RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594664.1

AC006486.1-201, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene AC006486.1, Length 634 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC006486.1-201ENST00000594664 DAPK1P53355 1430 aa42.37■■■■■ 4.37
AC006486.1-201ENST00000594664 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.35■■■■■ 4.37
AC006486.1-201ENST00000594664 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
AC006486.1-201ENST00000594664 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
AC006486.1-201ENST00000594664 DMRT2Q9Y5R5 561 aa42.33■■■■■ 4.37
AC006486.1-201ENST00000594664 KIF15Q9NS87 1388 aa42.32■■■■■ 4.37
AC006486.1-201ENST00000594664 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
AC006486.1-201ENST00000594664 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
AC006486.1-201ENST00000594664 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
AC006486.1-201ENST00000594664 MYO3AQ8NEV4 1616 aa42.27■■■■■ 4.36
AC006486.1-201ENST00000594664 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.26■■■■■ 4.36
AC006486.1-201ENST00000594664 STRCQ7RTU9 1775 aa42.25■■■■■ 4.35
AC006486.1-201ENST00000594664 PZPP20742 1482 aa42.24■■■■■ 4.35
AC006486.1-201ENST00000594664 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa42.22■■■■■ 4.35
AC006486.1-201ENST00000594664 ERBINQ96RT1 1412 aa42.21■■■■■ 4.35
AC006486.1-201ENST00000594664 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
AC006486.1-201ENST00000594664 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
AC006486.1-201ENST00000594664 CHIC2Q9UKJ5 165 aa42.2■■■■■ 4.35
AC006486.1-201ENST00000594664 NCOA1Q15788 1441 aa42.19■■■■■ 4.34
AC006486.1-201ENST00000594664 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
AC006486.1-201ENST00000594664 TNRQ92752 1358 aa42.18■■■■■ 4.34
AC006486.1-201ENST00000594664 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa42.17■■■■■ 4.34
AC006486.1-201ENST00000594664 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
AC006486.1-201ENST00000594664 ABCC3O15438 1527 aa42.16■■■■■ 4.34
AC006486.1-201ENST00000594664 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.13■■■■■ 4.33
AC006486.1-201ENST00000594664 PTPRTO14522 1441 aa42.12■■■■■ 4.33
AC006486.1-201ENST00000594664 A2ML1A8K2U0 1454 aa42.12■■■■■ 4.33
AC006486.1-201ENST00000594664 FBXO41Q8TF61 875 aa42.07■■■■■ 4.33
AC006486.1-201ENST00000594664 PLA2R1Q13018 1463 aa42.06■■■■■ 4.32
AC006486.1-201ENST00000594664 ADGRL2O95490 1459 aa42.05■■■■■ 4.32
AC006486.1-201ENST00000594664 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
AC006486.1-201ENST00000594664 CEP152O94986 1710 aa42.03■■■■■ 4.32
AC006486.1-201ENST00000594664 KANK1Q14678 1352 aa42.03■■■■■ 4.32
AC006486.1-201ENST00000594664 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP42.03■■■■■ 4.32
AC006486.1-201ENST00000594664 PKD2Q13563 968 aa42.02■■■■■ 4.32
AC006486.1-201ENST00000594664 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
AC006486.1-201ENST00000594664 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa42■■■■■ 4.31
AC006486.1-201ENST00000594664 NLRP1Q9C000 1473 aa42■■■■■ 4.31
AC006486.1-201ENST00000594664 CERKQ8TCT0 537 aa41.99■■■■■ 4.31
AC006486.1-201ENST00000594664 DEPDC5O75140 1603 aa41.97■■■■■ 4.31
AC006486.1-201ENST00000594664 ERVK-7P63135 1459 aa41.95■■■■■ 4.31
AC006486.1-201ENST00000594664 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.95■■■■■ 4.31
AC006486.1-201ENST00000594664 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.89■■■■■ 4.3
AC006486.1-201ENST00000594664 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
AC006486.1-201ENST00000594664 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.88■■■■■ 4.3
AC006486.1-201ENST00000594664 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.88■■■■■ 4.29
AC006486.1-201ENST00000594664 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.86■■■■■ 4.29
AC006486.1-201ENST00000594664 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.82■■■■■ 4.292e-7■■■■■ 26.8
AC006486.1-201ENST00000594664 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.8■■■■■ 4.28
AC006486.1-201ENST00000594664 ROCK1Q13464 1354 aa41.8■■■■■ 4.28
AC006486.1-201ENST00000594664 ITGAEP38570 1179 aa41.8■■■■■ 4.28
AC006486.1-201ENST00000594664 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.8■■■■■ 4.28
AC006486.1-201ENST00000594664 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.79■■■■■ 4.28
AC006486.1-201ENST00000594664 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
AC006486.1-201ENST00000594664 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.72■■■■■ 4.27
AC006486.1-201ENST00000594664 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
AC006486.1-201ENST00000594664 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.68■■■■■ 4.26
AC006486.1-201ENST00000594664 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.67■■■■■ 4.26
AC006486.1-201ENST00000594664 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.63■■■■■ 4.25
AC006486.1-201ENST00000594664 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
AC006486.1-201ENST00000594664 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.61■■■■■ 4.25
AC006486.1-201ENST00000594664 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
AC006486.1-201ENST00000594664 UNC13BO14795 1591 aa41.6■■■■■ 4.25
AC006486.1-201ENST00000594664 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.59■■■■■ 4.25
AC006486.1-201ENST00000594664 MED14O60244 1454 aa41.58■■■■■ 4.25
AC006486.1-201ENST00000594664 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
AC006486.1-201ENST00000594664 TET3O43151 1660 aa41.56■■■■■ 4.24
AC006486.1-201ENST00000594664 NOS1P29475 1434 aa41.55■■■■■ 4.24
AC006486.1-201ENST00000594664 PIK3C2BO00750 1634 aa41.54■■■■■ 4.24
AC006486.1-201ENST00000594664 SYNMO15061 1565 aa41.51■■■■■ 4.24
AC006486.1-201ENST00000594664 IDI1Q13907 227 aa41.51■■■■■ 4.24
AC006486.1-201ENST00000594664 IQGAP1P46940 1657 aa41.5■■■■■ 4.23
AC006486.1-201ENST00000594664 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
AC006486.1-201ENST00000594664 EID1Q9Y6B2 187 aa41.49■■■■■ 4.23
AC006486.1-201ENST00000594664 SLIT1O75093 1534 aa41.49■■■■■ 4.23
AC006486.1-201ENST00000594664 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.49■■■■■ 4.23
AC006486.1-201ENST00000594664 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.48■■■■■ 4.23
AC006486.1-201ENST00000594664 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.47■■■■■ 4.23
AC006486.1-201ENST00000594664 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.47■■■■■ 4.23
AC006486.1-201ENST00000594664 NUP155O75694 1391 aa41.46■■■■■ 4.23
AC006486.1-201ENST00000594664 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
AC006486.1-201ENST00000594664 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.44■■■■■ 4.22
AC006486.1-201ENST00000594664 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.43■■■■■ 4.22
AC006486.1-201ENST00000594664 CPS1P31327 1500 aa41.42■■■■■ 4.22
AC006486.1-201ENST00000594664 LTKP29376 864 aa41.4■■■■■ 4.22
AC006486.1-201ENST00000594664 ADGRB3O60242 1522 aa41.39■■■■■ 4.22
AC006486.1-201ENST00000594664 E9PCH4 1651 aa41.34■■■■■ 4.21
AC006486.1-201ENST00000594664 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.31■■■■■ 4.2
AC006486.1-201ENST00000594664 NAIPQ13075 1403 aa41.28■■■■■ 4.2
AC006486.1-201ENST00000594664 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
AC006486.1-201ENST00000594664 HFM1A2PYH4 1435 aa41.21■■■■■ 4.19
AC006486.1-201ENST00000594664 HDGFP51858 240 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
AC006486.1-201ENST00000594664 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.17■■■■■ 4.18
AC006486.1-201ENST00000594664 BCANQ96GW7 911 aa41.16■■■■■ 4.18
AC006486.1-201ENST00000594664 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
AC006486.1-201ENST00000594664 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.15■■■■■ 4.18
AC006486.1-201ENST00000594664 RIMS2Q9UQ26 1411 aa41.13■■■■■ 4.17
AC006486.1-201ENST00000594664 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.13■■■■■ 4.17
AC006486.1-201ENST00000594664 TOM1O60784 492 aa41.13■■■■■ 4.17
AC006486.1-201ENST00000594664 TRIM52Q96A61 297 aa41.12■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms