RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594965.1

GTF2F1-204, Transcript of general transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF2F1, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1-204ENST00000594965 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.65■■■■□ 3.14
GTF2F1-204ENST00000594965 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.65■■■■□ 3.14
GTF2F1-204ENST00000594965 PTPRKQ15262 1439 aa34.64■■■■□ 3.14
GTF2F1-204ENST00000594965 KDM5DQ9BY66 1539 aa34.64■■■■□ 3.14
GTF2F1-204ENST00000594965 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.6■■■■□ 3.13
GTF2F1-204ENST00000594965 STRCQ7RTU9 1775 aa34.6■■■■□ 3.13
GTF2F1-204ENST00000594965 KIF15Q9NS87 1388 aa34.58■■■■□ 3.13
GTF2F1-204ENST00000594965 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.57■■■■□ 3.12
GTF2F1-204ENST00000594965 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.55■■■■□ 3.12
GTF2F1-204ENST00000594965 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34.55■■■■□ 3.12
GTF2F1-204ENST00000594965 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
GTF2F1-204ENST00000594965 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
GTF2F1-204ENST00000594965 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
GTF2F1-204ENST00000594965 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.53■■■■□ 3.12
GTF2F1-204ENST00000594965 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
GTF2F1-204ENST00000594965 ERBINQ96RT1 1412 aa34.52■■■■□ 3.12
GTF2F1-204ENST00000594965 ABCC3O15438 1527 aa34.51■■■■□ 3.12
GTF2F1-204ENST00000594965 CEP152O94986 1710 aa34.51■■■■□ 3.12
GTF2F1-204ENST00000594965 PZPP20742 1482 aa34.51■■■■□ 3.11
GTF2F1-204ENST00000594965 ADGRL2O95490 1459 aa34.5■■■■□ 3.11
GTF2F1-204ENST00000594965 NCOA1Q15788 1441 aa34.49■■■■□ 3.11
GTF2F1-204ENST00000594965 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.49■■■■□ 3.11
GTF2F1-204ENST00000594965 DEPDC5O75140 1603 aa34.47■■■■□ 3.11
GTF2F1-204ENST00000594965 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
GTF2F1-204ENST00000594965 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
GTF2F1-204ENST00000594965 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.1
GTF2F1-204ENST00000594965 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.43■■■■□ 3.1
GTF2F1-204ENST00000594965 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
GTF2F1-204ENST00000594965 TNRQ92752 1358 aa34.38■■■■□ 3.09
GTF2F1-204ENST00000594965 A2ML1A8K2U0 1454 aa34.37■■■■□ 3.09
GTF2F1-204ENST00000594965 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.34■■■■□ 3.09
GTF2F1-204ENST00000594965 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.32■■■■□ 3.08
GTF2F1-204ENST00000594965 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.32■■■■□ 3.08
GTF2F1-204ENST00000594965 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.3■■■■□ 3.08
GTF2F1-204ENST00000594965 PTPRTO14522 1441 aa34.3■■■■□ 3.08
GTF2F1-204ENST00000594965 PLA2R1Q13018 1463 aa34.29■■■■□ 3.08
GTF2F1-204ENST00000594965 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.29■■■■□ 3.082e-7■■■■□ 22.4
GTF2F1-204ENST00000594965 ERVK-7P63135 1459 aa34.28■■■■□ 3.08
GTF2F1-204ENST00000594965 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.28■■■■□ 3.08
GTF2F1-204ENST00000594965 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.26■■■■□ 3.07
GTF2F1-204ENST00000594965 NLRP1Q9C000 1473 aa34.26■■■■□ 3.07
GTF2F1-204ENST00000594965 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
GTF2F1-204ENST00000594965 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.25■■■■□ 3.07
GTF2F1-204ENST00000594965 ROCK1Q13464 1354 aa34.24■■■■□ 3.07
GTF2F1-204ENST00000594965 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
GTF2F1-204ENST00000594965 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa34.23■■■■□ 3.07
GTF2F1-204ENST00000594965 KANK1Q14678 1352 aa34.23■■■■□ 3.07
GTF2F1-204ENST00000594965 ITGAEP38570 1179 aa34.18■■■■□ 3.06
GTF2F1-204ENST00000594965 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.18■■■■□ 3.06
GTF2F1-204ENST00000594965 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
GTF2F1-204ENST00000594965 UNC13BO14795 1591 aa34.16■■■■□ 3.06
GTF2F1-204ENST00000594965 PKD2Q13563 968 aa34.16■■■■□ 3.06
GTF2F1-204ENST00000594965 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.14■■■■□ 3.06
GTF2F1-204ENST00000594965 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.13■■■■□ 3.05
GTF2F1-204ENST00000594965 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.11■■■■□ 3.05
GTF2F1-204ENST00000594965 CERKQ8TCT0 537 aa34.09■■■■□ 3.05
GTF2F1-204ENST00000594965 TET3O43151 1660 aa34.09■■■■□ 3.05
GTF2F1-204ENST00000594965 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
GTF2F1-204ENST00000594965 LTBP4Q8N2S1 1624 aa34.08■■■■□ 3.05
GTF2F1-204ENST00000594965 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.06■■■■□ 3.04
GTF2F1-204ENST00000594965 FBXO41Q8TF61 875 aa34.06■■■■□ 3.04
GTF2F1-204ENST00000594965 SYNMO15061 1565 aa34.05■■■■□ 3.04
GTF2F1-204ENST00000594965 PIK3C2BO00750 1634 aa34.04■■■■□ 3.04
GTF2F1-204ENST00000594965 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.02■■■■□ 3.04
GTF2F1-204ENST00000594965 NOS1P29475 1434 aa34.02■■■■□ 3.04
GTF2F1-204ENST00000594965 ANKLE2Q86XL3 938 aa33.99■■■■□ 3.03
GTF2F1-204ENST00000594965 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
GTF2F1-204ENST00000594965 E9PCH4 1651 aa33.98■■■■□ 3.03
GTF2F1-204ENST00000594965 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
GTF2F1-204ENST00000594965 MED14O60244 1454 aa33.96■■■■□ 3.03
GTF2F1-204ENST00000594965 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
GTF2F1-204ENST00000594965 IDI1Q13907 227 aa33.93■■■■□ 3.02
GTF2F1-204ENST00000594965 ARHGAP23Q9P227 1491 aa33.93■■■■□ 3.02
GTF2F1-204ENST00000594965 SLIT1O75093 1534 aa33.93■■■■□ 3.02
GTF2F1-204ENST00000594965 IQGAP1P46940 1657 aa33.93■■■■□ 3.02
GTF2F1-204ENST00000594965 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
GTF2F1-204ENST00000594965 NAIPQ13075 1403 aa33.91■■■■□ 3.02
GTF2F1-204ENST00000594965 NUP155O75694 1391 aa33.9■■■■□ 3.02
GTF2F1-204ENST00000594965 MYO5BQ9ULV0 1848 aa33.86■■■■□ 3.01
GTF2F1-204ENST00000594965 ADGRB3O60242 1522 aa33.85■■■■□ 3.01
GTF2F1-204ENST00000594965 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
GTF2F1-204ENST00000594965 LTKP29376 864 aa33.84■■■■□ 3.01
GTF2F1-204ENST00000594965 SLC52A1Q9NWF4 448 aa33.84■■■■□ 3.01
GTF2F1-204ENST00000594965 TMEM2Q9UHN6 1383 aa33.82■■■■□ 3
GTF2F1-204ENST00000594965 IQSEC2Q5JU85 1478 aa33.82■■■■□ 3
GTF2F1-204ENST00000594965 HFM1A2PYH4 1435 aa33.81■■■■□ 3
GTF2F1-204ENST00000594965 STAG3Q9UJ98 1225 aa33.8■■■■□ 3
GTF2F1-204ENST00000594965 TXNDC2Q86VQ3 553 aa33.79■■■■□ 3
GTF2F1-204ENST00000594965 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa33.77■■■■□ 3
GTF2F1-204ENST00000594965 STRCP1A6NGW2 1772 aa33.77■■■■□ 3
GTF2F1-204ENST00000594965 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa33.73■■■□□ 2.99
GTF2F1-204ENST00000594965 EID1Q9Y6B2 187 aa33.72■■■□□ 2.99
GTF2F1-204ENST00000594965 CPS1P31327 1500 aa33.72■■■□□ 2.99
GTF2F1-204ENST00000594965 ZFYVE9O95405 1425 aa33.65■■■□□ 2.98
GTF2F1-204ENST00000594965 RIMS2Q9UQ26 1411 aa33.6■■■□□ 2.97
GTF2F1-204ENST00000594965 TRIM52Q96A61 297 aa33.58■■■□□ 2.97
GTF2F1-204ENST00000594965 CHGAP10645 457 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
GTF2F1-204ENST00000594965 CLTCL1P53675 1640 aa33.56■■■□□ 2.96
GTF2F1-204ENST00000594965 TRPM2O94759 1503 aa33.55■■■□□ 2.96
GTF2F1-204ENST00000594965 LRRC7Q96NW7 1537 aa33.54■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms