RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 REREQ9P2R6 1566 aa18.94■□□□□ 0.62
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RABGEF1-209ENST00000607882 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
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RABGEF1-209ENST00000607882 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa18.82■□□□□ 0.6
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RABGEF1-209ENST00000607882 NUP155O75694 1391 aa18.72■□□□□ 0.59
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RABGEF1-209ENST00000607882 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
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RABGEF1-209ENST00000607882 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
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RABGEF1-209ENST00000607882 NAIPQ13075 1403 aa18.66■□□□□ 0.58
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RABGEF1-209ENST00000607882 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
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RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
RABGEF1-209ENST00000607882 A2ML1A8K2U0 1454 aa18.59■□□□□ 0.57
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RABGEF1-209ENST00000607882 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 VWDEQ8N2E2 1590 aa18.57■□□□□ 0.56
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RABGEF1-209ENST00000607882 EFCAB6Q5THR3 1501 aa18.56■□□□□ 0.56
RABGEF1-209ENST00000607882 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa18.56■□□□□ 0.56
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RABGEF1-209ENST00000607882 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.55■□□□□ 0.56
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RABGEF1-209ENST00000607882 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 EID1Q9Y6B2 187 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 NEURL4Q96JN8 1562 aa18.44■□□□□ 0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.44■□□□□ 0.54
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RABGEF1-209ENST00000607882 PLA2R1Q13018 1463 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
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