RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629188.2

PCBP1-AS1-340, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 705 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-340ENST00000629188 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
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PCBP1-AS1-340ENST00000629188 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
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PCBP1-AS1-340ENST00000629188 CD109Q6YHK3 1445 aa12.03□□□□□ -0.48
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PCBP1-AS1-340ENST00000629188 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa11.81□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-340ENST00000629188 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.8□□□□□ -0.52
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PCBP1-AS1-340ENST00000629188 ADGRL1O94910 1474 aa11.79□□□□□ -0.52
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PCBP1-AS1-340ENST00000629188 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa11.78□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-340ENST00000629188 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-340ENST00000629188 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa11.77□□□□□ -0.52
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PCBP1-AS1-340ENST00000629188 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP11.76□□□□□ -0.532e-6■■□□□ 13.9
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PCBP1-AS1-340ENST00000629188 PREX2Q70Z35 1606 aa11.75□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-340ENST00000629188 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.75□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-340ENST00000629188 FBXO22Q8NEZ5 403 aa11.75□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-340ENST00000629188 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.75□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-340ENST00000629188 ST18O60284 1047 aa11.74□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-340ENST00000629188 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-340ENST00000629188 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.74□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-340ENST00000629188 NCOA2Q15596 1464 aa11.74□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-340ENST00000629188 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.74□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-340ENST00000629188 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa11.74□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-340ENST00000629188 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa11.73□□□□□ -0.53
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PCBP1-AS1-340ENST00000629188 CFAP74Q9C0B2 1584 aa11.72□□□□□ -0.53
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