RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585934.1

TRAPPC6A-202, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ABCC5O15440 1437 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC6A-202ENST00000585934 DAPK1P53355 1430 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC6A-202ENST00000585934 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC6A-202ENST00000585934 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PTPRKQ15262 1439 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KIF15Q9NS87 1388 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC6A-202ENST00000585934 STRCQ7RTU9 1775 aa25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC6A-202ENST00000585934 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PZPP20742 1482 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ERBINQ96RT1 1412 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC6A-202ENST00000585934 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CEP152O94986 1710 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ABCC3O15438 1527 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NCOA1Q15788 1441 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-202ENST00000585934 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TNRQ92752 1358 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-202ENST00000585934 DEPDC5O75140 1603 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-202ENST00000585934 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ADGRL2O95490 1459 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PLA2R1Q13018 1463 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PTPRTO14522 1441 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KANK1Q14678 1352 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ERVK-7P63135 1459 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NLRP1Q9C000 1473 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-202ENST00000585934 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-202ENST00000585934 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-202ENST00000585934 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PKD2Q13563 968 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FBXO41Q8TF61 875 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-202ENST00000585934 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-202ENST00000585934 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CERKQ8TCT0 537 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ITGAEP38570 1179 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ROCK1Q13464 1354 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-202ENST00000585934 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-202ENST00000585934 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-202ENST00000585934 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-202ENST00000585934 UNC13BO14795 1591 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-202ENST00000585934 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-202ENST00000585934 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TET3O43151 1660 aa24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-202ENST00000585934 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PIK3C2BO00750 1634 aa24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-202ENST00000585934 IQGAP1P46940 1657 aa24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SYNMO15061 1565 aa24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-202ENST00000585934 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-202ENST00000585934 MED14O60244 1454 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-202ENST00000585934 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NOS1P29475 1434 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-202ENST00000585934 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SLIT1O75093 1534 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-202ENST00000585934 E9PCH4 1651 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ADGRB3O60242 1522 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NUP155O75694 1391 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CPS1P31327 1500 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-202ENST00000585934 IDI1Q13907 227 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC6A-202ENST00000585934 EID1Q9Y6B2 187 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-202ENST00000585934 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NAIPQ13075 1403 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-202ENST00000585934 LTKP29376 864 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC6A-202ENST00000585934 HFM1A2PYH4 1435 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC6A-202ENST00000585934 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC6A-202ENST00000585934 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC6A-202ENST00000585934 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ZFYVE9O95405 1425 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC6A-202ENST00000585934 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC6A-202ENST00000585934 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TRIM52Q96A61 297 aa24.58■■□□□ 1.53
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