RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 PTPRTO14522 1441 aa36.73■■■■□ 3.47
PPP1CC-211ENST00000620030 NCOA1Q15788 1441 aa36.73■■■■□ 3.47
PPP1CC-211ENST00000620030 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.73■■■■□ 3.47
PPP1CC-211ENST00000620030 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.72■■■■□ 3.47
PPP1CC-211ENST00000620030 CERKQ8TCT0 537 aa36.71■■■■□ 3.47
PPP1CC-211ENST00000620030 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
PPP1CC-211ENST00000620030 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.67■■■■□ 3.46
PPP1CC-211ENST00000620030 PZPP20742 1482 aa36.66■■■■□ 3.46
PPP1CC-211ENST00000620030 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.66■■■■□ 3.46
PPP1CC-211ENST00000620030 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.65■■■■□ 3.46
PPP1CC-211ENST00000620030 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.65■■■■□ 3.46
PPP1CC-211ENST00000620030 DAPK1P53355 1430 aa36.65■■■■□ 3.46
PPP1CC-211ENST00000620030 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.64■■■■□ 3.46
PPP1CC-211ENST00000620030 TNRQ92752 1358 aa36.63■■■■□ 3.45
PPP1CC-211ENST00000620030 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
PPP1CC-211ENST00000620030 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.62■■■■□ 3.45
PPP1CC-211ENST00000620030 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
PPP1CC-211ENST00000620030 KIF15Q9NS87 1388 aa36.62■■■■□ 3.45
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
PPP1CC-211ENST00000620030 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
PPP1CC-211ENST00000620030 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.59■■■■□ 3.45
PPP1CC-211ENST00000620030 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
PPP1CC-211ENST00000620030 PLA2R1Q13018 1463 aa36.57■■■■□ 3.45
PPP1CC-211ENST00000620030 PKD2Q13563 968 aa36.57■■■■□ 3.44
PPP1CC-211ENST00000620030 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.56■■■■□ 3.44
PPP1CC-211ENST00000620030 ABCC3O15438 1527 aa36.55■■■■□ 3.44
PPP1CC-211ENST00000620030 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.55■■■■□ 3.44
PPP1CC-211ENST00000620030 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.54■■■■□ 3.44
PPP1CC-211ENST00000620030 ERBINQ96RT1 1412 aa36.52■■■■□ 3.44
PPP1CC-211ENST00000620030 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.51■■■■□ 3.43
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
PPP1CC-211ENST00000620030 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
PPP1CC-211ENST00000620030 NLRP1Q9C000 1473 aa36.44■■■■□ 3.42
PPP1CC-211ENST00000620030 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.43■■■■□ 3.42
PPP1CC-211ENST00000620030 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
PPP1CC-211ENST00000620030 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.42■■■■□ 3.421e-6■■□□□ 12.7
PPP1CC-211ENST00000620030 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.4■■■■□ 3.42
PPP1CC-211ENST00000620030 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
PPP1CC-211ENST00000620030 ERVK-7P63135 1459 aa36.39■■■■□ 3.42
PPP1CC-211ENST00000620030 ADGRL2O95490 1459 aa36.38■■■■□ 3.41
PPP1CC-211ENST00000620030 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.37■■■■□ 3.41
PPP1CC-211ENST00000620030 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.37■■■■□ 3.413e-6■■□□□ 12.8
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
PPP1CC-211ENST00000620030 CEP152O94986 1710 aa36.35■■■■□ 3.41
PPP1CC-211ENST00000620030 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.34■■■■□ 3.41
PPP1CC-211ENST00000620030 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.34■■■■□ 3.41
PPP1CC-211ENST00000620030 KANK1Q14678 1352 aa36.33■■■■□ 3.41
PPP1CC-211ENST00000620030 DEPDC5O75140 1603 aa36.32■■■■□ 3.4
PPP1CC-211ENST00000620030 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
PPP1CC-211ENST00000620030 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.25■■■■□ 3.39
PPP1CC-211ENST00000620030 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.25■■■■□ 3.39
PPP1CC-211ENST00000620030 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.24■■■■□ 3.39
PPP1CC-211ENST00000620030 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
PPP1CC-211ENST00000620030 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.24■■■■□ 3.39
PPP1CC-211ENST00000620030 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36.23■■■■□ 3.39
PPP1CC-211ENST00000620030 MED14O60244 1454 aa36.2■■■■□ 3.39
PPP1CC-211ENST00000620030 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
PPP1CC-211ENST00000620030 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
PPP1CC-211ENST00000620030 ROCK1Q13464 1354 aa36.15■■■■□ 3.38
PPP1CC-211ENST00000620030 IDI1Q13907 227 aa36.11■■■■□ 3.37
PPP1CC-211ENST00000620030 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.1■■■■□ 3.37
PPP1CC-211ENST00000620030 LTKP29376 864 aa36.08■■■■□ 3.37
PPP1CC-211ENST00000620030 ITGAEP38570 1179 aa36.08■■■■□ 3.37
PPP1CC-211ENST00000620030 NOS1P29475 1434 aa36.08■■■■□ 3.37
PPP1CC-211ENST00000620030 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.06■■■■□ 3.36
PPP1CC-211ENST00000620030 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.06■■■■□ 3.36
PPP1CC-211ENST00000620030 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.06■■■■□ 3.36
PPP1CC-211ENST00000620030 SLIT1O75093 1534 aa36.03■■■■□ 3.36
PPP1CC-211ENST00000620030 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
PPP1CC-211ENST00000620030 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.01■■■■□ 3.36
PPP1CC-211ENST00000620030 UBAP1LF5GYI3 381 aa36■■■■□ 3.35
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36■■■■□ 3.35
PPP1CC-211ENST00000620030 SYNMO15061 1565 aa36■■■■□ 3.35
PPP1CC-211ENST00000620030 PIK3C2BO00750 1634 aa36■■■■□ 3.35
PPP1CC-211ENST00000620030 CPS1P31327 1500 aa35.99■■■■□ 3.35
PPP1CC-211ENST00000620030 EID1Q9Y6B2 187 aa35.99■■■■□ 3.35
PPP1CC-211ENST00000620030 IQGAP1P46940 1657 aa35.99■■■■□ 3.35
PPP1CC-211ENST00000620030 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.99■■■■□ 3.35
PPP1CC-211ENST00000620030 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
PPP1CC-211ENST00000620030 UNC13BO14795 1591 aa35.95■■■■□ 3.35
PPP1CC-211ENST00000620030 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
PPP1CC-211ENST00000620030 TET3O43151 1660 aa35.91■■■■□ 3.34
PPP1CC-211ENST00000620030 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
PPP1CC-211ENST00000620030 NUP155O75694 1391 aa35.89■■■■□ 3.34
PPP1CC-211ENST00000620030 ADGRB3O60242 1522 aa35.83■■■■□ 3.33
PPP1CC-211ENST00000620030 TOM1O60784 492 aa35.82■■■■□ 3.32
PPP1CC-211ENST00000620030 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.81■■■■□ 3.32
PPP1CC-211ENST00000620030 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.81■■■■□ 3.32
PPP1CC-211ENST00000620030 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.81■■■■□ 3.32
PPP1CC-211ENST00000620030 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.79■■■■□ 3.32
PPP1CC-211ENST00000620030 E9PCH4 1651 aa35.77■■■■□ 3.32
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.73■■■■□ 3.31
PPP1CC-211ENST00000620030 PIP4K2BP78356 416 aa35.72■■■■□ 3.31
PPP1CC-211ENST00000620030 ZFYVE9O95405 1425 aa35.72■■■■□ 3.31
PPP1CC-211ENST00000620030 NAIPQ13075 1403 aa35.72■■■■□ 3.31
PPP1CC-211ENST00000620030 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
PPP1CC-211ENST00000620030 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.69■■■■□ 3.3
PPP1CC-211ENST00000620030 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
PPP1CC-211ENST00000620030 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.68■■■■□ 3.3
PPP1CC-211ENST00000620030 KCNA6P17658 529 aa35.68■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms