RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 ROCK1Q13464 1354 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZMYM3Q14202 1370 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 MBD5Q9P267 1494 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTPRTO14522 1441 aa24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 NPATQ14207 1427 aa24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 TSPY4P0CV99 314 aa24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 TSPY10P0CW01 314 aa24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABCC5O15440 1437 aa24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC3-210ENST00000617904 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC3-210ENST00000617904 NCOA1Q15788 1441 aa24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC3-210ENST00000617904 GGT6Q6P531 493 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC3-210ENST00000617904 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC3-210ENST00000617904 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC3-210ENST00000617904 PTPRKQ15262 1439 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC3-210ENST00000617904 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3-210ENST00000617904 NAIPQ13075 1403 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3-210ENST00000617904 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC3-210ENST00000617904 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADGRL2O95490 1459 aa24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLA2R1Q13018 1463 aa24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIF3BO15066 747 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM52Q96A61 297 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 PKD2Q13563 968 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
TRAPPC3-210ENST00000617904 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC3-210ENST00000617904 PZPP20742 1482 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC3-210ENST00000617904 TNRQ92752 1358 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIF15Q9NS87 1388 aa24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC3-210ENST00000617904 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC3-210ENST00000617904 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC3-210ENST00000617904 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC3-210ENST00000617904 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABCC3O15438 1527 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 NLRP1Q9C000 1473 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 ERBINQ96RT1 1412 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC3-210ENST00000617904 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC3-210ENST00000617904 NUP155O75694 1391 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC3-210ENST00000617904 NEUROD1Q13562 356 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC3-210ENST00000617904 TONSLQ96HA7 1378 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC3-210ENST00000617904 ILDR2Q71H61 639 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC3-210ENST00000617904 ERVK-7P63135 1459 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC3-210ENST00000617904 MED14O60244 1454 aa24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC3-210ENST00000617904 DEPDC5O75140 1603 aa24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC3-210ENST00000617904 CPS1P31327 1500 aa24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC3-210ENST00000617904 CEP152O94986 1710 aa24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC3-210ENST00000617904 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC3-210ENST00000617904 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC3-210ENST00000617904 UNC13BO14795 1591 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC3-210ENST00000617904 KANK1Q14678 1352 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC3-210ENST00000617904 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC3-210ENST00000617904 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 IQGAP1P46940 1657 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 TOM1O60784 492 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC3-210ENST00000617904 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24■■□□□ 1.43
TRAPPC3-210ENST00000617904 SOCS7O14512 581 aa24■■□□□ 1.43
TRAPPC3-210ENST00000617904 PIP4K2BP78356 416 aa24■■□□□ 1.43
TRAPPC3-210ENST00000617904 STRCP1A6NGW2 1772 aa24■■□□□ 1.43
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC3-210ENST00000617904 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC3-210ENST00000617904 HSPA1LP34931 641 aa23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC3-210ENST00000617904 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC3-210ENST00000617904 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
TRAPPC3-210ENST00000617904 ALKQ9UM73 1620 aa23.97■■□□□ 1.43
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