RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXD1Q16676 465 aa32.95■■■□□ 2.87
CAPNS1-207ENST00000589146 TONSLQ96HA7 1378 aa32.95■■■□□ 2.86
CAPNS1-207ENST00000589146 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP32.91■■■□□ 2.86
CAPNS1-207ENST00000589146 A2MP01023 1474 aa32.87■■■□□ 2.85
CAPNS1-207ENST00000589146 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.86■■■□□ 2.85
CAPNS1-207ENST00000589146 VWDEQ8N2E2 1590 aa32.85■■■□□ 2.85
CAPNS1-207ENST00000589146 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.85■■■□□ 2.85
CAPNS1-207ENST00000589146 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.85■■■□□ 2.85
CAPNS1-207ENST00000589146 TSPOAP1O95153 1857 aa32.84■■■□□ 2.85
CAPNS1-207ENST00000589146 RAPGEF3O95398 923 aa32.84■■■□□ 2.85
CAPNS1-207ENST00000589146 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.84■■■□□ 2.85
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCA6Q8N139 1617 aa32.84■■■□□ 2.85
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
CAPNS1-207ENST00000589146 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
CAPNS1-207ENST00000589146 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP32.8■■■□□ 2.84
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
CAPNS1-207ENST00000589146 MROH1Q8NDA8 1641 aa32.79■■■□□ 2.84
CAPNS1-207ENST00000589146 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.79■■■□□ 2.84
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP10AO60312 1499 aa32.77■■■□□ 2.84
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF3BO15066 747 aa32.75■■■□□ 2.83
CAPNS1-207ENST00000589146 KANK1Q14678 1352 aa32.74■■■□□ 2.83
CAPNS1-207ENST00000589146 TET3O43151 1660 aa32.73■■■□□ 2.83
CAPNS1-207ENST00000589146 PLA2R1Q13018 1463 aa32.7■■■□□ 2.83
CAPNS1-207ENST00000589146 LMTK2Q8IWU2 1503 aa32.7■■■□□ 2.83
CAPNS1-207ENST00000589146 L3MBTL2Q969R5 705 aa32.69■■■□□ 2.82
CAPNS1-207ENST00000589146 E9PCH4 1651 aa32.66■■■□□ 2.82
CAPNS1-207ENST00000589146 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.66■■■□□ 2.82
CAPNS1-207ENST00000589146 REREQ9P2R6 1566 aa32.63■■■□□ 2.81
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPRTO14522 1441 aa32.61■■■□□ 2.81
CAPNS1-207ENST00000589146 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC144AA2RUR9 1427 aa32.6■■■□□ 2.81
CAPNS1-207ENST00000589146 EFCAB6Q5THR3 1501 aa32.57■■■□□ 2.8
CAPNS1-207ENST00000589146 TRPM2O94759 1503 aa32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-207ENST00000589146 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa32.54■■■□□ 2.8
CAPNS1-207ENST00000589146 AGLP35573 1532 aa32.53■■■□□ 2.8
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP152O94986 1710 aa32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCC3O15438 1527 aa32.51■■■□□ 2.79
CAPNS1-207ENST00000589146 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.5■■■□□ 2.79
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.48■■■□□ 2.79
CAPNS1-207ENST00000589146 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
CAPNS1-207ENST00000589146 NBPF8Q3BBV2 869 aa32.45■■■□□ 2.79
CAPNS1-207ENST00000589146 GGT6Q6P531 493 aa32.45■■■□□ 2.79
CAPNS1-207ENST00000589146 NEURL4Q96JN8 1562 aa32.43■■■□□ 2.78
CAPNS1-207ENST00000589146 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa32.41■■■□□ 2.78
CAPNS1-207ENST00000589146 CLTCL1P53675 1640 aa32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-207ENST00000589146 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa32.4■■■□□ 2.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP6R1Q9UPN7 881 aa32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-207ENST00000589146 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa32.39■■■□□ 2.78
CAPNS1-207ENST00000589146 NPATQ14207 1427 aa32.38■■■□□ 2.77
CAPNS1-207ENST00000589146 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-207ENST00000589146 RALGAPBQ86X10 1494 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-207ENST00000589146 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-207ENST00000589146 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-207ENST00000589146 NOS1P29475 1434 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-207ENST00000589146 DCAF11Q8TEB1 546 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-207ENST00000589146 STAC3Q96MF2 364 aa32.28■■■□□ 2.76
CAPNS1-207ENST00000589146 PRAG1Q86YV5 1406 aa32.27■■■□□ 2.76
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP32.25■■■□□ 2.75
CAPNS1-207ENST00000589146 RGL3Q3MIN7 710 aa32.24■■■□□ 2.75
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF1BO60333 1816 aa32.23■■■□□ 2.75
CAPNS1-207ENST00000589146 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
CAPNS1-207ENST00000589146 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-207ENST00000589146 UGGT1Q9NYU2 1555 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-207ENST00000589146 PIK3C2BO00750 1634 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-207ENST00000589146 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-207ENST00000589146 ADGRB3O60242 1522 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-207ENST00000589146 SYNMO15061 1565 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-207ENST00000589146 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-207ENST00000589146 LAMC1P11047 1609 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-207ENST00000589146 GPRASP1Q5JY77 1395 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-207ENST00000589146 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-207ENST00000589146 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-207ENST00000589146 MROH2AA6NES4 1674 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-207ENST00000589146 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-207ENST00000589146 MADDQ8WXG6 1647 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-207ENST00000589146 IFT172Q9UG01 1749 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-207ENST00000589146 MYOM2P54296 1465 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-207ENST00000589146 USP47Q96K76 1375 aa32.07■■■□□ 2.73
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC52A1Q9NWF4 448 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-207ENST00000589146 ERVK-7P63135 1459 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-207ENST00000589146 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-207ENST00000589146 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-207ENST00000589146 CARD11Q9BXL7 1154 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-207ENST00000589146 NRXN1Q9ULB1 1477 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa32.02■■■□□ 2.72
CAPNS1-207ENST00000589146 PPLO60437 1756 aa31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-207ENST00000589146 MLECQ14165 292 aa31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-207ENST00000589146 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
CAPNS1-207ENST00000589146 IDI1Q13907 227 aa31.97■■■□□ 2.71
CAPNS1-207ENST00000589146 NBPF1Q3BBV0 1214 aa31.96■■■□□ 2.71
CAPNS1-207ENST00000589146 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.7
CAPNS1-207ENST00000589146 WASHC2AQ641Q2 1341 aa31.95■■■□□ 2.7
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
CAPNS1-207ENST00000589146 ZMYM3Q14202 1370 aa31.94■■■□□ 2.7
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa31.93■■■□□ 2.7
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