RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584400.5

SMARCD2-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 2, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCD2, Length 1,017 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD2-210ENST00000584400 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.73■■■■■ 4.27
SMARCD2-210ENST00000584400 NPATQ14207 1427 aa41.73■■■■■ 4.27
SMARCD2-210ENST00000584400 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
SMARCD2-210ENST00000584400 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.71■■■■■ 4.27
SMARCD2-210ENST00000584400 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
SMARCD2-210ENST00000584400 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.7■■■■■ 4.27
SMARCD2-210ENST00000584400 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.68■■■■■ 4.26
SMARCD2-210ENST00000584400 ERBINQ96RT1 1412 aa41.68■■■■■ 4.26
SMARCD2-210ENST00000584400 HSPA2P54652 639 aa41.66■■■■■ 4.26
SMARCD2-210ENST00000584400 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
SMARCD2-210ENST00000584400 NCOA1Q15788 1441 aa41.63■■■■■ 4.26
SMARCD2-210ENST00000584400 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
SMARCD2-210ENST00000584400 ADGRL2O95490 1459 aa41.6■■■■■ 4.25
SMARCD2-210ENST00000584400 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.6■■■■■ 4.259e-6■□□□□ 9.6
SMARCD2-210ENST00000584400 PTPRKQ15262 1439 aa41.6■■■■■ 4.25
SMARCD2-210ENST00000584400 PZPP20742 1482 aa41.51■■■■■ 4.24
SMARCD2-210ENST00000584400 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
SMARCD2-210ENST00000584400 ABCC3O15438 1527 aa41.47■■■■■ 4.23
SMARCD2-210ENST00000584400 KANK1Q14678 1352 aa41.47■■■■■ 4.23
SMARCD2-210ENST00000584400 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.44■■■■■ 4.22
SMARCD2-210ENST00000584400 ROCK1Q13464 1354 aa41.44■■■■■ 4.22
SMARCD2-210ENST00000584400 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.43■■■■■ 4.225e-8■■■□□ 15
SMARCD2-210ENST00000584400 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
SMARCD2-210ENST00000584400 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
SMARCD2-210ENST00000584400 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.42■■■■■ 4.22
SMARCD2-210ENST00000584400 ITGAEP38570 1179 aa41.41■■■■■ 4.22
SMARCD2-210ENST00000584400 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
SMARCD2-210ENST00000584400 TNRQ92752 1358 aa41.4■■■■■ 4.22
SMARCD2-210ENST00000584400 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.4■■■■■ 4.22
SMARCD2-210ENST00000584400 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.36■■■■■ 4.21
SMARCD2-210ENST00000584400 DEPDC5O75140 1603 aa41.36■■■■■ 4.21
SMARCD2-210ENST00000584400 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.2
SMARCD2-210ENST00000584400 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.29■■■■■ 4.2
SMARCD2-210ENST00000584400 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.29■■■■■ 4.2
SMARCD2-210ENST00000584400 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
SMARCD2-210ENST00000584400 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.28■■■■■ 4.2
SMARCD2-210ENST00000584400 NLRP1Q9C000 1473 aa41.27■■■■■ 4.2
SMARCD2-210ENST00000584400 CEP152O94986 1710 aa41.27■■■■■ 4.2
SMARCD2-210ENST00000584400 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.23■■■■■ 4.19
SMARCD2-210ENST00000584400 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.23■■■■■ 4.19
SMARCD2-210ENST00000584400 ERVK-7P63135 1459 aa41.22■■■■■ 4.19
SMARCD2-210ENST00000584400 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.21■■■■■ 4.19
SMARCD2-210ENST00000584400 PLA2R1Q13018 1463 aa41.21■■■■■ 4.19
SMARCD2-210ENST00000584400 PKD2Q13563 968 aa41.18■■■■■ 4.18
SMARCD2-210ENST00000584400 STRCQ7RTU9 1775 aa41.17■■■■■ 4.18
SMARCD2-210ENST00000584400 PTPRTO14522 1441 aa41.17■■■■■ 4.18
SMARCD2-210ENST00000584400 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
SMARCD2-210ENST00000584400 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.09■■■■■ 4.17
SMARCD2-210ENST00000584400 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.08■■■■■ 4.17
SMARCD2-210ENST00000584400 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.07■■■■■ 4.16
SMARCD2-210ENST00000584400 UNC13BO14795 1591 aa41.07■■■■■ 4.16
SMARCD2-210ENST00000584400 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
SMARCD2-210ENST00000584400 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.01■■■■■ 4.16
SMARCD2-210ENST00000584400 NUP155O75694 1391 aa41■■■■■ 4.15
SMARCD2-210ENST00000584400 TET3O43151 1660 aa40.96■■■■■ 4.15
SMARCD2-210ENST00000584400 NOS1P29475 1434 aa40.95■■■■■ 4.15
SMARCD2-210ENST00000584400 NAIPQ13075 1403 aa40.95■■■■■ 4.15
SMARCD2-210ENST00000584400 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.94■■■■■ 4.14
SMARCD2-210ENST00000584400 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.94■■■■■ 4.14
SMARCD2-210ENST00000584400 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
SMARCD2-210ENST00000584400 HFM1A2PYH4 1435 aa40.92■■■■■ 4.14
SMARCD2-210ENST00000584400 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.91■■■■■ 4.14
SMARCD2-210ENST00000584400 IDI1Q13907 227 aa40.88■■■■■ 4.13
SMARCD2-210ENST00000584400 CERKQ8TCT0 537 aa40.87■■■■■ 4.13
SMARCD2-210ENST00000584400 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.87■■■■■ 4.13
SMARCD2-210ENST00000584400 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.83■■■■■ 4.13
SMARCD2-210ENST00000584400 SYNMO15061 1565 aa40.82■■■■■ 4.13
SMARCD2-210ENST00000584400 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
SMARCD2-210ENST00000584400 PIK3C2BO00750 1634 aa40.79■■■■■ 4.12
SMARCD2-210ENST00000584400 MED14O60244 1454 aa40.79■■■■■ 4.12
SMARCD2-210ENST00000584400 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
SMARCD2-210ENST00000584400 EID1Q9Y6B2 187 aa40.79■■■■■ 4.12
SMARCD2-210ENST00000584400 FBXO41Q8TF61 875 aa40.78■■■■■ 4.12
SMARCD2-210ENST00000584400 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
SMARCD2-210ENST00000584400 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.77■■■■■ 4.12
SMARCD2-210ENST00000584400 SLIT1O75093 1534 aa40.76■■■■■ 4.12
SMARCD2-210ENST00000584400 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
SMARCD2-210ENST00000584400 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.75■■■■■ 4.11
SMARCD2-210ENST00000584400 TRIM52Q96A61 297 aa40.74■■■■■ 4.11
SMARCD2-210ENST00000584400 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.74■■■■■ 4.11
SMARCD2-210ENST00000584400 E9PCH4 1651 aa40.74■■■■■ 4.11
SMARCD2-210ENST00000584400 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.74■■■■■ 4.11
SMARCD2-210ENST00000584400 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
SMARCD2-210ENST00000584400 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
SMARCD2-210ENST00000584400 ADGRB3O60242 1522 aa40.69■■■■■ 4.1
SMARCD2-210ENST00000584400 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.67■■■■■ 4.1
SMARCD2-210ENST00000584400 LTKP29376 864 aa40.66■■■■■ 4.1
SMARCD2-210ENST00000584400 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
SMARCD2-210ENST00000584400 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
SMARCD2-210ENST00000584400 IQGAP1P46940 1657 aa40.62■■■■■ 4.09
SMARCD2-210ENST00000584400 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
SMARCD2-210ENST00000584400 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
SMARCD2-210ENST00000584400 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.58■■■■■ 4.09
SMARCD2-210ENST00000584400 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.51■■■■■ 4.08
SMARCD2-210ENST00000584400 CPS1P31327 1500 aa40.51■■■■■ 4.08
SMARCD2-210ENST00000584400 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.5■■■■■ 4.07
SMARCD2-210ENST00000584400 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.5■■■■■ 4.07
SMARCD2-210ENST00000584400 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
SMARCD2-210ENST00000584400 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.47■■■■■ 4.07
SMARCD2-210ENST00000584400 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.47■■■■■ 4.07
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