RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627074.2

PCBP1-AS1-308, PCBP1 antisense RNA 1, human

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 871 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	MROH2A	A6NES4	1674 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	A2M	P01023	1474 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	MIA2	Q96PC5	1412 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	STRC	Q7RTU9	1775 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	HSPA2	P54652	639 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ABCC5	O15440	1437 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CEP152	O94986	1710 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	DAPK1	P53355	1430 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ZMYM3	Q14202	1370 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	GGT6	Q6P531	493 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TSPY4	P0CV99	314 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TSPY10	P0CW01	314 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NPAT	Q14207	1427 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PTPRK	Q15262	1439 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	KIF3B	O15066	747 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	DEPDC5	O75140	1603 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PROM2	Q8N271	834 aa		11.88	□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ABCC3	O15438	1527 aa		11.86	□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ADGRL2	O95490	1459 aa		11.84	□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PZP	P20742	1482 aa		11.84	□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	KIF15	Q9NS87	1388 aa		11.84	□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		11.84	□□□□□ -0.51
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NCOA1	Q15788	1441 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	POLA2	Q14181	598 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TNR	Q92752	1358 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		11.77	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ERVK-7	P63135	1459 aa		11.77	□□□□□ -0.52
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	UNC13B	O14795	1591 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PLA2R1	Q13018	1463 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PTPRT	O14522	1441 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	11.75	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	RNF39	Q9H2S5	420 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NLRP1	Q9C000	1473 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SYNM	O15061	1565 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PIK3C2B	O00750	1634 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TET3	O43151	1660 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CAPN15	O75808	1086 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		11.73	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074		E9PCH4	1651 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ROCK1	Q13464	1354 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54

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