RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591579.5

NEDD4L-232, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 144 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-232ENST00000591579 KIF3BO15066 747 aa20.96■□□□□ 0.95
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NEDD4L-232ENST00000591579 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.94■□□□□ 0.94
NEDD4L-232ENST00000591579 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
NEDD4L-232ENST00000591579 NCOA2Q15596 1464 aa20.94■□□□□ 0.94
NEDD4L-232ENST00000591579 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
NEDD4L-232ENST00000591579 PZPP20742 1482 aa20.92■□□□□ 0.94
NEDD4L-232ENST00000591579 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.91■□□□□ 0.94
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NEDD4L-232ENST00000591579 CPS1P31327 1500 aa20.86■□□□□ 0.93
NEDD4L-232ENST00000591579 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
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NEDD4L-232ENST00000591579 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.84■□□□□ 0.93
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NEDD4L-232ENST00000591579 TSPY10P0CW01 314 aa20.83■□□□□ 0.93
NEDD4L-232ENST00000591579 MIA2Q96PC5 1412 aa20.83■□□□□ 0.93
NEDD4L-232ENST00000591579 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.82■□□□□ 0.92
NEDD4L-232ENST00000591579 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.82■□□□□ 0.92
NEDD4L-232ENST00000591579 HSPA1LP34931 641 aa20.82■□□□□ 0.92
NEDD4L-232ENST00000591579 TOM1O60784 492 aa20.81■□□□□ 0.92
NEDD4L-232ENST00000591579 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
NEDD4L-232ENST00000591579 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
NEDD4L-232ENST00000591579 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.79■□□□□ 0.92
NEDD4L-232ENST00000591579 ABCC3O15438 1527 aa20.77■□□□□ 0.92
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NEDD4L-232ENST00000591579 ERVK-7P63135 1459 aa20.73■□□□□ 0.91
NEDD4L-232ENST00000591579 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.72■□□□□ 0.91
NEDD4L-232ENST00000591579 IQGAP1P46940 1657 aa20.72■□□□□ 0.91
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NEDD4L-232ENST00000591579 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
NEDD4L-232ENST00000591579 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.67■□□□□ 0.9
NEDD4L-232ENST00000591579 ALKQ9UM73 1620 aa20.67■□□□□ 0.9
NEDD4L-232ENST00000591579 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
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NEDD4L-232ENST00000591579 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.64■□□□□ 0.9
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NEDD4L-232ENST00000591579 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
NEDD4L-232ENST00000591579 KIF15Q9NS87 1388 aa20.62■□□□□ 0.89
NEDD4L-232ENST00000591579 CEP152O94986 1710 aa20.62■□□□□ 0.89
NEDD4L-232ENST00000591579 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.62■□□□□ 0.89
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NEDD4L-232ENST00000591579 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
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NEDD4L-232ENST00000591579 ERBINQ96RT1 1412 aa20.58■□□□□ 0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 LTKP29376 864 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
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NEDD4L-232ENST00000591579 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.55■□□□□ 0.88
NEDD4L-232ENST00000591579 SLIT1O75093 1534 aa20.55■□□□□ 0.88
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NEDD4L-232ENST00000591579 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.51■□□□□ 0.87
NEDD4L-232ENST00000591579 DAPK1P53355 1430 aa20.51■□□□□ 0.87
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NEDD4L-232ENST00000591579 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD4L-232ENST00000591579 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
NEDD4L-232ENST00000591579 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
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NEDD4L-232ENST00000591579 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.39■□□□□ 0.85
NEDD4L-232ENST00000591579 KCNA6P17658 529 aa20.39■□□□□ 0.85
NEDD4L-232ENST00000591579 BCANQ96GW7 911 aa20.39■□□□□ 0.85
NEDD4L-232ENST00000591579 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
NEDD4L-232ENST00000591579 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
NEDD4L-232ENST00000591579 NOS1P29475 1434 aa20.37■□□□□ 0.85
NEDD4L-232ENST00000591579 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NEDD4L-232ENST00000591579 TET3O43151 1660 aa20.35■□□□□ 0.85
NEDD4L-232ENST00000591579 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NEDD4L-232ENST00000591579 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD4L-232ENST00000591579 ADGRL2O95490 1459 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD4L-232ENST00000591579 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
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