RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621817.1

FAM58A-209, Transcript of Cyclin-related protein FAM58A, humanhuman

TSL 3

Gene FAM58A, Length 916 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58A-209ENST00000621817 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP45.48■■■■■ 4.87
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FAM58A-209ENST00000621817 PTPRTO14522 1441 aa45.45■■■■■ 4.87
FAM58A-209ENST00000621817 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.87
FAM58A-209ENST00000621817 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP45.44■■■■■ 4.86
FAM58A-209ENST00000621817 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa45.43■■■■■ 4.86
FAM58A-209ENST00000621817 FGD6Q6ZV73 1430 aa45.41■■■■■ 4.86
FAM58A-209ENST00000621817 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP45.41■■■■■ 4.86
FAM58A-209ENST00000621817 SHANK2Q9UPX8 1470 aa45.41■■■■■ 4.86
FAM58A-209ENST00000621817 PZPP20742 1482 aa45.4■■■■■ 4.86
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FAM58A-209ENST00000621817 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa45.32■■■■■ 4.85
FAM58A-209ENST00000621817 PLA2R1Q13018 1463 aa45.32■■■■■ 4.85
FAM58A-209ENST00000621817 CERKQ8TCT0 537 aa45.32■■■■■ 4.85
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FAM58A-209ENST00000621817 KIF15Q9NS87 1388 aa45.23■■■■■ 4.83
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FAM58A-209ENST00000621817 ERVK-7P63135 1459 aa45.04■■■■■ 4.8
FAM58A-209ENST00000621817 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP45.04■■■■■ 4.8
FAM58A-209ENST00000621817 ADGRL2O95490 1459 aa45.04■■■■■ 4.8
FAM58A-209ENST00000621817 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa45.03■■■■■ 4.8
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FAM58A-209ENST00000621817 CHIC2Q9UKJ5 165 aa44.97■■■■■ 4.79
FAM58A-209ENST00000621817 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa44.97■■■■■ 4.79
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FAM58A-209ENST00000621817 VWDEQ8N2E2 1590 aa44.94■■■■■ 4.78
FAM58A-209ENST00000621817 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP44.9■■■■■ 4.78
FAM58A-209ENST00000621817 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP44.89■■■■■ 4.78
FAM58A-209ENST00000621817 LMTK2Q8IWU2 1503 aa44.89■■■■■ 4.78
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FAM58A-209ENST00000621817 ROCK1Q13464 1354 aa44.64■■■■■ 4.74
FAM58A-209ENST00000621817 SYNMO15061 1565 aa44.64■■■■■ 4.74
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FAM58A-209ENST00000621817 UNC13BO14795 1591 aa44.61■■■■■ 4.73
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FAM58A-209ENST00000621817 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP44.53■■■■■ 4.72
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FAM58A-209ENST00000621817 IDI1Q13907 227 aa44.48■■■■■ 4.71
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FAM58A-209ENST00000621817 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP44.16■■■■■ 4.66
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FAM58A-209ENST00000621817 PIP4K2BP78356 416 aa44.04■■■■■ 4.64
FAM58A-209ENST00000621817 NWD1Q149M9 1564 aa44.04■■■■■ 4.64
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