RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 ZMYM3Q14202 1370 aa26.7■■□□□ 1.86
HERC3-214ENST00000601319 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
HERC3-214ENST00000601319 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.69■■□□□ 1.86
HERC3-214ENST00000601319 GGT6Q6P531 493 aa26.69■■□□□ 1.86
HERC3-214ENST00000601319 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.68■■□□□ 1.86
HERC3-214ENST00000601319 ERBINQ96RT1 1412 aa26.66■■□□□ 1.86
HERC3-214ENST00000601319 DEPDC5O75140 1603 aa26.66■■□□□ 1.86
HERC3-214ENST00000601319 KIF3BO15066 747 aa26.66■■□□□ 1.86
HERC3-214ENST00000601319 KIF15Q9NS87 1388 aa26.65■■□□□ 1.86
HERC3-214ENST00000601319 ADGRL2O95490 1459 aa26.65■■□□□ 1.86
HERC3-214ENST00000601319 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
HERC3-214ENST00000601319 PTPRKQ15262 1439 aa26.64■■□□□ 1.85
HERC3-214ENST00000601319 CEP152O94986 1710 aa26.62■■□□□ 1.85
HERC3-214ENST00000601319 ABCC3O15438 1527 aa26.61■■□□□ 1.85
HERC3-214ENST00000601319 PZPP20742 1482 aa26.61■■□□□ 1.85
HERC3-214ENST00000601319 STRCQ7RTU9 1775 aa26.61■■□□□ 1.85
HERC3-214ENST00000601319 HSPA2P54652 639 aa26.59■■□□□ 1.85
HERC3-214ENST00000601319 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.58■■□□□ 1.85
HERC3-214ENST00000601319 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.58■■□□□ 1.85
HERC3-214ENST00000601319 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
HERC3-214ENST00000601319 NCOA1Q15788 1441 aa26.56■■□□□ 1.84
HERC3-214ENST00000601319 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.53■■□□□ 1.84
HERC3-214ENST00000601319 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
HERC3-214ENST00000601319 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
HERC3-214ENST00000601319 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.5■■□□□ 1.83
HERC3-214ENST00000601319 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.5■■□□□ 1.83
HERC3-214ENST00000601319 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.49■■□□□ 1.83
HERC3-214ENST00000601319 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.47■■□□□ 1.83
HERC3-214ENST00000601319 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.46■■□□□ 1.83
HERC3-214ENST00000601319 TNRQ92752 1358 aa26.45■■□□□ 1.82
HERC3-214ENST00000601319 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.44■■□□□ 1.82
HERC3-214ENST00000601319 PLA2R1Q13018 1463 aa26.44■■□□□ 1.82
HERC3-214ENST00000601319 ROCK1Q13464 1354 aa26.44■■□□□ 1.82
HERC3-214ENST00000601319 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
HERC3-214ENST00000601319 ERVK-7P63135 1459 aa26.42■■□□□ 1.82
HERC3-214ENST00000601319 NLRP1Q9C000 1473 aa26.42■■□□□ 1.82
HERC3-214ENST00000601319 UNC13BO14795 1591 aa26.42■■□□□ 1.82
HERC3-214ENST00000601319 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.42■■□□□ 1.82
HERC3-214ENST00000601319 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.41■■□□□ 1.82
HERC3-214ENST00000601319 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
HERC3-214ENST00000601319 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
HERC3-214ENST00000601319 KANK1Q14678 1352 aa26.39■■□□□ 1.82
HERC3-214ENST00000601319 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
HERC3-214ENST00000601319 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
HERC3-214ENST00000601319 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.38■■□□□ 1.81
HERC3-214ENST00000601319 PTPRTO14522 1441 aa26.38■■□□□ 1.81
HERC3-214ENST00000601319 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.36■■□□□ 1.81
HERC3-214ENST00000601319 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.35■■□□□ 1.81
HERC3-214ENST00000601319 TET3O43151 1660 aa26.34■■□□□ 1.81
HERC3-214ENST00000601319 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.33■■□□□ 1.8
HERC3-214ENST00000601319 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.32■■□□□ 1.8
HERC3-214ENST00000601319 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.31■■□□□ 1.8
HERC3-214ENST00000601319 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
HERC3-214ENST00000601319 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
HERC3-214ENST00000601319 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.28■■□□□ 1.8
HERC3-214ENST00000601319 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
HERC3-214ENST00000601319 SYNMO15061 1565 aa26.25■■□□□ 1.79
HERC3-214ENST00000601319 PKD2Q13563 968 aa26.25■■□□□ 1.79
HERC3-214ENST00000601319 PIK3C2BO00750 1634 aa26.25■■□□□ 1.79
HERC3-214ENST00000601319 E9PCH4 1651 aa26.22■■□□□ 1.79
HERC3-214ENST00000601319 NOS1P29475 1434 aa26.21■■□□□ 1.79
HERC3-214ENST00000601319 ITGAEP38570 1179 aa26.2■■□□□ 1.78
HERC3-214ENST00000601319 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.19■■□□□ 1.78
HERC3-214ENST00000601319 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.18■■□□□ 1.78
HERC3-214ENST00000601319 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
HERC3-214ENST00000601319 MED14O60244 1454 aa26.17■■□□□ 1.78
HERC3-214ENST00000601319 IQGAP1P46940 1657 aa26.17■■□□□ 1.78
HERC3-214ENST00000601319 SLIT1O75093 1534 aa26.16■■□□□ 1.78
HERC3-214ENST00000601319 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.14■■□□□ 1.78
HERC3-214ENST00000601319 ADGRB3O60242 1522 aa26.14■■□□□ 1.77
HERC3-214ENST00000601319 NAIPQ13075 1403 aa26.14■■□□□ 1.77
HERC3-214ENST00000601319 HFM1A2PYH4 1435 aa26.12■■□□□ 1.77
HERC3-214ENST00000601319 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
HERC3-214ENST00000601319 CERKQ8TCT0 537 aa26.1■■□□□ 1.77
HERC3-214ENST00000601319 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.1■■□□□ 1.77
HERC3-214ENST00000601319 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.09■■□□□ 1.77
HERC3-214ENST00000601319 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.09■■□□□ 1.77
HERC3-214ENST00000601319 FBXO41Q8TF61 875 aa26.09■■□□□ 1.77
HERC3-214ENST00000601319 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.08■■□□□ 1.76
HERC3-214ENST00000601319 NUP155O75694 1391 aa26.07■■□□□ 1.76
HERC3-214ENST00000601319 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
HERC3-214ENST00000601319 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
HERC3-214ENST00000601319 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.05■■□□□ 1.76
HERC3-214ENST00000601319 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.03■■□□□ 1.76
HERC3-214ENST00000601319 IDI1Q13907 227 aa26.01■■□□□ 1.75
HERC3-214ENST00000601319 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.01■■□□□ 1.75
HERC3-214ENST00000601319 CPS1P31327 1500 aa26■■□□□ 1.75
HERC3-214ENST00000601319 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
HERC3-214ENST00000601319 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.96■■□□□ 1.75
HERC3-214ENST00000601319 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.94■■□□□ 1.74
HERC3-214ENST00000601319 TRPM2O94759 1503 aa25.93■■□□□ 1.74
HERC3-214ENST00000601319 ZFYVE9O95405 1425 aa25.92■■□□□ 1.74
HERC3-214ENST00000601319 LTKP29376 864 aa25.92■■□□□ 1.74
HERC3-214ENST00000601319 EID1Q9Y6B2 187 aa25.91■■□□□ 1.74
HERC3-214ENST00000601319 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.9■■□□□ 1.74
HERC3-214ENST00000601319 CLTCL1P53675 1640 aa25.88■■□□□ 1.73
HERC3-214ENST00000601319 KIF1BO60333 1816 aa25.87■■□□□ 1.73
HERC3-214ENST00000601319 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.84■■□□□ 1.73
HERC3-214ENST00000601319 NWD1Q149M9 1564 aa25.82■■□□□ 1.72
HERC3-214ENST00000601319 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
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