RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590466.2

UBXN6-206, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-206ENST00000590466 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.18■■■□□ 2.58
UBXN6-206ENST00000590466 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
UBXN6-206ENST00000590466 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.17■■■□□ 2.58
UBXN6-206ENST00000590466 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.17■■■□□ 2.58
UBXN6-206ENST00000590466 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
UBXN6-206ENST00000590466 NCOA1Q15788 1441 aa31.16■■■□□ 2.58
UBXN6-206ENST00000590466 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.16■■■□□ 2.58
UBXN6-206ENST00000590466 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
UBXN6-206ENST00000590466 PTPRKQ15262 1439 aa31.15■■■□□ 2.58
UBXN6-206ENST00000590466 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.14■■■□□ 2.58
UBXN6-206ENST00000590466 ADGRL2O95490 1459 aa31.14■■■□□ 2.57
UBXN6-206ENST00000590466 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.14■■■□□ 2.57
UBXN6-206ENST00000590466 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.13■■■□□ 2.57
UBXN6-206ENST00000590466 ERBINQ96RT1 1412 aa31.13■■■□□ 2.57
UBXN6-206ENST00000590466 MROH1Q8NDA8 1641 aa31.1■■■□□ 2.57
UBXN6-206ENST00000590466 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.1■■■□□ 2.57
UBXN6-206ENST00000590466 ABCC3O15438 1527 aa31.04■■■□□ 2.56
UBXN6-206ENST00000590466 PZPP20742 1482 aa31.04■■■□□ 2.56
UBXN6-206ENST00000590466 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
UBXN6-206ENST00000590466 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
UBXN6-206ENST00000590466 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
UBXN6-206ENST00000590466 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
UBXN6-206ENST00000590466 ROCK1Q13464 1354 aa30.98■■■□□ 2.55
UBXN6-206ENST00000590466 DEPDC5O75140 1603 aa30.98■■■□□ 2.55
UBXN6-206ENST00000590466 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.96■■■□□ 2.55
UBXN6-206ENST00000590466 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.94■■■□□ 2.54
UBXN6-206ENST00000590466 TNRQ92752 1358 aa30.93■■■□□ 2.54
UBXN6-206ENST00000590466 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.93■■■□□ 2.54
UBXN6-206ENST00000590466 ITGAEP38570 1179 aa30.91■■■□□ 2.54
UBXN6-206ENST00000590466 CEP152O94986 1710 aa30.9■■■□□ 2.54
UBXN6-206ENST00000590466 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.9■■■□□ 2.54
UBXN6-206ENST00000590466 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
UBXN6-206ENST00000590466 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
UBXN6-206ENST00000590466 STRCQ7RTU9 1775 aa30.89■■■□□ 2.54
UBXN6-206ENST00000590466 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.89■■■□□ 2.53
UBXN6-206ENST00000590466 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.88■■■□□ 2.53
UBXN6-206ENST00000590466 KANK1Q14678 1352 aa30.88■■■□□ 2.53
UBXN6-206ENST00000590466 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.87■■■□□ 2.53
UBXN6-206ENST00000590466 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.86■■■□□ 2.53
UBXN6-206ENST00000590466 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.86■■■□□ 2.53
UBXN6-206ENST00000590466 ERVK-7P63135 1459 aa30.85■■■□□ 2.53
UBXN6-206ENST00000590466 NLRP1Q9C000 1473 aa30.81■■■□□ 2.52
UBXN6-206ENST00000590466 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.8■■■□□ 2.52
UBXN6-206ENST00000590466 PLA2R1Q13018 1463 aa30.79■■■□□ 2.52
UBXN6-206ENST00000590466 PTPRTO14522 1441 aa30.76■■■□□ 2.51
UBXN6-206ENST00000590466 UNC13BO14795 1591 aa30.75■■■□□ 2.51
UBXN6-206ENST00000590466 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.73■■■□□ 2.51
UBXN6-206ENST00000590466 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.73■■■□□ 2.51
UBXN6-206ENST00000590466 PKD2Q13563 968 aa30.72■■■□□ 2.51
UBXN6-206ENST00000590466 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
UBXN6-206ENST00000590466 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
UBXN6-206ENST00000590466 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.69■■■□□ 2.5
UBXN6-206ENST00000590466 NAIPQ13075 1403 aa30.68■■■□□ 2.5
UBXN6-206ENST00000590466 NOS1P29475 1434 aa30.67■■■□□ 2.5
UBXN6-206ENST00000590466 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
UBXN6-206ENST00000590466 TET3O43151 1660 aa30.64■■■□□ 2.5
UBXN6-206ENST00000590466 NUP155O75694 1391 aa30.63■■■□□ 2.49
UBXN6-206ENST00000590466 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.62■■■□□ 2.49
UBXN6-206ENST00000590466 HFM1A2PYH4 1435 aa30.61■■■□□ 2.49
UBXN6-206ENST00000590466 SYNMO15061 1565 aa30.61■■■□□ 2.49
UBXN6-206ENST00000590466 IDI1Q13907 227 aa30.59■■■□□ 2.49
UBXN6-206ENST00000590466 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.59■■■□□ 2.49
UBXN6-206ENST00000590466 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.57■■■□□ 2.48
UBXN6-206ENST00000590466 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.57■■■□□ 2.48
UBXN6-206ENST00000590466 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.57■■■□□ 2.48
UBXN6-206ENST00000590466 SLC52A1Q9NWF4 448 aa30.54■■■□□ 2.48
UBXN6-206ENST00000590466 PIK3C2BO00750 1634 aa30.54■■■□□ 2.48
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UBXN6-206ENST00000590466 MED14O60244 1454 aa30.52■■■□□ 2.48
UBXN6-206ENST00000590466 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
UBXN6-206ENST00000590466 E9PCH4 1651 aa30.52■■■□□ 2.48
UBXN6-206ENST00000590466 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.51■■■□□ 2.48
UBXN6-206ENST00000590466 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
UBXN6-206ENST00000590466 SLIT1O75093 1534 aa30.5■■■□□ 2.47
UBXN6-206ENST00000590466 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.49■■■□□ 2.47
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UBXN6-206ENST00000590466 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
UBXN6-206ENST00000590466 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.46■■■□□ 2.47
UBXN6-206ENST00000590466 LTKP29376 864 aa30.46■■■□□ 2.47
UBXN6-206ENST00000590466 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
UBXN6-206ENST00000590466 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.45■■■□□ 2.47
UBXN6-206ENST00000590466 FBXO41Q8TF61 875 aa30.44■■■□□ 2.46
UBXN6-206ENST00000590466 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
UBXN6-206ENST00000590466 ADGRB3O60242 1522 aa30.42■■■□□ 2.46
UBXN6-206ENST00000590466 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.42■■■□□ 2.46
UBXN6-206ENST00000590466 TRIM52Q96A61 297 aa30.37■■■□□ 2.45
UBXN6-206ENST00000590466 EID1Q9Y6B2 187 aa30.37■■■□□ 2.45
UBXN6-206ENST00000590466 IQGAP1P46940 1657 aa30.36■■■□□ 2.45
UBXN6-206ENST00000590466 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.35■■■□□ 2.45
UBXN6-206ENST00000590466 ZFYVE9O95405 1425 aa30.3■■■□□ 2.44
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UBXN6-206ENST00000590466 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.29■■■□□ 2.44
UBXN6-206ENST00000590466 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa30.28■■■□□ 2.44
UBXN6-206ENST00000590466 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.28■■■□□ 2.44
UBXN6-206ENST00000590466 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
UBXN6-206ENST00000590466 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.26■■■□□ 2.43
UBXN6-206ENST00000590466 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.25■■■□□ 2.43
UBXN6-206ENST00000590466 TRPM2O94759 1503 aa30.23■■■□□ 2.43
UBXN6-206ENST00000590466 CPS1P31327 1500 aa30.23■■■□□ 2.43
UBXN6-206ENST00000590466 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
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