RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591914.5

SMAD4-213, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD4, Length 992 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-213ENST00000591914 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.17■■■■■ 4.34
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SMAD4-213ENST00000591914 KIF15Q9NS87 1388 aa42.14■■■■■ 4.34
SMAD4-213ENST00000591914 PTPRKQ15262 1439 aa42.12■■■■■ 4.33
SMAD4-213ENST00000591914 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
SMAD4-213ENST00000591914 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.06■■■■■ 4.32
SMAD4-213ENST00000591914 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.06■■■■■ 4.32
SMAD4-213ENST00000591914 ERBINQ96RT1 1412 aa42.05■■■■■ 4.32
SMAD4-213ENST00000591914 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.04■■■■■ 4.32
SMAD4-213ENST00000591914 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa42.03■■■■■ 4.32
SMAD4-213ENST00000591914 CHIC2Q9UKJ5 165 aa42.01■■■■■ 4.32
SMAD4-213ENST00000591914 ADGRL2O95490 1459 aa42■■■■■ 4.31
SMAD4-213ENST00000591914 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
SMAD4-213ENST00000591914 NCOA1Q15788 1441 aa42■■■■■ 4.31
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SMAD4-213ENST00000591914 PZPP20742 1482 aa41.98■■■■■ 4.31
SMAD4-213ENST00000591914 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.98■■■■■ 4.31
SMAD4-213ENST00000591914 ABCC3O15438 1527 aa41.97■■■■■ 4.31
SMAD4-213ENST00000591914 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
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SMAD4-213ENST00000591914 DEPDC5O75140 1603 aa41.9■■■■■ 4.3
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SMAD4-213ENST00000591914 CEP152O94986 1710 aa41.85■■■■■ 4.29
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SMAD4-213ENST00000591914 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.79■■■■■ 4.28
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SMAD4-213ENST00000591914 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.75■■■■■ 4.27
SMAD4-213ENST00000591914 ROCK1Q13464 1354 aa41.75■■■■■ 4.27
SMAD4-213ENST00000591914 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.74■■■■■ 4.27
SMAD4-213ENST00000591914 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.73■■■■■ 4.27
SMAD4-213ENST00000591914 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.73■■■■■ 4.273e-6■■□□□ 11.7
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SMAD4-213ENST00000591914 PLA2R1Q13018 1463 aa41.72■■■■■ 4.27
SMAD4-213ENST00000591914 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.71■■■■■ 4.27
SMAD4-213ENST00000591914 ERVK-7P63135 1459 aa41.71■■■■■ 4.27
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SMAD4-213ENST00000591914 NLRP1Q9C000 1473 aa41.7■■■■■ 4.27
SMAD4-213ENST00000591914 PTPRTO14522 1441 aa41.69■■■■■ 4.27
SMAD4-213ENST00000591914 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.68■■■■■ 4.26
SMAD4-213ENST00000591914 ITGAEP38570 1179 aa41.62■■■■■ 4.25
SMAD4-213ENST00000591914 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
SMAD4-213ENST00000591914 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.58■■■■■ 4.25
SMAD4-213ENST00000591914 PKD2Q13563 968 aa41.57■■■■■ 4.25
SMAD4-213ENST00000591914 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.56■■■■■ 4.24
SMAD4-213ENST00000591914 UNC13BO14795 1591 aa41.54■■■■■ 4.24
SMAD4-213ENST00000591914 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.54■■■■■ 4.24
SMAD4-213ENST00000591914 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
SMAD4-213ENST00000591914 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
SMAD4-213ENST00000591914 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
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SMAD4-213ENST00000591914 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.42■■■■■ 4.22
SMAD4-213ENST00000591914 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.42■■■■■ 4.22
SMAD4-213ENST00000591914 CERKQ8TCT0 537 aa41.41■■■■■ 4.22
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SMAD4-213ENST00000591914 SYNMO15061 1565 aa41.37■■■■■ 4.21
SMAD4-213ENST00000591914 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.37■■■■■ 4.21
SMAD4-213ENST00000591914 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.37■■■■■ 4.21
SMAD4-213ENST00000591914 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.37■■■■■ 4.21
SMAD4-213ENST00000591914 FBXO41Q8TF61 875 aa41.37■■■■■ 4.21
SMAD4-213ENST00000591914 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.35■■■■■ 4.21
SMAD4-213ENST00000591914 PIK3C2BO00750 1634 aa41.33■■■■■ 4.21
SMAD4-213ENST00000591914 MED14O60244 1454 aa41.31■■■■■ 4.2
SMAD4-213ENST00000591914 NAIPQ13075 1403 aa41.29■■■■■ 4.2
SMAD4-213ENST00000591914 NUP155O75694 1391 aa41.29■■■■■ 4.2
SMAD4-213ENST00000591914 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
SMAD4-213ENST00000591914 IDI1Q13907 227 aa41.27■■■■■ 4.2
SMAD4-213ENST00000591914 SLIT1O75093 1534 aa41.26■■■■■ 4.2
SMAD4-213ENST00000591914 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.26■■■■■ 4.2
SMAD4-213ENST00000591914 E9PCH4 1651 aa41.26■■■■■ 4.2
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SMAD4-213ENST00000591914 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
SMAD4-213ENST00000591914 HFM1A2PYH4 1435 aa41.22■■■■■ 4.19
SMAD4-213ENST00000591914 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.22■■■■■ 4.19
SMAD4-213ENST00000591914 IQGAP1P46940 1657 aa41.2■■■■■ 4.19
SMAD4-213ENST00000591914 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
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SMAD4-213ENST00000591914 LTKP29376 864 aa41.12■■■■■ 4.17
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SMAD4-213ENST00000591914 CPS1P31327 1500 aa41■■■■■ 4.15
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SMAD4-213ENST00000591914 ZFYVE9O95405 1425 aa40.93■■■■■ 4.14
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SMAD4-213ENST00000591914 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.89■■■■■ 4.14
SMAD4-213ENST00000591914 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.87■■■■■ 4.13
SMAD4-213ENST00000591914 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
SMAD4-213ENST00000591914 TRPM2O94759 1503 aa40.83■■■■■ 4.13
SMAD4-213ENST00000591914 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
SMAD4-213ENST00000591914 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
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