RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584216.5

COPS3-218, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene COPS3, Length 876 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-218ENST00000584216 CEP162Q5TB80 1403 aa21.51■■□□□ 1.03
COPS3-218ENST00000584216 CPS1P31327 1500 aa21.5■■□□□ 1.03
COPS3-218ENST00000584216 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.5■■□□□ 1.03
COPS3-218ENST00000584216 KIF3BO15066 747 aa21.49■■□□□ 1.03
COPS3-218ENST00000584216 TOM1O60784 492 aa21.49■■□□□ 1.03
COPS3-218ENST00000584216 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.49■■□□□ 1.03
COPS3-218ENST00000584216 PZPP20742 1482 aa21.48■■□□□ 1.03
COPS3-218ENST00000584216 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
COPS3-218ENST00000584216 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.47■■□□□ 1.03
COPS3-218ENST00000584216 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.47■■□□□ 1.03
COPS3-218ENST00000584216 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.46■■□□□ 1.03
COPS3-218ENST00000584216 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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COPS3-218ENST00000584216 PIP4K2BP78356 416 aa21.43■■□□□ 1.02
COPS3-218ENST00000584216 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
COPS3-218ENST00000584216 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
COPS3-218ENST00000584216 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.42■■□□□ 1.02
COPS3-218ENST00000584216 MIA2Q96PC5 1412 aa21.41■■□□□ 1.02
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COPS3-218ENST00000584216 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.02
COPS3-218ENST00000584216 TSPY4P0CV99 314 aa21.39■■□□□ 1.01
COPS3-218ENST00000584216 TSPY10P0CW01 314 aa21.39■■□□□ 1.01
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COPS3-218ENST00000584216 NCOA2Q15596 1464 aa21.38■■□□□ 1.01
COPS3-218ENST00000584216 MED14O60244 1454 aa21.37■■□□□ 1.01
COPS3-218ENST00000584216 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
COPS3-218ENST00000584216 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
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COPS3-218ENST00000584216 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.34■■□□□ 1.01
COPS3-218ENST00000584216 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.34■■□□□ 1.01
COPS3-218ENST00000584216 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
COPS3-218ENST00000584216 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
COPS3-218ENST00000584216 IQGAP1P46940 1657 aa21.28■■□□□ 1
COPS3-218ENST00000584216 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
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COPS3-218ENST00000584216 ERVK-7P63135 1459 aa21.24■□□□□ 0.99
COPS3-218ENST00000584216 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.23■□□□□ 0.99
COPS3-218ENST00000584216 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
COPS3-218ENST00000584216 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.22■□□□□ 0.99
COPS3-218ENST00000584216 ALKQ9UM73 1620 aa21.2■□□□□ 0.98
COPS3-218ENST00000584216 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.2■□□□□ 0.98
COPS3-218ENST00000584216 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
COPS3-218ENST00000584216 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.16■□□□□ 0.98
COPS3-218ENST00000584216 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.15■□□□□ 0.98
COPS3-218ENST00000584216 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.15■□□□□ 0.98
COPS3-218ENST00000584216 EID1Q9Y6B2 187 aa21.15■□□□□ 0.98
COPS3-218ENST00000584216 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.14■□□□□ 0.97
COPS3-218ENST00000584216 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.13■□□□□ 0.97
COPS3-218ENST00000584216 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.13■□□□□ 0.97
COPS3-218ENST00000584216 SLIT1O75093 1534 aa21.13■□□□□ 0.97
COPS3-218ENST00000584216 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.12■□□□□ 0.97
COPS3-218ENST00000584216 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
COPS3-218ENST00000584216 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.12■□□□□ 0.97
COPS3-218ENST00000584216 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.11■□□□□ 0.97
COPS3-218ENST00000584216 MAP3K1Q13233 1512 aa21.11■□□□□ 0.97
COPS3-218ENST00000584216 ERBINQ96RT1 1412 aa21.1■□□□□ 0.97
COPS3-218ENST00000584216 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
COPS3-218ENST00000584216 KIF15Q9NS87 1388 aa21.09■□□□□ 0.97
COPS3-218ENST00000584216 CEP152O94986 1710 aa21.08■□□□□ 0.97
COPS3-218ENST00000584216 LTKP29376 864 aa21.08■□□□□ 0.97
COPS3-218ENST00000584216 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.07■□□□□ 0.96
COPS3-218ENST00000584216 KANK1Q14678 1352 aa21.07■□□□□ 0.96
COPS3-218ENST00000584216 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.05■□□□□ 0.96
COPS3-218ENST00000584216 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
COPS3-218ENST00000584216 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.04■□□□□ 0.96
COPS3-218ENST00000584216 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.02■□□□□ 0.96
COPS3-218ENST00000584216 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.02■□□□□ 0.96
COPS3-218ENST00000584216 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.99■□□□□ 0.95
COPS3-218ENST00000584216 ABCC5O15440 1437 aa20.99■□□□□ 0.95
COPS3-218ENST00000584216 PIK3C2BO00750 1634 aa20.99■□□□□ 0.95
COPS3-218ENST00000584216 TMEM94Q12767 1356 aa20.98■□□□□ 0.95
COPS3-218ENST00000584216 KCNA6P17658 529 aa20.98■□□□□ 0.95
COPS3-218ENST00000584216 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
COPS3-218ENST00000584216 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
COPS3-218ENST00000584216 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.96■□□□□ 0.95
COPS3-218ENST00000584216 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.96■□□□□ 0.95
COPS3-218ENST00000584216 APLP2Q06481 763 aa20.96■□□□□ 0.95
COPS3-218ENST00000584216 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.96■□□□□ 0.95
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COPS3-218ENST00000584216 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
COPS3-218ENST00000584216 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.94■□□□□ 0.94
COPS3-218ENST00000584216 IDI1Q13907 227 aa20.94■□□□□ 0.94
COPS3-218ENST00000584216 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
COPS3-218ENST00000584216 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
COPS3-218ENST00000584216 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
COPS3-218ENST00000584216 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.91■□□□□ 0.94
COPS3-218ENST00000584216 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.91■□□□□ 0.94
COPS3-218ENST00000584216 MSH6P52701 1360 aa20.9■□□□□ 0.94
COPS3-218ENST00000584216 TET3O43151 1660 aa20.89■□□□□ 0.94
COPS3-218ENST00000584216 ADGRB3O60242 1522 aa20.89■□□□□ 0.94
COPS3-218ENST00000584216 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.89■□□□□ 0.94
COPS3-218ENST00000584216 BCANQ96GW7 911 aa20.89■□□□□ 0.93
COPS3-218ENST00000584216 NOS1P29475 1434 aa20.88■□□□□ 0.93
COPS3-218ENST00000584216 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.88■□□□□ 0.93
COPS3-218ENST00000584216 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.88■□□□□ 0.93
COPS3-218ENST00000584216 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
COPS3-218ENST00000584216 NWD1Q149M9 1564 aa20.87■□□□□ 0.93
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