RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613811.4

RAPGEFL1-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEFL1, Length 1,744 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEFL1-211ENST00000613811 MPHOSPH9Q99550 1183 aa45.21■■■■■ 4.83
RAPGEFL1-211ENST00000613811 NUP155O75694 1391 aa45.2■■■■■ 4.83
RAPGEFL1-211ENST00000613811 IQGAP3Q86VI3 1631 aa45.15■■■■■ 4.82
RAPGEFL1-211ENST00000613811 BCORL1Q5H9F3 1711 aa45.15■■■■■ 4.82
RAPGEFL1-211ENST00000613811 FAM135AQ9P2D6 1515 aa45.12■■■■■ 4.81
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP45.12■■■■■ 4.81
RAPGEFL1-211ENST00000613811 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP45.12■■■■■ 4.81
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa45.11■■■■■ 4.81
RAPGEFL1-211ENST00000613811 MROH1Q8NDA8 1641 aa45.1■■■■■ 4.81
RAPGEFL1-211ENST00000613811 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP45.1■■■■■ 4.81
RAPGEFL1-211ENST00000613811 KIF3BO15066 747 aa45.09■■■■■ 4.81
RAPGEFL1-211ENST00000613811 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP45.08■■■■■ 4.81
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ATP10AO60312 1499 aa45.06■■■■■ 4.8
RAPGEFL1-211ENST00000613811 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP45.06■■■■■ 4.8
RAPGEFL1-211ENST00000613811 REREQ9P2R6 1566 aa45.04■■■■■ 4.8
RAPGEFL1-211ENST00000613811 VWDEQ8N2E2 1590 aa45■■■■■ 4.79
RAPGEFL1-211ENST00000613811 FOXD1Q16676 465 aa44.99■■■■■ 4.79
RAPGEFL1-211ENST00000613811 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa44.97■■■■■ 4.79
RAPGEFL1-211ENST00000613811 PKD2Q13563 968 aa44.95■■■■■ 4.79
RAPGEFL1-211ENST00000613811 SIN3AQ96ST3 1273 aa44.9■■■■■ 4.78
RAPGEFL1-211ENST00000613811 KANK1Q14678 1352 aa44.89■■■■■ 4.78
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CEP152O94986 1710 aa44.89■■■■■ 4.78
RAPGEFL1-211ENST00000613811 TET3O43151 1660 aa44.88■■■■■ 4.78
RAPGEFL1-211ENST00000613811 AGLP35573 1532 aa44.88■■■■■ 4.77
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa44.87■■■■■ 4.77
RAPGEFL1-211ENST00000613811 E9PCH4 1651 aa44.83■■■■■ 4.77
RAPGEFL1-211ENST00000613811 GGT6Q6P531 493 aa44.82■■■■■ 4.77
RAPGEFL1-211ENST00000613811 NEUROD1Q13562 356 aa44.78■■■■■ 4.76
RAPGEFL1-211ENST00000613811 LMTK2Q8IWU2 1503 aa44.78■■■■■ 4.76
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ABCC3O15438 1527 aa44.74■■■■■ 4.75
RAPGEFL1-211ENST00000613811 EFCAB6Q5THR3 1501 aa44.73■■■■■ 4.75
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP44.72■■■■■ 4.75
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa44.67■■■■■ 4.74
RAPGEFL1-211ENST00000613811 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP44.65■■■■■ 4.74
RAPGEFL1-211ENST00000613811 PLA2R1Q13018 1463 aa44.64■■■■■ 4.74
RAPGEFL1-211ENST00000613811 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa44.64■■■■■ 4.74
RAPGEFL1-211ENST00000613811 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa44.63■■■■■ 4.74
RAPGEFL1-211ENST00000613811 TONSLQ96HA7 1378 aa44.54■■■■■ 4.72
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP44.53■■■■■ 4.72
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP44.53■■■■■ 4.72
RAPGEFL1-211ENST00000613811 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa44.53■■■■■ 4.72
RAPGEFL1-211ENST00000613811 TRPM2O94759 1503 aa44.52■■■■■ 4.72
RAPGEFL1-211ENST00000613811 PTPRTO14522 1441 aa44.52■■■■■ 4.72
RAPGEFL1-211ENST00000613811 NPATQ14207 1427 aa44.52■■■■■ 4.72
RAPGEFL1-211ENST00000613811 MLECQ14165 292 aa44.51■■■■■ 4.72
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP44.5■■■■■ 4.71
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CCDC144AA2RUR9 1427 aa44.48■■■■■ 4.71
RAPGEFL1-211ENST00000613811 PPP6R1Q9UPN7 881 aa44.48■■■■■ 4.71
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa44.44■■■■■ 4.7
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CLTCL1P53675 1640 aa44.42■■■■■ 4.7
RAPGEFL1-211ENST00000613811 PREX1Q8TCU6 1659 aa44.35■■■■■ 4.69
RAPGEFL1-211ENST00000613811 UGGT1Q9NYU2 1555 aa44.33■■■■■ 4.69
RAPGEFL1-211ENST00000613811 L3MBTL2Q969R5 705 aa44.32■■■■■ 4.69
RAPGEFL1-211ENST00000613811 NOS1P29475 1434 aa44.31■■■■■ 4.68
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CNTLNQ9NXG0 1405 aa44.3■■■■■ 4.68
RAPGEFL1-211ENST00000613811 SYNMO15061 1565 aa44.29■■■■■ 4.68
RAPGEFL1-211ENST00000613811 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP44.28■■■■■ 4.68
RAPGEFL1-211ENST00000613811 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa44.27■■■■■ 4.68
RAPGEFL1-211ENST00000613811 MROH2AA6NES4 1674 aa44.26■■■■■ 4.68
RAPGEFL1-211ENST00000613811 KIF1BO60333 1816 aa44.24■■■■■ 4.67
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP44.24■■■■■ 4.67
RAPGEFL1-211ENST00000613811 PIK3C2BO00750 1634 aa44.22■■■■■ 4.67
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ERVK-7P63135 1459 aa44.2■■■■■ 4.67
RAPGEFL1-211ENST00000613811 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa44.2■■■■■ 4.67
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ZMYM3Q14202 1370 aa44.17■■■■■ 4.66
RAPGEFL1-211ENST00000613811 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa44.15■■■■■ 4.66
RAPGEFL1-211ENST00000613811 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP44.15■■■■■ 4.66
RAPGEFL1-211ENST00000613811 NEURL4Q96JN8 1562 aa44.14■■■■■ 4.66
RAPGEFL1-211ENST00000613811 RGL3Q3MIN7 710 aa44.1■■■■■ 4.65
RAPGEFL1-211ENST00000613811 MADDQ8WXG6 1647 aa44.09■■■■■ 4.65
RAPGEFL1-211ENST00000613811 C3P01024 1663 aa44.08■■■■■ 4.65
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ADGRB3O60242 1522 aa44.07■■■■■ 4.65
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ADAMTSL3P82987 1691 aa44.06■■■■■ 4.64
RAPGEFL1-211ENST00000613811 DCAF11Q8TEB1 546 aa44.02■■■■■ 4.64
RAPGEFL1-211ENST00000613811 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
RAPGEFL1-211ENST00000613811 SLC52A1Q9NWF4 448 aa43.99■■■■■ 4.63
RAPGEFL1-211ENST00000613811 NBPF8Q3BBV2 869 aa43.99■■■■■ 4.63
RAPGEFL1-211ENST00000613811 MYO5BQ9ULV0 1848 aa43.99■■■■■ 4.63
RAPGEFL1-211ENST00000613811 IFT172Q9UG01 1749 aa43.98■■■■■ 4.63
RAPGEFL1-211ENST00000613811 IDI1Q13907 227 aa43.97■■■■■ 4.63
RAPGEFL1-211ENST00000613811 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa43.97■■■■■ 4.63
RAPGEFL1-211ENST00000613811 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa43.96■■■■■ 4.63
RAPGEFL1-211ENST00000613811 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa43.94■■■■■ 4.62
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CHGAP10645 457 aaKnown RBP43.92■■■■■ 4.62
RAPGEFL1-211ENST00000613811 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP43.9■■■■■ 4.62
RAPGEFL1-211ENST00000613811 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
RAPGEFL1-211ENST00000613811 PPLO60437 1756 aa43.88■■■■■ 4.62
RAPGEFL1-211ENST00000613811 TNRQ92752 1358 aa43.87■■■■■ 4.61
RAPGEFL1-211ENST00000613811 PRAG1Q86YV5 1406 aa43.87■■■■■ 4.61
RAPGEFL1-211ENST00000613811 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa43.81■■■■■ 4.6
RAPGEFL1-211ENST00000613811 MYOM2P54296 1465 aa43.79■■■■■ 4.6
RAPGEFL1-211ENST00000613811 RALGAPBQ86X10 1494 aa43.78■■■■■ 4.6
RAPGEFL1-211ENST00000613811 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa43.78■■■■■ 4.6
RAPGEFL1-211ENST00000613811 PLPPR3Q6T4P5 718 aa43.76■■■■■ 4.6
RAPGEFL1-211ENST00000613811 STAC3Q96MF2 364 aa43.74■■■■■ 4.59
RAPGEFL1-211ENST00000613811 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
RAPGEFL1-211ENST00000613811 A2ML1A8K2U0 1454 aa43.72■■■■■ 4.59
RAPGEFL1-211ENST00000613811 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa43.72■■■■■ 4.59
RAPGEFL1-211ENST00000613811 UBR1Q8IWV7 1749 aa43.71■■■■■ 4.59
RAPGEFL1-211ENST00000613811 NLRP1Q9C000 1473 aa43.7■■■■■ 4.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms