RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616306.1

UBXN8-208, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN8, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-208ENST00000616306 MIER1Q8N108 512 aa16.12■□□□□ 0.17
UBXN8-208ENST00000616306 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.11■□□□□ 0.17
UBXN8-208ENST00000616306 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.11■□□□□ 0.17
UBXN8-208ENST00000616306 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.11■□□□□ 0.17
UBXN8-208ENST00000616306 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.1■□□□□ 0.17
UBXN8-208ENST00000616306 REREQ9P2R6 1566 aa16.09■□□□□ 0.17
UBXN8-208ENST00000616306 PLEKHG5O94827 1062 aa16.09■□□□□ 0.17
UBXN8-208ENST00000616306 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
UBXN8-208ENST00000616306 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.09■□□□□ 0.17
UBXN8-208ENST00000616306 TIAM1Q13009 1591 aa16.09■□□□□ 0.17
UBXN8-208ENST00000616306 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa16.09■□□□□ 0.17
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
UBXN8-208ENST00000616306 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
UBXN8-208ENST00000616306 PLCD3Q8N3E9 789 aa16.07■□□□□ 0.16
UBXN8-208ENST00000616306 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.07■□□□□ 0.16
UBXN8-208ENST00000616306 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.07■□□□□ 0.16
UBXN8-208ENST00000616306 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
UBXN8-208ENST00000616306 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa16.07■□□□□ 0.16
UBXN8-208ENST00000616306 ABCA6Q8N139 1617 aa16.06■□□□□ 0.16
UBXN8-208ENST00000616306 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa16.05■□□□□ 0.16
UBXN8-208ENST00000616306 MAP3K1Q13233 1512 aa16.05■□□□□ 0.16
UBXN8-208ENST00000616306 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
UBXN8-208ENST00000616306 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
UBXN8-208ENST00000616306 AGLP35573 1532 aa16.03■□□□□ 0.16
UBXN8-208ENST00000616306 NCOA2Q15596 1464 aa16.03■□□□□ 0.16
UBXN8-208ENST00000616306 MLECQ14165 292 aa16.02■□□□□ 0.16
UBXN8-208ENST00000616306 FBXO3Q9UK99 471 aa16.02■□□□□ 0.16
UBXN8-208ENST00000616306 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.02■□□□□ 0.15
UBXN8-208ENST00000616306 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
UBXN8-208ENST00000616306 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
UBXN8-208ENST00000616306 ATP7AQ04656 1500 aa15.99■□□□□ 0.15
UBXN8-208ENST00000616306 MBD5Q9P267 1494 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN8-208ENST00000616306 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.98■□□□□ 0.15
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
UBXN8-208ENST00000616306 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
UBXN8-208ENST00000616306 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN8-208ENST00000616306 LMTK3Q96Q04 1460 aa15.95■□□□□ 0.14
UBXN8-208ENST00000616306 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN8-208ENST00000616306 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
UBXN8-208ENST00000616306 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN8-208ENST00000616306 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.94■□□□□ 0.14
UBXN8-208ENST00000616306 PLXNC1O60486 1568 aa15.93■□□□□ 0.14
UBXN8-208ENST00000616306 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
UBXN8-208ENST00000616306 A2MP01023 1474 aa15.92■□□□□ 0.14
UBXN8-208ENST00000616306 CCDC141Q6ZP82 1450 aa15.92■□□□□ 0.14
UBXN8-208ENST00000616306 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.91■□□□□ 0.14
UBXN8-208ENST00000616306 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.91■□□□□ 0.14
UBXN8-208ENST00000616306 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
UBXN8-208ENST00000616306 MIA2Q96PC5 1412 aa15.9■□□□□ 0.14
UBXN8-208ENST00000616306 C3P01024 1663 aa15.89■□□□□ 0.13
UBXN8-208ENST00000616306 PREX1Q8TCU6 1659 aa15.89■□□□□ 0.13
UBXN8-208ENST00000616306 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.89■□□□□ 0.13
UBXN8-208ENST00000616306 GABBR2O75899 941 aa15.89■□□□□ 0.13
UBXN8-208ENST00000616306 MROH2AA6NES4 1674 aa15.88■□□□□ 0.13
UBXN8-208ENST00000616306 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
UBXN8-208ENST00000616306 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
UBXN8-208ENST00000616306 TSPY4P0CV99 314 aa15.85■□□□□ 0.13
UBXN8-208ENST00000616306 TSPY10P0CW01 314 aa15.85■□□□□ 0.13
UBXN8-208ENST00000616306 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
UBXN8-208ENST00000616306 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
UBXN8-208ENST00000616306 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.83■□□□□ 0.13
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
UBXN8-208ENST00000616306 VASPP50552 380 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
UBXN8-208ENST00000616306 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa15.82■□□□□ 0.12
UBXN8-208ENST00000616306 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
UBXN8-208ENST00000616306 HSPA2P54652 639 aa15.81■□□□□ 0.12
UBXN8-208ENST00000616306 ZMYM3Q14202 1370 aa15.81■□□□□ 0.12
UBXN8-208ENST00000616306 NPATQ14207 1427 aa15.81■□□□□ 0.12
UBXN8-208ENST00000616306 GGT6Q6P531 493 aa15.81■□□□□ 0.12
UBXN8-208ENST00000616306 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.79■□□□□ 0.12
UBXN8-208ENST00000616306 FAM135AQ9P2D6 1515 aa15.78■□□□□ 0.12
UBXN8-208ENST00000616306 PHF12Q96QT6 1004 aa15.78■□□□□ 0.12
UBXN8-208ENST00000616306 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.77■□□□□ 0.12
UBXN8-208ENST00000616306 KIF3BO15066 747 aa15.77■□□□□ 0.12
UBXN8-208ENST00000616306 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
UBXN8-208ENST00000616306 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.76■□□□□ 0.11
UBXN8-208ENST00000616306 RASEFQ8IZ41 740 aa15.75■□□□□ 0.11
UBXN8-208ENST00000616306 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.75■□□□□ 0.11
UBXN8-208ENST00000616306 KLHL34Q8N239 644 aa15.74■□□□□ 0.11
UBXN8-208ENST00000616306 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
UBXN8-208ENST00000616306 PTPRKQ15262 1439 aa15.74■□□□□ 0.11
UBXN8-208ENST00000616306 KDM5DQ9BY66 1539 aa15.73■□□□□ 0.11
UBXN8-208ENST00000616306 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
UBXN8-208ENST00000616306 STRCQ7RTU9 1775 aa15.73■□□□□ 0.11
UBXN8-208ENST00000616306 ABCC5O15440 1437 aa15.73■□□□□ 0.11
UBXN8-208ENST00000616306 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
UBXN8-208ENST00000616306 DUOX2Q9NRD8 1548 aa15.72■□□□□ 0.11
UBXN8-208ENST00000616306 DAPK1P53355 1430 aa15.71■□□□□ 0.11
UBXN8-208ENST00000616306 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa15.7■□□□□ 0.1
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
UBXN8-208ENST00000616306 CLCN6P51797 869 aa15.7■□□□□ 0.1
UBXN8-208ENST00000616306 MYO3AQ8NEV4 1616 aa15.69■□□□□ 0.1
UBXN8-208ENST00000616306 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
UBXN8-208ENST00000616306 PZPP20742 1482 aa15.68■□□□□ 0.1
UBXN8-208ENST00000616306 KIF15Q9NS87 1388 aa15.68■□□□□ 0.1
UBXN8-208ENST00000616306 NUBP1P53384 320 aa15.67■□□□□ 0.1
UBXN8-208ENST00000616306 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
UBXN8-208ENST00000616306 ERBINQ96RT1 1412 aa15.67■□□□□ 0.1
UBXN8-208ENST00000616306 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
UBXN8-208ENST00000616306 NCOA1Q15788 1441 aa15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms