RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613922.1

CCL3-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL3, Length 778 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3-204ENST00000613922 NCOA1Q15788 1441 aa26.88■■□□□ 1.89
CCL3-204ENST00000613922 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.88■■□□□ 1.89
CCL3-204ENST00000613922 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CCL3-204ENST00000613922 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CCL3-204ENST00000613922 PTPRTO14522 1441 aa26.85■■□□□ 1.89
CCL3-204ENST00000613922 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.85■■□□□ 1.89
CCL3-204ENST00000613922 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CCL3-204ENST00000613922 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CCL3-204ENST00000613922 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.84■■□□□ 1.89
CCL3-204ENST00000613922 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.83■■□□□ 1.89
CCL3-204ENST00000613922 PZPP20742 1482 aa26.82■■□□□ 1.88
CCL3-204ENST00000613922 ABCC5O15440 1437 aa26.82■■□□□ 1.88
CCL3-204ENST00000613922 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CCL3-204ENST00000613922 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.8■■□□□ 1.88
CCL3-204ENST00000613922 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.8■■□□□ 1.88
CCL3-204ENST00000613922 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CCL3-204ENST00000613922 CERKQ8TCT0 537 aa26.78■■□□□ 1.88
CCL3-204ENST00000613922 PLA2R1Q13018 1463 aa26.78■■□□□ 1.88
CCL3-204ENST00000613922 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.78■■□□□ 1.88
CCL3-204ENST00000613922 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.77■■□□□ 1.88
CCL3-204ENST00000613922 DAPK1P53355 1430 aa26.77■■□□□ 1.88
CCL3-204ENST00000613922 ABCC3O15438 1527 aa26.75■■□□□ 1.87
CCL3-204ENST00000613922 TNRQ92752 1358 aa26.74■■□□□ 1.87
CCL3-204ENST00000613922 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
CCL3-204ENST00000613922 KIF15Q9NS87 1388 aa26.73■■□□□ 1.87
CCL3-204ENST00000613922 CEP152O94986 1710 aa26.71■■□□□ 1.87
CCL3-204ENST00000613922 ERBINQ96RT1 1412 aa26.71■■□□□ 1.87
CCL3-204ENST00000613922 PKD2Q13563 968 aa26.69■■□□□ 1.86
CCL3-204ENST00000613922 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.68■■□□□ 1.86
CCL3-204ENST00000613922 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
CCL3-204ENST00000613922 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.67■■□□□ 1.86
CCL3-204ENST00000613922 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.67■■□□□ 1.86
CCL3-204ENST00000613922 DEPDC5O75140 1603 aa26.66■■□□□ 1.86
CCL3-204ENST00000613922 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.66■■□□□ 1.86
CCL3-204ENST00000613922 NLRP1Q9C000 1473 aa26.66■■□□□ 1.86
CCL3-204ENST00000613922 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
CCL3-204ENST00000613922 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
CCL3-204ENST00000613922 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.63■■□□□ 1.85
CCL3-204ENST00000613922 ADGRL2O95490 1459 aa26.62■■□□□ 1.85
CCL3-204ENST00000613922 ERVK-7P63135 1459 aa26.62■■□□□ 1.85
CCL3-204ENST00000613922 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.59■■□□□ 1.85
CCL3-204ENST00000613922 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.58■■□□□ 1.85
CCL3-204ENST00000613922 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.58■■□□□ 1.85
CCL3-204ENST00000613922 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.58■■□□□ 1.85
CCL3-204ENST00000613922 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.56■■□□□ 1.84
CCL3-204ENST00000613922 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CCL3-204ENST00000613922 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.54■■□□□ 1.84
CCL3-204ENST00000613922 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CCL3-204ENST00000613922 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
CCL3-204ENST00000613922 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.52■■□□□ 1.84
CCL3-204ENST00000613922 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
CCL3-204ENST00000613922 KANK1Q14678 1352 aa26.51■■□□□ 1.83
CCL3-204ENST00000613922 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.5■■□□□ 1.83
CCL3-204ENST00000613922 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
CCL3-204ENST00000613922 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.48■■□□□ 1.83
CCL3-204ENST00000613922 MED14O60244 1454 aa26.48■■□□□ 1.83
CCL3-204ENST00000613922 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.45■■□□□ 1.82
CCL3-204ENST00000613922 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CCL3-204ENST00000613922 IQGAP1P46940 1657 aa26.42■■□□□ 1.82
CCL3-204ENST00000613922 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.42■■□□□ 1.82
CCL3-204ENST00000613922 PIK3C2BO00750 1634 aa26.39■■□□□ 1.82
CCL3-204ENST00000613922 ROCK1Q13464 1354 aa26.39■■□□□ 1.82
CCL3-204ENST00000613922 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
CCL3-204ENST00000613922 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.38■■□□□ 1.81
CCL3-204ENST00000613922 SLIT1O75093 1534 aa26.38■■□□□ 1.81
CCL3-204ENST00000613922 CPS1P31327 1500 aa26.37■■□□□ 1.81
CCL3-204ENST00000613922 SYNMO15061 1565 aa26.37■■□□□ 1.81
CCL3-204ENST00000613922 NOS1P29475 1434 aa26.36■■□□□ 1.81
CCL3-204ENST00000613922 UNC13BO14795 1591 aa26.36■■□□□ 1.81
CCL3-204ENST00000613922 TET3O43151 1660 aa26.34■■□□□ 1.81
CCL3-204ENST00000613922 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CCL3-204ENST00000613922 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
CCL3-204ENST00000613922 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
CCL3-204ENST00000613922 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.32■■□□□ 1.8
CCL3-204ENST00000613922 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.29■■□□□ 1.8
CCL3-204ENST00000613922 IDI1Q13907 227 aa26.29■■□□□ 1.8
CCL3-204ENST00000613922 LTKP29376 864 aa26.28■■□□□ 1.8
CCL3-204ENST00000613922 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.27■■□□□ 1.8
CCL3-204ENST00000613922 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.26■■□□□ 1.79
CCL3-204ENST00000613922 ADGRB3O60242 1522 aa26.25■■□□□ 1.79
CCL3-204ENST00000613922 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.25■■□□□ 1.79
CCL3-204ENST00000613922 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.25■■□□□ 1.79
CCL3-204ENST00000613922 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CCL3-204ENST00000613922 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.24■■□□□ 1.79
CCL3-204ENST00000613922 E9PCH4 1651 aa26.23■■□□□ 1.79
CCL3-204ENST00000613922 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.23■■□□□ 1.79
CCL3-204ENST00000613922 ITGAEP38570 1179 aa26.22■■□□□ 1.79
CCL3-204ENST00000613922 EID1Q9Y6B2 187 aa26.22■■□□□ 1.79
CCL3-204ENST00000613922 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.21■■□□□ 1.79
CCL3-204ENST00000613922 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.17■■□□□ 1.78
CCL3-204ENST00000613922 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.15■■□□□ 1.78
CCL3-204ENST00000613922 NUP155O75694 1391 aa26.14■■□□□ 1.78
CCL3-204ENST00000613922 ALKQ9UM73 1620 aa26.13■■□□□ 1.77
CCL3-204ENST00000613922 TOM1O60784 492 aa26.12■■□□□ 1.77
CCL3-204ENST00000613922 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CCL3-204ENST00000613922 ZFYVE9O95405 1425 aa26.1■■□□□ 1.77
CCL3-204ENST00000613922 NAIPQ13075 1403 aa26.05■■□□□ 1.76
CCL3-204ENST00000613922 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.05■■□□□ 1.76
CCL3-204ENST00000613922 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.05■■□□□ 1.76
CCL3-204ENST00000613922 PIP4K2BP78356 416 aa26.03■■□□□ 1.76
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