RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591152.5

PSME3-211, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene PSME3, Length 1,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-211ENST00000591152 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
PSME3-211ENST00000591152 TNRQ92752 1358 aa33.96■■■■□ 3.03
PSME3-211ENST00000591152 NEURL4Q96JN8 1562 aa33.94■■■■□ 3.02
PSME3-211ENST00000591152 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
PSME3-211ENST00000591152 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
PSME3-211ENST00000591152 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.91■■■■□ 3.02
PSME3-211ENST00000591152 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP33.9■■■■□ 3.02
PSME3-211ENST00000591152 ANKLE2Q86XL3 938 aa33.9■■■■□ 3.02
PSME3-211ENST00000591152 KIF3BO15066 747 aa33.89■■■■□ 3.02
PSME3-211ENST00000591152 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
PSME3-211ENST00000591152 MBD5Q9P267 1494 aa33.86■■■■□ 3.01
PSME3-211ENST00000591152 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa33.83■■■■□ 3.01
PSME3-211ENST00000591152 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP33.83■■■■□ 3.01
PSME3-211ENST00000591152 VWDEQ8N2E2 1590 aa33.83■■■■□ 3.01
PSME3-211ENST00000591152 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.82■■■■□ 3
PSME3-211ENST00000591152 PZPP20742 1482 aa33.82■■■■□ 3
PSME3-211ENST00000591152 TIAM1Q13009 1591 aa33.8■■■■□ 3
PSME3-211ENST00000591152 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
PSME3-211ENST00000591152 ALKQ9UM73 1620 aa33.78■■■■□ 3
PSME3-211ENST00000591152 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.78■■■■□ 3
PSME3-211ENST00000591152 MIA2Q96PC5 1412 aa33.76■■■□□ 2.99
PSME3-211ENST00000591152 UGGT1Q9NYU2 1555 aa33.73■■■□□ 2.99
PSME3-211ENST00000591152 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33.72■■■□□ 2.99
PSME3-211ENST00000591152 MED14O60244 1454 aa33.7■■■□□ 2.99
PSME3-211ENST00000591152 NLRP1Q9C000 1473 aa33.7■■■□□ 2.99
PSME3-211ENST00000591152 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.67■■■□□ 2.98
PSME3-211ENST00000591152 DEPDC5O75140 1603 aa33.67■■■□□ 2.98
PSME3-211ENST00000591152 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.66■■■□□ 2.98
PSME3-211ENST00000591152 IQGAP1P46940 1657 aa33.65■■■□□ 2.98
PSME3-211ENST00000591152 LRRC7Q96NW7 1537 aa33.65■■■□□ 2.98
PSME3-211ENST00000591152 CEP162Q5TB80 1403 aa33.62■■■□□ 2.97
PSME3-211ENST00000591152 STRCP1A6NGW2 1772 aa33.62■■■□□ 2.97
PSME3-211ENST00000591152 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.6■■■□□ 2.97
PSME3-211ENST00000591152 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.58■■■□□ 2.97
PSME3-211ENST00000591152 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP33.56■■■□□ 2.96
PSME3-211ENST00000591152 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
PSME3-211ENST00000591152 TSPY4P0CV99 314 aa33.54■■■□□ 2.96
PSME3-211ENST00000591152 TSPY10P0CW01 314 aa33.54■■■□□ 2.96
PSME3-211ENST00000591152 NCOA2Q15596 1464 aa33.51■■■□□ 2.96
PSME3-211ENST00000591152 SYNMO15061 1565 aa33.51■■■□□ 2.95
PSME3-211ENST00000591152 ABCC3O15438 1527 aa33.48■■■□□ 2.95
PSME3-211ENST00000591152 ERVK-7P63135 1459 aa33.46■■■□□ 2.95
PSME3-211ENST00000591152 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
PSME3-211ENST00000591152 LTKP29376 864 aa33.42■■■□□ 2.94
PSME3-211ENST00000591152 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.42■■■□□ 2.94
PSME3-211ENST00000591152 TXNDC2Q86VQ3 553 aa33.41■■■□□ 2.94
PSME3-211ENST00000591152 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
PSME3-211ENST00000591152 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
PSME3-211ENST00000591152 UBR1Q8IWV7 1749 aa33.37■■■□□ 2.93
PSME3-211ENST00000591152 POTEAQ6S8J7 498 aa33.35■■■□□ 2.93
PSME3-211ENST00000591152 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP33.32■■■□□ 2.92
PSME3-211ENST00000591152 CEP152O94986 1710 aa33.31■■■□□ 2.92
PSME3-211ENST00000591152 EID1Q9Y6B2 187 aa33.31■■■□□ 2.92
PSME3-211ENST00000591152 MROH1Q8NDA8 1641 aa33.3■■■□□ 2.92
PSME3-211ENST00000591152 ARHGAP23Q9P227 1491 aa33.28■■■□□ 2.92
PSME3-211ENST00000591152 FAM135BQ49AJ0 1406 aa33.28■■■□□ 2.92
PSME3-211ENST00000591152 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP33.27■■■□□ 2.92
PSME3-211ENST00000591152 SLIT1O75093 1534 aa33.27■■■□□ 2.92
PSME3-211ENST00000591152 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.26■■■□□ 2.92
PSME3-211ENST00000591152 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP33.24■■■□□ 2.91
PSME3-211ENST00000591152 TMEM94Q12767 1356 aa33.22■■■□□ 2.91
PSME3-211ENST00000591152 STAG3Q9UJ98 1225 aa33.22■■■□□ 2.91
PSME3-211ENST00000591152 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP33.18■■■□□ 2.92e-7■■■□□ 18.6
PSME3-211ENST00000591152 TMEM2Q9UHN6 1383 aa33.17■■■□□ 2.9
PSME3-211ENST00000591152 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP33.16■■■□□ 2.9
PSME3-211ENST00000591152 SLC26A8Q96RN1 970 aa33.16■■■□□ 2.9
PSME3-211ENST00000591152 DUOX2Q9NRD8 1548 aa33.15■■■□□ 2.9
PSME3-211ENST00000591152 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa33.15■■■□□ 2.9
PSME3-211ENST00000591152 PIK3C2BO00750 1634 aa33.14■■■□□ 2.9
PSME3-211ENST00000591152 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.14■■■□□ 2.9
PSME3-211ENST00000591152 KCNA6P17658 529 aa33.14■■■□□ 2.9
PSME3-211ENST00000591152 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa33.13■■■□□ 2.89
PSME3-211ENST00000591152 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa33.1■■■□□ 2.89
PSME3-211ENST00000591152 KIF15Q9NS87 1388 aa33.09■■■□□ 2.89
PSME3-211ENST00000591152 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
PSME3-211ENST00000591152 MAP3K1Q13233 1512 aa33.07■■■□□ 2.89
PSME3-211ENST00000591152 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
PSME3-211ENST00000591152 MYOM3Q5VTT5 1437 aa33.07■■■□□ 2.88
PSME3-211ENST00000591152 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
PSME3-211ENST00000591152 IDI1Q13907 227 aa33.06■■■□□ 2.88
PSME3-211ENST00000591152 EFCAB6Q5THR3 1501 aa33.04■■■□□ 2.88
PSME3-211ENST00000591152 BCANQ96GW7 911 aa33.04■■■□□ 2.88
PSME3-211ENST00000591152 ERBINQ96RT1 1412 aa33.01■■■□□ 2.87
PSME3-211ENST00000591152 KANK1Q14678 1352 aa33■■■□□ 2.87
PSME3-211ENST00000591152 SLAIN2Q9P270 581 aa33■■■□□ 2.87
PSME3-211ENST00000591152 TET3O43151 1660 aa33■■■□□ 2.87
PSME3-211ENST00000591152 MSH6P52701 1360 aa32.99■■■□□ 2.87
PSME3-211ENST00000591152 PHLPP1O60346 1717 aa32.97■■■□□ 2.87
PSME3-211ENST00000591152 JCADQ9P266 1359 aa32.96■■■□□ 2.87
PSME3-211ENST00000591152 ABCC5O15440 1437 aa32.94■■■□□ 2.86
PSME3-211ENST00000591152 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.94■■■□□ 2.86
PSME3-211ENST00000591152 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
PSME3-211ENST00000591152 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
PSME3-211ENST00000591152 NWD1Q149M9 1564 aa32.9■■■□□ 2.86
PSME3-211ENST00000591152 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
PSME3-211ENST00000591152 TRIM52Q96A61 297 aa32.88■■■□□ 2.85
PSME3-211ENST00000591152 CHIC2Q9UKJ5 165 aa32.87■■■□□ 2.85
PSME3-211ENST00000591152 CROCC2H7BZ55 1655 aa32.86■■■□□ 2.85
PSME3-211ENST00000591152 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP32.85■■■□□ 2.85
PSME3-211ENST00000591152 ADGRB3O60242 1522 aa32.85■■■□□ 2.85
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