RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631166.1

HS1BP3-208, Transcript of HCLS1 binding protein 3, human

TSL 5 BASIC

Gene HS1BP3, Length 78 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HS1BP3-208	ENST00000631166	SLAIN2	Q9P270	581 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	USP21	Q9UK80	565 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	NPAT	Q14207	1427 aa		4.7	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	NEO1	Q92859	1461 aa		4.69	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		4.69	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.69	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		4.69	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	HTRA3	P83110	453 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	NBPF14	Q5TI25	921 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	PHLPP1	O60346	1717 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	ATP10D	Q9P241	1426 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	TOMM70	O94826	608 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	CFAP44	Q96MT7	982 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	PRDM2	Q13029	1718 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	C3	P01024	1663 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	ATP10A	O60312	1499 aa		4.65	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		4.65	□□□□□ -1.66
HS1BP3-208	ENST00000631166	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	FAM122A	Q96E09	287 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	KDM5C	P41229	1560 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	ADAMTS12	P58397	1594 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	KIF3C	O14782	793 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	PLA2G5	P39877	138 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	SYNM	O15061	1565 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	ADAMTS2	O95450	1211 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	COL9A1	P20849	921 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	UNC13B	O14795	1591 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	GRIN3B	O60391	1043 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	ABCA8	O94911	1581 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	FOXN1	O15353	648 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	DACH1	Q9UI36	760 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	ATRN	O75882	1429 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	SHPRH	Q149N8	1683 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	AIDA	Q96BJ3	306 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	WDR90	Q96KV7	1748 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HS1BP3-208	ENST00000631166	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	TMEM94	Q12767	1356 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	DLC1	Q96QB1	1528 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	MED14	O60244	1454 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	PTGER2	P43116	358 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	FSTL1	Q12841	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	LBX1	P52954	281 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	ATP10B	O94823	1461 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	MSH6	P52701	1360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	RICTOR	Q6R327	1708 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	DISP2	A7MBM2	1401 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	DIP2A	Q14689	1571 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZBTB7A	O95365	584 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms