RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581792.1

MIR3648-2-201, Transcript of microRNA 3648-2, humanhuman

BASIC

Gene MIR3648-2, Length 180 nt, Biotype miRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR3648-2-201ENST00000581792 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.16■■■■■ 4.02
MIR3648-2-201ENST00000581792 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.16■■■■■ 4.02
MIR3648-2-201ENST00000581792 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.15■■■■■ 4.02
MIR3648-2-201ENST00000581792 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
MIR3648-2-201ENST00000581792 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.12■■■■■ 4.01
MIR3648-2-201ENST00000581792 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
MIR3648-2-201ENST00000581792 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
MIR3648-2-201ENST00000581792 PZPP20742 1482 aa40.07■■■■■ 4.01
MIR3648-2-201ENST00000581792 ABCC5O15440 1437 aa40.07■■■■■ 4
MIR3648-2-201ENST00000581792 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.06■■■■■ 4
MIR3648-2-201ENST00000581792 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
MIR3648-2-201ENST00000581792 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
MIR3648-2-201ENST00000581792 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.03■■■■■ 4
MIR3648-2-201ENST00000581792 PLA2R1Q13018 1463 aa40.02■■■■■ 4
MIR3648-2-201ENST00000581792 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.02■■■■■ 4
MIR3648-2-201ENST00000581792 TNRQ92752 1358 aa40.02■■■■■ 4
MIR3648-2-201ENST00000581792 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.01■■■■■ 4
MIR3648-2-201ENST00000581792 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.01■■■■■ 4
MIR3648-2-201ENST00000581792 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
MIR3648-2-201ENST00000581792 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.99■■■■□ 3.99
MIR3648-2-201ENST00000581792 PKD2Q13563 968 aa39.99■■■■□ 3.99
MIR3648-2-201ENST00000581792 DAPK1P53355 1430 aa39.98■■■■□ 3.99
MIR3648-2-201ENST00000581792 KIF15Q9NS87 1388 aa39.97■■■■□ 3.99
MIR3648-2-201ENST00000581792 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
MIR3648-2-201ENST00000581792 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.95■■■■□ 3.99
MIR3648-2-201ENST00000581792 ABCC3O15438 1527 aa39.95■■■■□ 3.99
MIR3648-2-201ENST00000581792 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
MIR3648-2-201ENST00000581792 MROH1Q8NDA8 1641 aa39.92■■■■□ 3.98
MIR3648-2-201ENST00000581792 LTBP4Q8N2S1 1624 aa39.88■■■■□ 3.97
MIR3648-2-201ENST00000581792 ERBINQ96RT1 1412 aa39.87■■■■□ 3.97
MIR3648-2-201ENST00000581792 NLRP1Q9C000 1473 aa39.84■■■■□ 3.97
MIR3648-2-201ENST00000581792 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.84■■■■□ 3.97
MIR3648-2-201ENST00000581792 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.82■■■■□ 3.96
MIR3648-2-201ENST00000581792 CEP152O94986 1710 aa39.82■■■■□ 3.96
MIR3648-2-201ENST00000581792 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa39.8■■■■□ 3.96
MIR3648-2-201ENST00000581792 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
MIR3648-2-201ENST00000581792 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
MIR3648-2-201ENST00000581792 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
MIR3648-2-201ENST00000581792 UGGT1Q9NYU2 1555 aa39.76■■■■□ 3.95
MIR3648-2-201ENST00000581792 ERVK-7P63135 1459 aa39.75■■■■□ 3.95
MIR3648-2-201ENST00000581792 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
MIR3648-2-201ENST00000581792 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
MIR3648-2-201ENST00000581792 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.73■■■■□ 3.95
MIR3648-2-201ENST00000581792 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP39.73■■■■□ 3.95
MIR3648-2-201ENST00000581792 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
MIR3648-2-201ENST00000581792 ANKLE2Q86XL3 938 aa39.72■■■■□ 3.95
MIR3648-2-201ENST00000581792 DEPDC5O75140 1603 aa39.72■■■■□ 3.95
MIR3648-2-201ENST00000581792 IQSEC2Q5JU85 1478 aa39.7■■■■□ 3.95
MIR3648-2-201ENST00000581792 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa39.69■■■■□ 3.94
MIR3648-2-201ENST00000581792 ADGRL2O95490 1459 aa39.68■■■■□ 3.94
MIR3648-2-201ENST00000581792 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.67■■■■□ 3.94
MIR3648-2-201ENST00000581792 KANK1Q14678 1352 aa39.67■■■■□ 3.94
MIR3648-2-201ENST00000581792 MED14O60244 1454 aa39.57■■■■□ 3.93
MIR3648-2-201ENST00000581792 VWDEQ8N2E2 1590 aa39.57■■■■□ 3.92
MIR3648-2-201ENST00000581792 LMTK2Q8IWU2 1503 aa39.56■■■■□ 3.92
MIR3648-2-201ENST00000581792 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
MIR3648-2-201ENST00000581792 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.54■■■■□ 3.92
MIR3648-2-201ENST00000581792 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa39.52■■■■□ 3.92
MIR3648-2-201ENST00000581792 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
MIR3648-2-201ENST00000581792 IQGAP1P46940 1657 aa39.45■■■■□ 3.91
MIR3648-2-201ENST00000581792 CPS1P31327 1500 aa39.43■■■■□ 3.9
MIR3648-2-201ENST00000581792 UBAP1LF5GYI3 381 aa39.42■■■■□ 3.9
MIR3648-2-201ENST00000581792 EFCAB6Q5THR3 1501 aa39.41■■■■□ 3.9
MIR3648-2-201ENST00000581792 ROCK1Q13464 1354 aa39.4■■■■□ 3.9
MIR3648-2-201ENST00000581792 ARHGAP23Q9P227 1491 aa39.4■■■■□ 3.9
MIR3648-2-201ENST00000581792 PIK3C2BO00750 1634 aa39.4■■■■□ 3.9
MIR3648-2-201ENST00000581792 SLIT1O75093 1534 aa39.4■■■■□ 3.9
MIR3648-2-201ENST00000581792 LTKP29376 864 aa39.38■■■■□ 3.89
MIR3648-2-201ENST00000581792 IDI1Q13907 227 aa39.38■■■■□ 3.89
MIR3648-2-201ENST00000581792 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP39.37■■■■□ 3.89
MIR3648-2-201ENST00000581792 TXNDC2Q86VQ3 553 aa39.37■■■■□ 3.89
MIR3648-2-201ENST00000581792 NOS1P29475 1434 aa39.37■■■■□ 3.89
MIR3648-2-201ENST00000581792 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.36■■■■□ 3.89
MIR3648-2-201ENST00000581792 SYNMO15061 1565 aa39.34■■■■□ 3.89
MIR3648-2-201ENST00000581792 EID1Q9Y6B2 187 aa39.32■■■■□ 3.89
MIR3648-2-201ENST00000581792 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP39.32■■■■□ 3.88
MIR3648-2-201ENST00000581792 TMEM2Q9UHN6 1383 aa39.31■■■■□ 3.88
MIR3648-2-201ENST00000581792 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
MIR3648-2-201ENST00000581792 ITGAEP38570 1179 aa39.3■■■■□ 3.88
MIR3648-2-201ENST00000581792 SLC52A1Q9NWF4 448 aa39.29■■■■□ 3.88
MIR3648-2-201ENST00000581792 UNC13BO14795 1591 aa39.28■■■■□ 3.88
MIR3648-2-201ENST00000581792 TET3O43151 1660 aa39.27■■■■□ 3.88
MIR3648-2-201ENST00000581792 STRCP1A6NGW2 1772 aa39.23■■■■□ 3.87
MIR3648-2-201ENST00000581792 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.2■■■■□ 3.87
MIR3648-2-201ENST00000581792 TOM1O60784 492 aa39.2■■■■□ 3.87
MIR3648-2-201ENST00000581792 ADGRB3O60242 1522 aa39.18■■■■□ 3.86
MIR3648-2-201ENST00000581792 LRRC7Q96NW7 1537 aa39.15■■■■□ 3.86
MIR3648-2-201ENST00000581792 IQGAP3Q86VI3 1631 aa39.13■■■■□ 3.85
MIR3648-2-201ENST00000581792 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.13■■■■□ 3.85
MIR3648-2-201ENST00000581792 NUP155O75694 1391 aa39.12■■■■□ 3.85
MIR3648-2-201ENST00000581792 PIP4K2BP78356 416 aa39.11■■■■□ 3.85
MIR3648-2-201ENST00000581792 E9PCH4 1651 aa39.1■■■■□ 3.85
MIR3648-2-201ENST00000581792 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP39.09■■■■□ 3.85
MIR3648-2-201ENST00000581792 DISP3Q9P2K9 1392 aa39.05■■■■□ 3.84
MIR3648-2-201ENST00000581792 MYO5BQ9ULV0 1848 aa39.04■■■■□ 3.84
MIR3648-2-201ENST00000581792 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.03■■■■□ 3.84
MIR3648-2-201ENST00000581792 ALKQ9UM73 1620 aa39.03■■■■□ 3.84
MIR3648-2-201ENST00000581792 SLC26A8Q96RN1 970 aa39.01■■■■□ 3.84
MIR3648-2-201ENST00000581792 ZFYVE9O95405 1425 aa38.99■■■■□ 3.83
MIR3648-2-201ENST00000581792 HSPA1LP34931 641 aa38.98■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.3 ms