140	1603 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	C1QTNF8	P60827	252 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	ATP7A	Q04656	1500 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	BRINP3	Q76B58	766 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	BAG6	P46379	1132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	NCOA2	Q15596	1464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	FMN1	Q68DA7	1419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	MAP3K1	Q13233	1512 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481		A0A0G2JS52	829 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	CAPN15	O75808	1086 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	MYT1	Q01538	1121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	PLXNC1	O60486	1568 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	TSPY4	P0CV99	314 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	TSPY10	P0CW01	314 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CHRNA4-215	ENST00000636481	IDI1	Q13907	227 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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