RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587324.1

UBXN6-204, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 712 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-204ENST00000587324 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.34■■■□□ 2.45
UBXN6-204ENST00000587324 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.33■■■□□ 2.45
UBXN6-204ENST00000587324 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.32■■■□□ 2.44
UBXN6-204ENST00000587324 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.32■■■□□ 2.44
UBXN6-204ENST00000587324 NCOA2Q15596 1464 aa30.31■■■□□ 2.44
UBXN6-204ENST00000587324 PZPP20742 1482 aa30.3■■■□□ 2.44
UBXN6-204ENST00000587324 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
UBXN6-204ENST00000587324 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.28■■■□□ 2.44
UBXN6-204ENST00000587324 TNRQ92752 1358 aa30.28■■■□□ 2.44
UBXN6-204ENST00000587324 KIF3BO15066 747 aa30.25■■■□□ 2.43
UBXN6-204ENST00000587324 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.24■■■□□ 2.43
UBXN6-204ENST00000587324 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.2■■■□□ 2.43
UBXN6-204ENST00000587324 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
UBXN6-204ENST00000587324 CPS1P31327 1500 aa30.18■■■□□ 2.42
UBXN6-204ENST00000587324 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.18■■■□□ 2.42
UBXN6-204ENST00000587324 ALKQ9UM73 1620 aa30.16■■■□□ 2.42
UBXN6-204ENST00000587324 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.15■■■□□ 2.42
UBXN6-204ENST00000587324 DEPDC5O75140 1603 aa30.14■■■□□ 2.42
UBXN6-204ENST00000587324 MIA2Q96PC5 1412 aa30.14■■■□□ 2.42
UBXN6-204ENST00000587324 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.14■■■□□ 2.42
UBXN6-204ENST00000587324 NLRP1Q9C000 1473 aa30.13■■■□□ 2.41
UBXN6-204ENST00000587324 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.13■■■□□ 2.41
UBXN6-204ENST00000587324 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.13■■■□□ 2.41
UBXN6-204ENST00000587324 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.12■■■□□ 2.41
UBXN6-204ENST00000587324 ABCC3O15438 1527 aa30.12■■■□□ 2.41
UBXN6-204ENST00000587324 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.11■■■□□ 2.41
UBXN6-204ENST00000587324 MED14O60244 1454 aa30.11■■■□□ 2.41
UBXN6-204ENST00000587324 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
UBXN6-204ENST00000587324 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
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UBXN6-204ENST00000587324 HSPA1LP34931 641 aa30.09■■■□□ 2.41
UBXN6-204ENST00000587324 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
UBXN6-204ENST00000587324 CEP152O94986 1710 aa30.08■■■□□ 2.41
UBXN6-204ENST00000587324 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.08■■■□□ 2.41
UBXN6-204ENST00000587324 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
UBXN6-204ENST00000587324 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
UBXN6-204ENST00000587324 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.06■■■□□ 2.4
UBXN6-204ENST00000587324 PIP4K2BP78356 416 aa30.04■■■□□ 2.4
UBXN6-204ENST00000587324 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.04■■■□□ 2.4
UBXN6-204ENST00000587324 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
UBXN6-204ENST00000587324 ERVK-7P63135 1459 aa30.02■■■□□ 2.4
UBXN6-204ENST00000587324 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
UBXN6-204ENST00000587324 UBR1Q8IWV7 1749 aa30■■■□□ 2.39
UBXN6-204ENST00000587324 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.99■■■□□ 2.39
UBXN6-204ENST00000587324 TSPY4P0CV99 314 aa29.98■■■□□ 2.39
UBXN6-204ENST00000587324 TSPY10P0CW01 314 aa29.98■■■□□ 2.39
UBXN6-204ENST00000587324 TOM1O60784 492 aa29.97■■■□□ 2.39
UBXN6-204ENST00000587324 SYNMO15061 1565 aa29.95■■■□□ 2.39
UBXN6-204ENST00000587324 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.94■■■□□ 2.38
UBXN6-204ENST00000587324 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
UBXN6-204ENST00000587324 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.91■■■□□ 2.38
UBXN6-204ENST00000587324 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.9■■■□□ 2.38
UBXN6-204ENST00000587324 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
UBXN6-204ENST00000587324 MAP3K1Q13233 1512 aa29.89■■■□□ 2.38
UBXN6-204ENST00000587324 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.89■■■□□ 2.38
UBXN6-204ENST00000587324 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
UBXN6-204ENST00000587324 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.85■■■□□ 2.37
UBXN6-204ENST00000587324 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
UBXN6-204ENST00000587324 SLIT1O75093 1534 aa29.83■■■□□ 2.37
UBXN6-204ENST00000587324 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.81■■■□□ 2.36
UBXN6-204ENST00000587324 PIK3C2BO00750 1634 aa29.81■■■□□ 2.36
UBXN6-204ENST00000587324 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.79■■■□□ 2.36
UBXN6-204ENST00000587324 LTKP29376 864 aa29.78■■■□□ 2.36
UBXN6-204ENST00000587324 ABCC5O15440 1437 aa29.78■■■□□ 2.36
UBXN6-204ENST00000587324 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.78■■■□□ 2.36
UBXN6-204ENST00000587324 KIF15Q9NS87 1388 aa29.77■■■□□ 2.36
UBXN6-204ENST00000587324 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
UBXN6-204ENST00000587324 ERBINQ96RT1 1412 aa29.75■■■□□ 2.35
UBXN6-204ENST00000587324 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
UBXN6-204ENST00000587324 DAPK1P53355 1430 aa29.68■■■□□ 2.34
UBXN6-204ENST00000587324 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.67■■■□□ 2.34
UBXN6-204ENST00000587324 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.67■■■□□ 2.34
UBXN6-204ENST00000587324 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
UBXN6-204ENST00000587324 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.65■■■□□ 2.34
UBXN6-204ENST00000587324 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.64■■■□□ 2.34
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UBXN6-204ENST00000587324 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.61■■■□□ 2.33
UBXN6-204ENST00000587324 TET3O43151 1660 aa29.6■■■□□ 2.33
UBXN6-204ENST00000587324 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
UBXN6-204ENST00000587324 ADGRB3O60242 1522 aa29.55■■■□□ 2.32
UBXN6-204ENST00000587324 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.55■■■□□ 2.32
UBXN6-204ENST00000587324 EID1Q9Y6B2 187 aa29.55■■■□□ 2.32
UBXN6-204ENST00000587324 NOS1P29475 1434 aa29.54■■■□□ 2.32
UBXN6-204ENST00000587324 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.54■■■□□ 2.32
UBXN6-204ENST00000587324 IDI1Q13907 227 aa29.54■■■□□ 2.32
UBXN6-204ENST00000587324 NWD1Q149M9 1564 aa29.54■■■□□ 2.32
UBXN6-204ENST00000587324 TMEM94Q12767 1356 aa29.53■■■□□ 2.32
UBXN6-204ENST00000587324 KANK1Q14678 1352 aa29.53■■■□□ 2.32
UBXN6-204ENST00000587324 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.52■■■□□ 2.32
UBXN6-204ENST00000587324 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.51■■■□□ 2.31
UBXN6-204ENST00000587324 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.49■■■□□ 2.31
UBXN6-204ENST00000587324 ADGRL2O95490 1459 aa29.48■■■□□ 2.31
UBXN6-204ENST00000587324 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.47■■■□□ 2.31
UBXN6-204ENST00000587324 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
UBXN6-204ENST00000587324 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.46■■■□□ 2.31
UBXN6-204ENST00000587324 KCNA6P17658 529 aa29.45■■■□□ 2.31
UBXN6-204ENST00000587324 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.44■■■□□ 2.3
UBXN6-204ENST00000587324 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
UBXN6-204ENST00000587324 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
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