RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585149.1

TSPOAP1-211, Transcript of TSPO associated protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSPOAP1, Length 381 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-211ENST00000585149 KANK1Q14678 1352 aa25.52■■□□□ 1.68
TSPOAP1-211ENST00000585149 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
TSPOAP1-211ENST00000585149 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPOAP1-211ENST00000585149 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TSPOAP1-211ENST00000585149 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPOAP1-211ENST00000585149 TRIM52Q96A61 297 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-211ENST00000585149 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-211ENST00000585149 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-211ENST00000585149 DEPDC5O75140 1603 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-211ENST00000585149 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPOAP1-211ENST00000585149 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPOAP1-211ENST00000585149 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
TSPOAP1-211ENST00000585149 HRCP23327 699 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-211ENST00000585149 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-211ENST00000585149 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-211ENST00000585149 NUP155O75694 1391 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-211ENST00000585149 MADDQ8WXG6 1647 aa25.4■■□□□ 1.66
TSPOAP1-211ENST00000585149 UNC13BO14795 1591 aa25.39■■□□□ 1.66
TSPOAP1-211ENST00000585149 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-211ENST00000585149 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
TSPOAP1-211ENST00000585149 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPOAP1-211ENST00000585149 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.37■■□□□ 1.65
TSPOAP1-211ENST00000585149 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TSPOAP1-211ENST00000585149 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
TSPOAP1-211ENST00000585149 ABCC3O15438 1527 aa25.33■■□□□ 1.65
TSPOAP1-211ENST00000585149 MROH2AA6NES4 1674 aa25.33■■□□□ 1.65
TSPOAP1-211ENST00000585149 ZMYM3Q14202 1370 aa25.32■■□□□ 1.64
TSPOAP1-211ENST00000585149 CEP152O94986 1710 aa25.32■■□□□ 1.64
TSPOAP1-211ENST00000585149 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPOAP1-211ENST00000585149 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.3■■□□□ 1.64
TSPOAP1-211ENST00000585149 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.3■■□□□ 1.64
TSPOAP1-211ENST00000585149 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-211ENST00000585149 PTPRMP28827 1452 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPOAP1-211ENST00000585149 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TSPOAP1-211ENST00000585149 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-211ENST00000585149 TET3O43151 1660 aa25.26■■□□□ 1.63
TSPOAP1-211ENST00000585149 C3P01024 1663 aa25.24■■□□□ 1.63
TSPOAP1-211ENST00000585149 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TSPOAP1-211ENST00000585149 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.23■■□□□ 1.63
TSPOAP1-211ENST00000585149 PZPP20742 1482 aa25.22■■□□□ 1.63
TSPOAP1-211ENST00000585149 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.22■■□□□ 1.63
TSPOAP1-211ENST00000585149 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.22■■□□□ 1.63
TSPOAP1-211ENST00000585149 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TSPOAP1-211ENST00000585149 PKD2Q13563 968 aa25.19■■□□□ 1.62
TSPOAP1-211ENST00000585149 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TSPOAP1-211ENST00000585149 NPATQ14207 1427 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-211ENST00000585149 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TSPOAP1-211ENST00000585149 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-211ENST00000585149 E9PCH4 1651 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPOAP1-211ENST00000585149 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TSPOAP1-211ENST00000585149 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPOAP1-211ENST00000585149 ERVK-7P63135 1459 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPOAP1-211ENST00000585149 TNRQ92752 1358 aa25.11■■□□□ 1.61
TSPOAP1-211ENST00000585149 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.1■■□□□ 1.61
TSPOAP1-211ENST00000585149 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.07■■□□□ 1.6
TSPOAP1-211ENST00000585149 NOS1P29475 1434 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-211ENST00000585149 FOXD1Q16676 465 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-211ENST00000585149 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-211ENST00000585149 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.03■■□□□ 1.6
TSPOAP1-211ENST00000585149 NLRP1Q9C000 1473 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-211ENST00000585149 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-211ENST00000585149 PTPRTO14522 1441 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-211ENST00000585149 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.98■■□□□ 1.59
TSPOAP1-211ENST00000585149 SYNMO15061 1565 aa24.98■■□□□ 1.59
TSPOAP1-211ENST00000585149 TRPM2O94759 1503 aa24.98■■□□□ 1.59
TSPOAP1-211ENST00000585149 IDI1Q13907 227 aa24.98■■□□□ 1.59
TSPOAP1-211ENST00000585149 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
TSPOAP1-211ENST00000585149 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.96■■□□□ 1.59
TSPOAP1-211ENST00000585149 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.96■■□□□ 1.59
TSPOAP1-211ENST00000585149 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
TSPOAP1-211ENST00000585149 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
TSPOAP1-211ENST00000585149 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
TSPOAP1-211ENST00000585149 PLA2R1Q13018 1463 aa24.93■■□□□ 1.58
TSPOAP1-211ENST00000585149 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.93■■□□□ 1.58
TSPOAP1-211ENST00000585149 PIK3C2BO00750 1634 aa24.92■■□□□ 1.58
TSPOAP1-211ENST00000585149 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.92■■□□□ 1.58
TSPOAP1-211ENST00000585149 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
TSPOAP1-211ENST00000585149 KIF1BO60333 1816 aa24.89■■□□□ 1.58
TSPOAP1-211ENST00000585149 CLTCL1P53675 1640 aa24.89■■□□□ 1.57
TSPOAP1-211ENST00000585149 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
TSPOAP1-211ENST00000585149 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
TSPOAP1-211ENST00000585149 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.86■■□□□ 1.57
TSPOAP1-211ENST00000585149 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
TSPOAP1-211ENST00000585149 ADGRB3O60242 1522 aa24.86■■□□□ 1.57
TSPOAP1-211ENST00000585149 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
TSPOAP1-211ENST00000585149 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.85■■□□□ 1.57
TSPOAP1-211ENST00000585149 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.83■■□□□ 1.56
TSPOAP1-211ENST00000585149 EID1Q9Y6B2 187 aa24.82■■□□□ 1.56
TSPOAP1-211ENST00000585149 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.82■■□□□ 1.56
TSPOAP1-211ENST00000585149 HSPA2P54652 639 aa24.81■■□□□ 1.56
TSPOAP1-211ENST00000585149 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.79■■□□□ 1.56
TSPOAP1-211ENST00000585149 NEUROD1Q13562 356 aa24.78■■□□□ 1.56
TSPOAP1-211ENST00000585149 RGL3Q3MIN7 710 aa24.78■■□□□ 1.56
TSPOAP1-211ENST00000585149 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.56
TSPOAP1-211ENST00000585149 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.77■■□□□ 1.56
TSPOAP1-211ENST00000585149 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.77■■□□□ 1.56
TSPOAP1-211ENST00000585149 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.77■■□□□ 1.56
TSPOAP1-211ENST00000585149 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
TSPOAP1-211ENST00000585149 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.75■■□□□ 1.55
TSPOAP1-211ENST00000585149 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms