RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 SIN3AQ96ST3 1273 aa32.6■■■□□ 2.81
CAPNS1-212ENST00000591041 PKD2Q13563 968 aa32.57■■■□□ 2.8
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM135AQ9P2D6 1515 aa32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-212ENST00000591041 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.55■■■□□ 2.8
CAPNS1-212ENST00000591041 IQGAP3Q86VI3 1631 aa32.55■■■□□ 2.8
CAPNS1-212ENST00000591041 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.54■■■□□ 2.8
CAPNS1-212ENST00000591041 A2MP01023 1474 aa32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-212ENST00000591041 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP32.51■■■□□ 2.79
CAPNS1-212ENST00000591041 RICTORQ6R327 1708 aa32.48■■■□□ 2.79
CAPNS1-212ENST00000591041 DEPDC5O75140 1603 aa32.46■■■□□ 2.79
CAPNS1-212ENST00000591041 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
CAPNS1-212ENST00000591041 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.45■■■□□ 2.78
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF3BO15066 747 aa32.44■■■□□ 2.78
CAPNS1-212ENST00000591041 RAPGEF3O95398 923 aa32.43■■■□□ 2.78
CAPNS1-212ENST00000591041 FOXD1Q16676 465 aa32.41■■■□□ 2.78
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-212ENST00000591041 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-212ENST00000591041 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCA6Q8N139 1617 aa32.36■■■□□ 2.77
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
CAPNS1-212ENST00000591041 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-212ENST00000591041 TET3O43151 1660 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC144AA2RUR9 1427 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-212ENST00000591041 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-212ENST00000591041 VWDEQ8N2E2 1590 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP10AO60312 1499 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-212ENST00000591041 LMTK2Q8IWU2 1503 aa32.26■■■□□ 2.76
CAPNS1-212ENST00000591041 REREQ9P2R6 1566 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-212ENST00000591041 L3MBTL2Q969R5 705 aa32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-212ENST00000591041 MROH1Q8NDA8 1641 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP6R1Q9UPN7 881 aa32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-212ENST00000591041 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-212ENST00000591041 GGT6Q6P531 493 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-212ENST00000591041 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-212ENST00000591041 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-212ENST00000591041 EFCAB6Q5THR3 1501 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-212ENST00000591041 E9PCH4 1651 aa32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-212ENST00000591041 AGLP35573 1532 aa32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-212ENST00000591041 TRPM2O94759 1503 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPRTO14522 1441 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-212ENST00000591041 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-212ENST00000591041 STAC3Q96MF2 364 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-212ENST00000591041 PLA2R1Q13018 1463 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCC3O15438 1527 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXO41Q8TF61 875 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP152O94986 1710 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPRMP28827 1452 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-212ENST00000591041 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.72
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa32.01■■■□□ 2.72
CAPNS1-212ENST00000591041 NEURL4Q96JN8 1562 aa32.01■■■□□ 2.71
CAPNS1-212ENST00000591041 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32■■■□□ 2.71
CAPNS1-212ENST00000591041 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32■■■□□ 2.71
CAPNS1-212ENST00000591041 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa32■■■□□ 2.71
CAPNS1-212ENST00000591041 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-212ENST00000591041 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-212ENST00000591041 DCAF11Q8TEB1 546 aa31.96■■■□□ 2.71
CAPNS1-212ENST00000591041 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP31.95■■■□□ 2.71
CAPNS1-212ENST00000591041 NPATQ14207 1427 aa31.92■■■□□ 2.7
CAPNS1-212ENST00000591041 CLTCL1P53675 1640 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-212ENST00000591041 RGL3Q3MIN7 710 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF1BO60333 1816 aa31.89■■■□□ 2.69
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-212ENST00000591041 MADDQ8WXG6 1647 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-212ENST00000591041 RALGAPBQ86X10 1494 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-212ENST00000591041 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-212ENST00000591041 NBPF8Q3BBV2 869 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-212ENST00000591041 NOS1P29475 1434 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-212ENST00000591041 PRAG1Q86YV5 1406 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-212ENST00000591041 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-212ENST00000591041 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-212ENST00000591041 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-212ENST00000591041 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.68
CAPNS1-212ENST00000591041 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-212ENST00000591041 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-212ENST00000591041 CARD11Q9BXL7 1154 aa31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-212ENST00000591041 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-212ENST00000591041 ADGRB3O60242 1522 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-212ENST00000591041 MLECQ14165 292 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-212ENST00000591041 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-212ENST00000591041 CHGAP10645 457 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
CAPNS1-212ENST00000591041 MYOM2P54296 1465 aa31.71■■■□□ 2.67
CAPNS1-212ENST00000591041 PIK3C2BO00750 1634 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-212ENST00000591041 LAMC1P11047 1609 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-212ENST00000591041 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-212ENST00000591041 USP47Q96K76 1375 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-212ENST00000591041 ERVK-7P63135 1459 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-212ENST00000591041 HSPA2P54652 639 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-212ENST00000591041 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-212ENST00000591041 SYNMO15061 1565 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-212ENST00000591041 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-212ENST00000591041 GPRASP1Q5JY77 1395 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-212ENST00000591041 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-212ENST00000591041 MROH2AA6NES4 1674 aa31.62■■■□□ 2.65
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa31.61■■■□□ 2.65
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