RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610454.4

SENP3-209, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-209ENST00000610454 KIF15Q9NS87 1388 aa20.61■□□□□ 0.89
SENP3-209ENST00000610454 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.61■□□□□ 0.89
SENP3-209ENST00000610454 HSPA2P54652 639 aa20.6■□□□□ 0.89
SENP3-209ENST00000610454 NPATQ14207 1427 aa20.6■□□□□ 0.89
SENP3-209ENST00000610454 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.59■□□□□ 0.89
SENP3-209ENST00000610454 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.59■□□□□ 0.89
SENP3-209ENST00000610454 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SENP3-209ENST00000610454 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.59■□□□□ 0.89
SENP3-209ENST00000610454 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SENP3-209ENST00000610454 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.58■□□□□ 0.89
SENP3-209ENST00000610454 ERBINQ96RT1 1412 aa20.56■□□□□ 0.88
SENP3-209ENST00000610454 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SENP3-209ENST00000610454 PTPRKQ15262 1439 aa20.53■□□□□ 0.88
SENP3-209ENST00000610454 ADGRL2O95490 1459 aa20.51■□□□□ 0.87
SENP3-209ENST00000610454 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.51■□□□□ 0.87
SENP3-209ENST00000610454 NCOA1Q15788 1441 aa20.51■□□□□ 0.87
SENP3-209ENST00000610454 PZPP20742 1482 aa20.5■□□□□ 0.87
SENP3-209ENST00000610454 ABCC3O15438 1527 aa20.49■□□□□ 0.87
SENP3-209ENST00000610454 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.49■□□□□ 0.87
SENP3-209ENST00000610454 CEP152O94986 1710 aa20.48■□□□□ 0.87
SENP3-209ENST00000610454 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SENP3-209ENST00000610454 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SENP3-209ENST00000610454 KANK1Q14678 1352 aa20.47■□□□□ 0.87
SENP3-209ENST00000610454 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
SENP3-209ENST00000610454 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SENP3-209ENST00000610454 DEPDC5O75140 1603 aa20.45■□□□□ 0.87
SENP3-209ENST00000610454 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.45■□□□□ 0.87
SENP3-209ENST00000610454 TNRQ92752 1358 aa20.45■□□□□ 0.86
SENP3-209ENST00000610454 ITGAEP38570 1179 aa20.44■□□□□ 0.86
SENP3-209ENST00000610454 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
SENP3-209ENST00000610454 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SENP3-209ENST00000610454 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.43■□□□□ 0.86
SENP3-209ENST00000610454 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.42■□□□□ 0.86
SENP3-209ENST00000610454 STRCQ7RTU9 1775 aa20.41■□□□□ 0.86
SENP3-209ENST00000610454 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.4■□□□□ 0.86
SENP3-209ENST00000610454 ROCK1Q13464 1354 aa20.4■□□□□ 0.86
SENP3-209ENST00000610454 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SENP3-209ENST00000610454 NLRP1Q9C000 1473 aa20.38■□□□□ 0.85
SENP3-209ENST00000610454 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SENP3-209ENST00000610454 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.37■□□□□ 0.85
SENP3-209ENST00000610454 ERVK-7P63135 1459 aa20.37■□□□□ 0.85
SENP3-209ENST00000610454 PLA2R1Q13018 1463 aa20.35■□□□□ 0.85
SENP3-209ENST00000610454 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.35■□□□□ 0.85
SENP3-209ENST00000610454 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.34■□□□□ 0.85
SENP3-209ENST00000610454 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.33■□□□□ 0.85
SENP3-209ENST00000610454 PTPRTO14522 1441 aa20.33■□□□□ 0.84
SENP3-209ENST00000610454 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.33■□□□□ 0.84
SENP3-209ENST00000610454 PKD2Q13563 968 aa20.32■□□□□ 0.84
SENP3-209ENST00000610454 UNC13BO14795 1591 aa20.3■□□□□ 0.84
SENP3-209ENST00000610454 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SENP3-209ENST00000610454 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.3■□□□□ 0.84
SENP3-209ENST00000610454 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.29■□□□□ 0.84
SENP3-209ENST00000610454 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SENP3-209ENST00000610454 TET3O43151 1660 aa20.27■□□□□ 0.84
SENP3-209ENST00000610454 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.26■□□□□ 0.83
SENP3-209ENST00000610454 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SENP3-209ENST00000610454 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.24■□□□□ 0.83
SENP3-209ENST00000610454 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.23■□□□□ 0.83
SENP3-209ENST00000610454 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.23■□□□□ 0.83
SENP3-209ENST00000610454 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.23■□□□□ 0.83
SENP3-209ENST00000610454 NUP155O75694 1391 aa20.21■□□□□ 0.83
SENP3-209ENST00000610454 PIK3C2BO00750 1634 aa20.2■□□□□ 0.82
SENP3-209ENST00000610454 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SENP3-209ENST00000610454 CERKQ8TCT0 537 aa20.2■□□□□ 0.82
SENP3-209ENST00000610454 SYNMO15061 1565 aa20.19■□□□□ 0.82
SENP3-209ENST00000610454 NOS1P29475 1434 aa20.19■□□□□ 0.82
SENP3-209ENST00000610454 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.17■□□□□ 0.82
SENP3-209ENST00000610454 FBXO41Q8TF61 875 aa20.17■□□□□ 0.82
SENP3-209ENST00000610454 NAIPQ13075 1403 aa20.17■□□□□ 0.82
SENP3-209ENST00000610454 E9PCH4 1651 aa20.16■□□□□ 0.82
SENP3-209ENST00000610454 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SENP3-209ENST00000610454 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.15■□□□□ 0.82
SENP3-209ENST00000610454 HFM1A2PYH4 1435 aa20.15■□□□□ 0.82
SENP3-209ENST00000610454 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SENP3-209ENST00000610454 IQGAP1P46940 1657 aa20.15■□□□□ 0.82
SENP3-209ENST00000610454 IDI1Q13907 227 aa20.14■□□□□ 0.81
SENP3-209ENST00000610454 EID1Q9Y6B2 187 aa20.14■□□□□ 0.81
SENP3-209ENST00000610454 ADGRB3O60242 1522 aa20.13■□□□□ 0.81
SENP3-209ENST00000610454 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SENP3-209ENST00000610454 SLIT1O75093 1534 aa20.12■□□□□ 0.81
SENP3-209ENST00000610454 MED14O60244 1454 aa20.12■□□□□ 0.81
SENP3-209ENST00000610454 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SENP3-209ENST00000610454 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.12■□□□□ 0.81
SENP3-209ENST00000610454 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.11■□□□□ 0.81
SENP3-209ENST00000610454 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.1■□□□□ 0.81
SENP3-209ENST00000610454 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.09■□□□□ 0.81
SENP3-209ENST00000610454 TRIM52Q96A61 297 aa20.09■□□□□ 0.81
SENP3-209ENST00000610454 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SENP3-209ENST00000610454 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.07■□□□□ 0.8
SENP3-209ENST00000610454 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.05■□□□□ 0.8
SENP3-209ENST00000610454 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.05■□□□□ 0.8
SENP3-209ENST00000610454 LTKP29376 864 aa20.05■□□□□ 0.8
SENP3-209ENST00000610454 CPS1P31327 1500 aa20.03■□□□□ 0.8
SENP3-209ENST00000610454 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa20.03■□□□□ 0.8
SENP3-209ENST00000610454 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SENP3-209ENST00000610454 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SENP3-209ENST00000610454 BCANQ96GW7 911 aa20■□□□□ 0.79
SENP3-209ENST00000610454 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SENP3-209ENST00000610454 RIMS2Q9UQ26 1411 aa19.98■□□□□ 0.79
SENP3-209ENST00000610454 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms