RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597663.2

PGPEP1-207, Transcript of pyroglutamyl-peptidase I, humanhuman

TSL 3

Gene PGPEP1, Length 363 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1-207ENST00000597663 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PGPEP1-207ENST00000597663 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.99■■□□□ 1.43
PGPEP1-207ENST00000597663 ZMYM3Q14202 1370 aa23.99■■□□□ 1.43
PGPEP1-207ENST00000597663 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.99■■□□□ 1.43
PGPEP1-207ENST00000597663 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.99■■□□□ 1.43
PGPEP1-207ENST00000597663 NPATQ14207 1427 aa23.98■■□□□ 1.43
PGPEP1-207ENST00000597663 ERBINQ96RT1 1412 aa23.98■■□□□ 1.43
PGPEP1-207ENST00000597663 CEP152O94986 1710 aa23.96■■□□□ 1.43
PGPEP1-207ENST00000597663 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.96■■□□□ 1.43
PGPEP1-207ENST00000597663 ADGRL2O95490 1459 aa23.96■■□□□ 1.43
PGPEP1-207ENST00000597663 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PGPEP1-207ENST00000597663 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.95■■□□□ 1.42
PGPEP1-207ENST00000597663 DEPDC5O75140 1603 aa23.95■■□□□ 1.42
PGPEP1-207ENST00000597663 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PGPEP1-207ENST00000597663 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PGPEP1-207ENST00000597663 PTPRKQ15262 1439 aa23.93■■□□□ 1.42
PGPEP1-207ENST00000597663 ABCC3O15438 1527 aa23.92■■□□□ 1.42
PGPEP1-207ENST00000597663 HSPA2P54652 639 aa23.91■■□□□ 1.42
PGPEP1-207ENST00000597663 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.91■■□□□ 1.42
PGPEP1-207ENST00000597663 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.91■■□□□ 1.42
PGPEP1-207ENST00000597663 NCOA1Q15788 1441 aa23.91■■□□□ 1.42
PGPEP1-207ENST00000597663 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.91■■□□□ 1.42
PGPEP1-207ENST00000597663 PZPP20742 1482 aa23.9■■□□□ 1.42
PGPEP1-207ENST00000597663 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.89■■□□□ 1.42
PGPEP1-207ENST00000597663 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
PGPEP1-207ENST00000597663 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.85■■□□□ 1.41
PGPEP1-207ENST00000597663 STRCQ7RTU9 1775 aa23.85■■□□□ 1.41
PGPEP1-207ENST00000597663 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PGPEP1-207ENST00000597663 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
PGPEP1-207ENST00000597663 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.79■■□□□ 1.4
PGPEP1-207ENST00000597663 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.79■■□□□ 1.4
PGPEP1-207ENST00000597663 ROCK1Q13464 1354 aa23.78■■□□□ 1.4
PGPEP1-207ENST00000597663 TNRQ92752 1358 aa23.78■■□□□ 1.4
PGPEP1-207ENST00000597663 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.78■■□□□ 1.4
PGPEP1-207ENST00000597663 KANK1Q14678 1352 aa23.78■■□□□ 1.4
PGPEP1-207ENST00000597663 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.77■■□□□ 1.4
PGPEP1-207ENST00000597663 UNC13BO14795 1591 aa23.76■■□□□ 1.39
PGPEP1-207ENST00000597663 ERVK-7P63135 1459 aa23.75■■□□□ 1.39
PGPEP1-207ENST00000597663 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.75■■□□□ 1.39
PGPEP1-207ENST00000597663 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PGPEP1-207ENST00000597663 ITGAEP38570 1179 aa23.73■■□□□ 1.39
PGPEP1-207ENST00000597663 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.73■■□□□ 1.39
PGPEP1-207ENST00000597663 NLRP1Q9C000 1473 aa23.73■■□□□ 1.39
PGPEP1-207ENST00000597663 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.72■■□□□ 1.39
PGPEP1-207ENST00000597663 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.72■■□□□ 1.39
PGPEP1-207ENST00000597663 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
PGPEP1-207ENST00000597663 PLA2R1Q13018 1463 aa23.71■■□□□ 1.39
PGPEP1-207ENST00000597663 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.7■■□□□ 1.39
PGPEP1-207ENST00000597663 TET3O43151 1660 aa23.7■■□□□ 1.38
PGPEP1-207ENST00000597663 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.67■■□□□ 1.38
PGPEP1-207ENST00000597663 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.66■■□□□ 1.38
PGPEP1-207ENST00000597663 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.64■■□□□ 1.38
PGPEP1-207ENST00000597663 PTPRTO14522 1441 aa23.64■■□□□ 1.37
PGPEP1-207ENST00000597663 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.63■■□□□ 1.37
PGPEP1-207ENST00000597663 SYNMO15061 1565 aa23.61■■□□□ 1.37
PGPEP1-207ENST00000597663 PIK3C2BO00750 1634 aa23.6■■□□□ 1.37
PGPEP1-207ENST00000597663 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PGPEP1-207ENST00000597663 E9PCH4 1651 aa23.59■■□□□ 1.37
PGPEP1-207ENST00000597663 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PGPEP1-207ENST00000597663 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.57■■□□□ 1.36
PGPEP1-207ENST00000597663 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.57■■□□□ 1.36
PGPEP1-207ENST00000597663 PKD2Q13563 968 aa23.56■■□□□ 1.36
PGPEP1-207ENST00000597663 NOS1P29475 1434 aa23.55■■□□□ 1.36
PGPEP1-207ENST00000597663 NAIPQ13075 1403 aa23.55■■□□□ 1.36
PGPEP1-207ENST00000597663 HFM1A2PYH4 1435 aa23.53■■□□□ 1.36
PGPEP1-207ENST00000597663 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PGPEP1-207ENST00000597663 IQGAP1P46940 1657 aa23.51■■□□□ 1.35
PGPEP1-207ENST00000597663 NUP155O75694 1391 aa23.51■■□□□ 1.35
PGPEP1-207ENST00000597663 ADGRB3O60242 1522 aa23.5■■□□□ 1.35
PGPEP1-207ENST00000597663 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.49■■□□□ 1.35
PGPEP1-207ENST00000597663 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.48■■□□□ 1.35
PGPEP1-207ENST00000597663 SLIT1O75093 1534 aa23.48■■□□□ 1.35
PGPEP1-207ENST00000597663 MED14O60244 1454 aa23.46■■□□□ 1.35
PGPEP1-207ENST00000597663 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.46■■□□□ 1.35
PGPEP1-207ENST00000597663 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.46■■□□□ 1.35
PGPEP1-207ENST00000597663 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.46■■□□□ 1.35
PGPEP1-207ENST00000597663 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PGPEP1-207ENST00000597663 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PGPEP1-207ENST00000597663 IDI1Q13907 227 aa23.41■■□□□ 1.34
PGPEP1-207ENST00000597663 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.41■■□□□ 1.34
PGPEP1-207ENST00000597663 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.41■■□□□ 1.34
PGPEP1-207ENST00000597663 CERKQ8TCT0 537 aa23.4■■□□□ 1.34
PGPEP1-207ENST00000597663 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.4■■□□□ 1.34
PGPEP1-207ENST00000597663 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.39■■□□□ 1.33
PGPEP1-207ENST00000597663 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PGPEP1-207ENST00000597663 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PGPEP1-207ENST00000597663 FBXO41Q8TF61 875 aa23.35■■□□□ 1.33
PGPEP1-207ENST00000597663 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.34■■□□□ 1.33
PGPEP1-207ENST00000597663 EID1Q9Y6B2 187 aa23.33■■□□□ 1.33
PGPEP1-207ENST00000597663 TRPM2O94759 1503 aa23.33■■□□□ 1.32
PGPEP1-207ENST00000597663 TRIM52Q96A61 297 aa23.32■■□□□ 1.32
PGPEP1-207ENST00000597663 CLTCL1P53675 1640 aa23.31■■□□□ 1.32
PGPEP1-207ENST00000597663 LTKP29376 864 aa23.31■■□□□ 1.32
PGPEP1-207ENST00000597663 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.31■■□□□ 1.32
PGPEP1-207ENST00000597663 CPS1P31327 1500 aa23.31■■□□□ 1.32
PGPEP1-207ENST00000597663 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.31■■□□□ 1.32
PGPEP1-207ENST00000597663 KIF1BO60333 1816 aa23.31■■□□□ 1.32
PGPEP1-207ENST00000597663 ZFYVE9O95405 1425 aa23.28■■□□□ 1.32
PGPEP1-207ENST00000597663 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.26■■□□□ 1.31
PGPEP1-207ENST00000597663 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms