RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615093.1

RAB43-208, Transcript of RAB43, member RAS oncogene family, human

TSL 5 BASIC

Gene RAB43, Length 783 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB43-208	ENST00000615093	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.73	■■■□□ 2.99
RAB43-208	ENST00000615093	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		33.73	■■■□□ 2.99
RAB43-208	ENST00000615093	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
RAB43-208	ENST00000615093	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.72	■■■□□ 2.99
RAB43-208	ENST00000615093	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.71	■■■□□ 2.99
RAB43-208	ENST00000615093	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.71	■■■□□ 2.99
RAB43-208	ENST00000615093	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.71	■■■□□ 2.99
RAB43-208	ENST00000615093	PTPRT	O14522	1441 aa		33.7	■■■□□ 2.99
RAB43-208	ENST00000615093	ABCC5	O15440	1437 aa		33.7	■■■□□ 2.99
RAB43-208	ENST00000615093	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.7	■■■□□ 2.99
RAB43-208	ENST00000615093	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
RAB43-208	ENST00000615093	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.7	■■■□□ 2.99
RAB43-208	ENST00000615093	PZP	P20742	1482 aa		33.68	■■■□□ 2.98
RAB43-208	ENST00000615093	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.67	■■■□□ 2.98
RAB43-208	ENST00000615093	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	33.67	■■■□□ 2.98
RAB43-208	ENST00000615093	DAPK1	P53355	1430 aa		33.65	■■■□□ 2.98
RAB43-208	ENST00000615093	CERK	Q8TCT0	537 aa		33.63	■■■□□ 2.97
RAB43-208	ENST00000615093	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.62	■■■□□ 2.97
RAB43-208	ENST00000615093	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
RAB43-208	ENST00000615093	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.61	■■■□□ 2.97
RAB43-208	ENST00000615093	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.61	■■■□□ 2.97
RAB43-208	ENST00000615093	TNR	Q92752	1358 aa		33.6	■■■□□ 2.97
RAB43-208	ENST00000615093	KIF15	Q9NS87	1388 aa		33.6	■■■□□ 2.97
RAB43-208	ENST00000615093	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.6	■■■□□ 2.97
RAB43-208	ENST00000615093	ABCC3	O15438	1527 aa		33.59	■■■□□ 2.97
RAB43-208	ENST00000615093	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		33.55	■■■□□ 2.96
RAB43-208	ENST00000615093	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		33.54	■■■□□ 2.96
RAB43-208	ENST00000615093	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33.54	■■■□□ 2.96
RAB43-208	ENST00000615093	CEP152	O94986	1710 aa		33.52	■■■□□ 2.96
RAB43-208	ENST00000615093	PKD2	Q13563	968 aa		33.51	■■■□□ 2.95
RAB43-208	ENST00000615093	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95
RAB43-208	ENST00000615093	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		33.47	■■■□□ 2.95
RAB43-208	ENST00000615093	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		33.47	■■■□□ 2.95
RAB43-208	ENST00000615093	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.47	■■■□□ 2.95
RAB43-208	ENST00000615093	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.47	■■■□□ 2.95
RAB43-208	ENST00000615093	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.46	■■■□□ 2.95
RAB43-208	ENST00000615093	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.46	■■■□□ 2.95
RAB43-208	ENST00000615093	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
RAB43-208	ENST00000615093	ADGRL2	O95490	1459 aa		33.43	■■■□□ 2.94
RAB43-208	ENST00000615093	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.43	■■■□□ 2.94
RAB43-208	ENST00000615093	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
RAB43-208	ENST00000615093	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.39	■■■□□ 2.94
RAB43-208	ENST00000615093	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
RAB43-208	ENST00000615093	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.37	■■■□□ 2.93
RAB43-208	ENST00000615093	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
RAB43-208	ENST00000615093	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.35	■■■□□ 2.93
RAB43-208	ENST00000615093	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33.34	■■■□□ 2.93	3e-9	■■■□□ 17
RAB43-208	ENST00000615093	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		33.34	■■■□□ 2.93
RAB43-208	ENST00000615093	KANK1	Q14678	1352 aa		33.34	■■■□□ 2.93
RAB43-208	ENST00000615093	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.32	■■■□□ 2.92
RAB43-208	ENST00000615093	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
RAB43-208	ENST00000615093	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		33.31	■■■□□ 2.92
RAB43-208	ENST00000615093	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.3	■■■□□ 2.92
RAB43-208	ENST00000615093	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33.29	■■■□□ 2.92
RAB43-208	ENST00000615093	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33.25	■■■□□ 2.91
RAB43-208	ENST00000615093	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		33.25	■■■□□ 2.91
RAB43-208	ENST00000615093	MED14	O60244	1454 aa		33.23	■■■□□ 2.91
RAB43-208	ENST00000615093	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
RAB43-208	ENST00000615093	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
RAB43-208	ENST00000615093	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.18	■■■□□ 2.9
RAB43-208	ENST00000615093	ROCK1	Q13464	1354 aa		33.16	■■■□□ 2.9
RAB43-208	ENST00000615093	IQGAP1	P46940	1657 aa		33.15	■■■□□ 2.9
RAB43-208	ENST00000615093	PIK3C2B	O00750	1634 aa		33.14	■■■□□ 2.9
RAB43-208	ENST00000615093	SYNM	O15061	1565 aa		33.11	■■■□□ 2.89
RAB43-208	ENST00000615093	SLIT1	O75093	1534 aa		33.11	■■■□□ 2.89
RAB43-208	ENST00000615093	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		33.11	■■■□□ 2.89
RAB43-208	ENST00000615093	NOS1	P29475	1434 aa		33.11	■■■□□ 2.89
RAB43-208	ENST00000615093	UNC13B	O14795	1591 aa		33.1	■■■□□ 2.89
RAB43-208	ENST00000615093	CPS1	P31327	1500 aa		33.09	■■■□□ 2.89
RAB43-208	ENST00000615093	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
RAB43-208	ENST00000615093	TET3	O43151	1660 aa		33.07	■■■□□ 2.89
RAB43-208	ENST00000615093	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
RAB43-208	ENST00000615093	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
RAB43-208	ENST00000615093	IDI1	Q13907	227 aa		33.05	■■■□□ 2.88
RAB43-208	ENST00000615093	ITGAE	P38570	1179 aa		33.04	■■■□□ 2.88
RAB43-208	ENST00000615093	LTK	P29376	864 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RAB43-208	ENST00000615093	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RAB43-208	ENST00000615093	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		33.01	■■■□□ 2.87
RAB43-208	ENST00000615093	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		33	■■■□□ 2.87
RAB43-208	ENST00000615093	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		33	■■■□□ 2.87
RAB43-208	ENST00000615093	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		32.99	■■■□□ 2.87
RAB43-208	ENST00000615093	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.98	■■■□□ 2.87
RAB43-208	ENST00000615093	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
RAB43-208	ENST00000615093	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.97	■■■□□ 2.87
RAB43-208	ENST00000615093	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.97	■■■□□ 2.87
RAB43-208	ENST00000615093	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.97	■■■□□ 2.87
RAB43-208	ENST00000615093	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.96	■■■□□ 2.87
RAB43-208	ENST00000615093		E9PCH4	1651 aa		32.94	■■■□□ 2.86
RAB43-208	ENST00000615093	NUP155	O75694	1391 aa		32.88	■■■□□ 2.85
RAB43-208	ENST00000615093	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.86	■■■□□ 2.85
RAB43-208	ENST00000615093	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.85	■■■□□ 2.85
RAB43-208	ENST00000615093	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.83	■■■□□ 2.85
RAB43-208	ENST00000615093	TOM1	O60784	492 aa		32.81	■■■□□ 2.84
RAB43-208	ENST00000615093	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.78	■■■□□ 2.84
RAB43-208	ENST00000615093	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.77	■■■□□ 2.84
RAB43-208	ENST00000615093	NAIP	Q13075	1403 aa		32.77	■■■□□ 2.84
RAB43-208	ENST00000615093	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.74	■■■□□ 2.83
RAB43-208	ENST00000615093	PIP4K2B	P78356	416 aa		32.73	■■■□□ 2.83
RAB43-208	ENST00000615093	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.72	■■■□□ 2.83
RAB43-208	ENST00000615093	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83

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